الأبحاث في مجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)
-
اكتشاف قائم على الهيكل لمثبطات مجال Mac1 للبروتين غير الهيكلي-3 من SARS-CoV-2 من خلال فحص معزز بتعلم الآلة لمساحة المواد الكيميائية
2026 | المؤلف: Fuqiang Ban وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)في الأبحاث الأخيرة، تم التركيز بشكل كبير على تحديد مثبطات الجزيئات الصغيرة التي تستهدف ماكرودومين 1 (Mac1) من البروتين غير الهيكلي 3 (NSP3) كعوامل مضادة للفيروسات محتملة لـ SARS-CoV-2. تم اختيار Mac1 كهدف لتقييم التجارب لإيجاد الأهداف (CACHE) التحدي #3، حيث طورت فريقنا استراتيجية حسابية تصدرت بين 23 مشاركًا. أدت هذه الطريقة إلى اكتشاف سلسلة…
-
المحولات لتوقع خصائص الجزيئات: تحسين الأداء بكفاءة من خلال التكيف مع المجال
2026 | المؤلف: Afnan Sultan وآخرون | المجلة: Journal of Cheminformatics | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)في السنوات الأخيرة، أصبحت نماذج المحولات الجزيئية أدوات أساسية في اكتشاف الأدوية، حيث تم تدريبها مسبقًا على مجموعات بيانات واسعة مثل ZINC وChEMBL. تقيّم هذه الدراسة فعالية هذا التدريب المسبق في توقع خصائص الجزيئات وتحدد القيود في المنهجيات الحالية. تكشف النتائج أن زيادة حجم مجموعة بيانات التدريب المسبق إلى ما يتجاوز حوالي 400K-800K جزيء لا…
-
هندسة الأجسام المضادة المضادة للملاريا توسع أنماط التعرف وتكشف عن تفاعلات متماثلة جديدة تعزز من نطاق الحماية
2026 | المؤلف: J.M. Chun وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)لقد أظهر الجسم المضاد وحيد النسيلة L9 فعالية وقائية كبيرة ضد الملاريا لدى الأطفال لمدة تصل إلى ستة أشهر في أفريقيا، وذلك بشكل أساسي من خلال ارتباطه عالي الألفة بتكرارات NVDP الثانوية الثلاثة على بروتين السوروزويت الدائري للملاريا (PfCSP). كانت هذه الدراسة تهدف إلى تعزيز ألفة L9 لتوفير حماية أفضل ضد السلالات النادرة التي تتميز…
-
FLOWR: مطابقة التدفق لتوليد الجزيئات الجديدة القائمة على التفاعل والشظايا مع مراعاة الهيكل
2026 | المؤلف: Julian Cremer وآخرون | المجلة: Nature Computational Science | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)في هذا القسم، يحدد المؤلفون الإطار المنهجي الذي يدعم نهج مطابقة التدفق المستخدم في FLOWR. تستند المنهجية إلى التدفقات الطبيعية المستمرة (CNFs) التي يتم تدريبها من خلال مطابقة التدفق الشرطية (CFM)، مما يدمج أهداف الانحدار المستقرة المميزة لنماذج الانتشار مع عملية استدلال حتمية فعالة خالية من المحاكاة. يقوم المؤلفون بتنفيذ مطابقة التدفق للنقل الأمثل (OT-CFM)…
-
حل X-FFT مستقر ودقيق لمشاكل التجانس المرن الخطي في الأبعاد الثلاثة
2026 | المؤلف: Flavia Gehrig وآخرون | المجلة: International Journal for Numerical Methods in Engineering | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم البحث حلاً جديدًا قائمًا على تحويل فورييه ثلاثي الأبعاد، يُطلق عليه اسم حل X-FFT، والذي يدمج طريقة العناصر المحدودة الممتدة (X-FEM) لتحقيق دقة مطابقة للواجهة في مشاكل التجانس الحسابي ضمن المرونة الخطية. غالبًا ما تكافح طرق FFT التقليدية مع واجهات المواد غير المتوافقة مع الشبكة، مما يؤدي إلى تقليل الدقة. يعالج حل X-FFT هذا…
