الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: ديناميات البروتين
-
الاكتشاف والتوصيف عالي الإنتاجية لمعدلات السلفوناميد من البنتافلورو بنزين المعدلة لإنزيم Aurora A High-throughput discovery and characterisation of pentafluorobenzene sulfonamide modifiers of Aurora A kinase
2026 | المؤلف: Julian Chesti وآخرون | المجلة: RSC Chemical Biology | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)تقدم البحث سير عمل جديد “مباشر إلى البيولوجيا” يستخدم السلفونيلation كرد فعل موصل لتخليق مجموعات متنوعة من الشظايا التفاعلية، مما يعزز استكشاف وظيفة البروتين والفرص العلاجية. أدى هذا النهج إلى اكتشاف سلفوناميدات بنتافلورو بنزين التي تعدل بشكل فعال البروتينات الرئيسية، بما في ذلك كيناز أورا A، كيناز NEK7، وUbcH5B. ومن الجدير بالذكر أن الدراسة حددت…
-
التخزين الديناميكي لديناميات إعادة التهيئة في البروتينات غير المرتبة جوهريًا Dynamical Buffering of Reconfiguration Dynamics in Intrinsically Disordered Proteins
2026 | المؤلف: Miloš T. Ivanović وآخرون | المجلة: JACS Au | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة خصائص التوازن والديناميكية للبروتينات غير المرتبة intrinsically disordered proteins (IDPs) باستخدام تجارب نقل الطاقة الرنانة لفورستر (FRET) على مستوى الجزيء الواحد. تبرز أن، على الرغم من تنوع مجموعات التشكيل للبروتينات غير المرتبة، فإن وظائفها محددة جيدًا وتظهر اعتمادًا قويًا على التسلسل، لا سيما فيما يتعلق بدرجة الانضغاط لـ 16 منطقة غير مرتبة تحدث…
-
منطقة N-Myc MB0-MBI تتفاعل بشكل محدد وديناميكي مع الفص N من كيناز أورورا A The N-Myc MB0-MBI region interacts specifically and dynamically with the N-lobe of Aurora kinase A
2026 | المؤلف: Johanna Hultman وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تعتبر بروتينات MYC، وخاصة N-Myc، من المنظمين الرئيسيين لنمو الخلايا ووظيفتها، لكن عدم تنظيمها مرتبط بالسرطنة، خاصة في الأورام العصبية الصماء. تستخدم هذه الدراسة نهجًا متكاملًا في علم الأحياء الهيكلي لتوضيح الهيكل والديناميات لمجمع N-Myc-Aurora A، كاشفةً أن مواقع الربط المتعددة على N-Myc تتفاعل مع اللوب N لبروتين Aurora A. تسهل التفاعل تجمعات عطرية داخل…
-
P2DFlow: نموذج توليدي لمجموعة بروتينات مع مطابقة تدفق SE(3) P2DFlow: A Protein Ensemble Generative Model with SE(3) Flow Matching
2026 | المؤلف: Yaowei Jin وآخرون | المجلة: Journal of Chemical Theory and Computation | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، نقدم P2DFlow، نموذجًا توليديًا يستفيد من مطابقة تدفق SE(3) للتنبؤ بمجموعات البروتينات الشكلية، مع التأكيد على أن الوظائف البيولوجية تحكمها مجموعة من هياكل البروتينات بدلاً من شكل مستقر واحد. من خلال دمج أولوية متخصصة مستندة إلى توقعات ESMFold والاضطرابات، جنبًا إلى جنب مع آلية طاقة تقريبية، يلتقط P2DFlow بشكل فعال التقلبات الديناميكية…
-
تقلبات الحلقة العطرية تكشف عن إعادة تشكيل ديناميات البروتين في البلورات والمجمعات
2026 | المؤلف: Lea Marie Becker وآخرون | المجلة: Nature Chemistry | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه الفقرة تأثير بلورة البروتين على المناظر الطاقية التوافقية، مشددة على أن كل من التفاعلات الجزيئية الداخلية والعوامل البيئية تشكل هذه المناظر. بشكل محدد، تبحث الدراسة في كيفية تأثير الاتصالات الجزيئية في بلورات البروتين والمجمعات، مثل بروتين GB1 في مجمعه مع IgG، على ديناميات البروتين. باستخدام تقنيات وسم النظائر المتقدمة وطرق NMR الكمية، يكشف…
-
المجالات المطوية تفرض تباينًا هيكليًا وديناميات مخففة في المكثفات البيولوجية
2026 | المؤلف: Liguo Wang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تستكشف هذه الدراسة الهيكل الداخلي للتركيزات البيومولكولية التي تتكون من بروتينات متعددة المجالات (MDPs) مقارنة بتلك التي تتكون فقط من المناطق غير المنضبطة بشكل جوهري (IDRs) أو المجالات ذات التعقيد المنخفض (LCDs). باستخدام محاكاة الديناميكا الجزيئية، يكشف المؤلفون أنه بينما تظهر التركيزات التي تحتوي على IDR فقط أشكالًا موسعة بشكل موحد على مدى عشرات الميكروثواني،…
-
قياس الطيف الكتلي المرتبط بالبروتوليز المحدود يلتقط التغيرات الهيكلية للبروتينات على مستوى البروتيوم وتكثف الجزيئات الحيوية في الخلايا الحية
2026 | المؤلف: Franziska Elsässer وآخرون | المجلة: Molecular Systems Biology | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)في هذا القسم، يناقش المؤلفون تطوير التحليل الطيفي الكتلي المرتبط بالبروتوليز المحدود داخل الخلايا (LiP-MS) لدراسة هياكل البروتينات مباشرة داخل خلايا الإنسان الحية، متغلبين على قيود LiP-MS التقليدي الذي يتطلب تحلل الخلايا. تلتقط التقنية التغيرات الهيكلية الديناميكية في البروتينات بسبب التعديلات بعد الترجمة، والتفاعلات الجزيئية، والعوامل البيئية. من خلال تحسين إدخال بروتيناز K إلى الخلايا…