الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: توقع تفاعل البروتينات
-
ملحق: تقسيم البيانات ضد تسرب المعلومات باستخدام DataSAIL Addendum: Data splitting against information leakage with DataSAIL
2026 | المؤلف: Roman Joeres وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)في هذا الملحق لمخطوطتنا المنشورة سابقًا، نقوم بتقييم أداة DataSAIL، التي تقوم بأتمتة تقسيم مجموعات البيانات لتعلم الآلة مع تقليل تسرب المعلومات بين مجموعات التدريب والتحقق والاختبار. يمتد تحليلنا إلى ما هو أبعد من المقارنة الأولية بين DataSAIL والأدوات الموجودة ليشمل مقارنة مع تقسيمات البيانات المحددة مسبقًا من عدة مجموعات بيانات مرجعية، مع التركيز بشكل…
-
نموذج متعدد الأوضاع قائم على الرسم البياني والسطح واللغة لتوقع تفاعل البروتينات Multimodal graph, surface, and language-based model for protein protein interaction prediction
2026 | المؤلف: David Arteaga وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث GSMFormer-PPI، وهو إطار عمل مبتكر متعدد الوسائط مصمم لتعزيز توقع تفاعلات البروتين-بروتين (PPIs) من خلال دمج ميزات سطح الجزيئات البروتينية، الرسوم البيانية الهيكلية ثلاثية الأبعاد، وتضمينات تسلسل مستوى البقايا. غالبًا ما تتجاهل الطرق التقليدية المعلومات السطحية الحيوية وتستخدم تقنيات دمج ميزات بسيطة، مما يمكن أن يعيق الأداء التنبؤي. بالمقابل، يستخدم GSMFormer-PPI التعلم العميق…
-
PLM-interact: توسيع نماذج لغة البروتين للتنبؤ بتفاعلات البروتين-بروتين PLM-interact: extending protein language models to predict protein-protein interactions
2026 | المؤلف: Zhenyun Du وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول قسم ورقة البحث التقدم في التنبؤات الحسابية لتفاعلات البروتين-بروتين (PPIs) باستخدام نماذج لغة البروتين (PLMs). بينما حققت نماذج PLMs دقة عالية في التنبؤ بهياكل البروتين من تسلسلات الأحماض الأمينية، لا يزال التنبؤ بتفاعلات PPIs يمثل تحديًا. يقدم المؤلفون نموذجًا جديدًا، PLM-interact، الذي يعزز من التنبؤ بتفاعلات PPIs من خلال ترميز أزواج البروتينات بشكل مشترك،…
-
أساليب قائمة على الهيكل لتوقع تفاعلات البروتين-بروتين باستخدام التعلم الآلي والتعلم العميق Structure-Based Approaches for Protein–Protein Interaction Prediction Using Machine Learning and Deep Learning
2026 | المؤلف: Despoina P. Kiouri وآخرون | المجلة: Biomolecules | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة شاملة على التقدم في توقع تفاعلات البروتين-بروتين (PPI)، مع التأكيد على تفوق الطرق المعتمدة على الهيكل مقارنة بالطرق التقليدية المعتمدة على التسلسل. من خلال الاستفادة من المعلومات الهيكلية ثلاثية الأبعاد، تعزز هذه الطرق دقة التوقعات وتساعد في تحديد المواقع الوظيفية، مثل بقايا الربط والتحفيز. على الرغم من مزاياها، لا تزال هناك…