-
التعلم التبايني المدرك للهيكل مع تمثيلات ربط دقيقة لاكتشاف الأدوية
2026 | المؤلف: Jing Lan وآخرون | المجلة: ICASSP 2026 – 2026 IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP) | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم هذه الدراسة إطار عمل جديد قائم على التسلسل لتوقع تفاعل الأدوية مع الأهداف (DTI) الذي يدمج الأولويات الهيكلية في تمثيلات البروتين، مما يعزز قابلية التوسع في علم الأدوية الحاسوبي. يظهر النموذج أداءً متفوقًا على مجموعات بيانات Human وBioS-NAP ويظل تنافسيًا على BindingDB. في مهام الفحص الافتراضي، يتفوق بشكل كبير على الطرق السابقة في مجموعة…
-
IM-NSGAII: نهج جديد لتعزيز سرعة التقارب وتنوع السكان في تحسين الأهداف المتعددة
2026 | المؤلف: Wei Jiang وآخرون | المجلة: PLoS ONE | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم البحث نسخة محسنة من خوارزمية NSGAII، المسماة IM-NSGAII، تهدف إلى تعزيز كل من سرعة التقارب وتنوع السكان في الخوارزميات التطورية متعددة الأهداف. تحدد الدراسة أن NSGAII التقليدية تواجه صعوبة في الحفاظ على التنوع، خاصة عند التنقل عبر جبهات باريتو المعقدة. للتخفيف من ذلك، تتضمن IM-NSGAII تقنية تقييم السكان بعد الفرز غير المهيمن لتحسين اختيار…
-
صياغةDE: نظام ذكاء اصطناعي محدث لتوقع توافق الأدوية مع المواد المساعدة
2026 | المؤلف: Shuyi Jia وآخرون | المجلة: AAPS Open | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تناقش هذه الفقرة الدور الحاسم للمواد المساعدة في التركيبات الصيدلانية، مع تسليط الضوء على قدرتها على التفاعل مع المكونات النشطة الصيدلانية (APIs) في ظل ظروف معينة. بينما كانت تُعتبر تقليديًا غير نشطة، يمكن أن تؤثر المواد المساعدة على فعالية الدواء، وتغير ملفات الإفراج، وحتى تنتج نواتج سامة إذا لم يتم تحديد عدم التوافق وإدارته مبكرًا…
-
في السليكو ADMET: دعم اكتشاف الأدوية الجديدة
2026 | المؤلف: Sagar Agrawal وآخرون | المجلة: Future Health | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تناقش هذه القسم أهمية أدوات التنبؤ بـ ADMET (الامتصاص، التوزيع، الأيض، الإخراج، والسمية) في اكتشاف الأدوية، مع تسليط الضوء على دورها في تقليل الفشل السريري في المراحل المتأخرة، والذي يمثل حوالي نصف هذه الإخفاقات. تسهل هذه الطرق الحسابية، بما في ذلك المرشحات القائمة على القواعد، ونماذج العلاقة بين التركيب والنشاط الكمي (QSAR)، ومنصات الذكاء الاصطناعي…
-
تحسين فعال بمشاركة الإنسان عبر المعلومات السابقة المستفادة من نماذج المستخدمين
2026 | المؤلف: Yi-Chi Liao وآخرون | المجلة: Proceedings of the 2026 CHI Conference on Human Factors in Computing Systems | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)يقدم هذا القسم إطارًا جديدًا يسمى تحسين الإنسان في الحلقة مع معلومات نموذجية مسبقة (HOMI)، مصممًا لتعزيز كفاءة تحسين تصميم الواجهة من خلال دمج مرحلة تدريب مسبق باستخدام بيانات مستخدمين صناعية. غالبًا ما تتطلب طرق تحسين الإنسان في الحلقة التقليدية تكرارات واسعة بسبب المعلومات المسبقة المحدودة، مما يجعلها مكلفة وغير عملية. يتناول HOMI هذه التحديات…