الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
المسار التطوري وخصائص فيروس Mpox في عام 2023 بناءً على مراقبة جينومية واسعة النطاق في شنتشن، الصين
2024 | المؤلف: Shengjie Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الفيروسات (Virology)لقد شهدت الجائحة العالمية المستمرة لفيروس Mpox (MPXV) تفشيًا ملحوظًا في مدينة شنتشن منذ يونيو 2023. تحلل هذه الدراسة المسار التطوري وخصائص MPXV من خلال فحص 92 تسلسلًا من تفشي شنتشن جنبًا إلى جنب مع الجينومات المتاحة من GISAID وGenBank. تشير التحليلات النشوء والتطور إلى أن MPXVs في شنتشن نشأت على الأرجح من مصادر متعددة،…
-
أصول التعقيد في ريوولوجيا معلقات الأرض اللينة
2024 | المؤلف: Shravan Pradeep وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الجريان وانتقال الموائع (Fluid Flow and Transfer Processes)في هذا القسم، يقوم المؤلفون بالتحقيق في تميع التربة المشبعة تحت ظروف مثل هطول الأمطار الغزيرة أو النشاط الزلزالي، مع التركيز على الانتقال من التعليق الحبيبي إلى سلوكيات شبيهة بالهلام في تدفقات الطين. يحددون أن آليات الفشل في المعلق الغني بالرمل مرتبطة بانتقال عدم التكتل، المتأثر بتركيز الجسيمات وضغط المسام، بينما تظهر تدفقات الطين خصائص…
-
الحويصلات الخلوية المستمدة من النباتات: تركيبة تآزرية لنظام توصيل الأدوية ومصدر للمركبات الحيوية النشطة الطبيعية
2024 | المؤلف: Mattia D. Langellotto وآخرون | المجلة: Drug Delivery and Translational Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تعتبر الإكسوزومات، وهي نانوفيزكل خارج الخلوية تفرزها جميع أنواع الخلايا، تلعب أدوارًا مهمة في عمليات فسيولوجية ومرضية متنوعة، بما في ذلك التواصل بين الخلايا ونقل المواد. بينما تم دراسة الإكسوزومات المشتقة من الثدييات بشكل مكثف لأغراض علاجية وتشخيصية، فقد حظيت الحويصلات خارج الخلوية المشتقة من النباتات (EVs) مؤخرًا باهتمام بسبب مزاياها، مثل الأمان المعزز، وقابلية…
-
الكالكوجيناسيون الانتقائي C3 والفلورة للبريدين باستخدام وسائط زينك الإيمينية الكلاسيكية
2024 | المؤلف: Shun Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: العلوم الصيدلانية (Pharmaceutical Science)إن الوظيفة الانتقائية C-H للبيريدينات، وخاصة في موضع C3، تواجه تحديات كبيرة بسبب نقص الإلكترون في هذه المركبات. تقدم هذه الدراسة نهجًا جديدًا للثيول والسلينيليشن والفلورين للبيريدينات باستخدام وسائط N-2،4-dinitrophenyl Zincke imine تحت ظروف معتدلة. يتم توضيح آلية الثيول والسلينيليشن كمسار إضافة-إزالة جذرية، بينما يحدث الفلورين عبر مسار استبدال إلكتروني ثنائي. وجود مجموعة N-DNP الفقيرة…
-
توقعات AlphaFold للأشكال المتغيرة مدفوعة بتذكر الهيكل
2024 | المؤلف: Devlina Chakravarty وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في القدرات التنبؤية لـ AlphaFold (AF)، وخاصة في سياق بروتينات تغيير الطي، التي يمكن أن تتبنى أشكال هيكلية متعددة. تكشف الدراسة أن AF هو متنبئ ضعيف لتغيير الطي، حيث حقق معدل نجاح يبلغ 35% فقط للبروتينات التي من المحتمل أن تكون مدرجة في مجموعات التدريب الخاصة به. ومن الجدير بالذكر أن نجاحات النموذج…
-
تعريف ديناميات المجتمع المهبلي: انتقالات الميكروبيوم اليومية، دور الحيض، الفيروسات البكتيرية، والجينات البكتيرية
2024 | المؤلف: Luisa W. Hugerth وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تدرس الدراسة التركيب الديناميكي للميكروبات المهبلية طوال الدورة الشهرية لدى 49 امرأة شابة صحية، باستخدام تسلسل الميتاجينوم من مسحات مهبلية يومية. قام الباحثون بتصنيف ديناميات الميكروبيوم المهبلي إلى أربعة أنواع متميزة من ديناميات المجتمع المهبلي (VCDs): متوازن ثابت، غير متوازن ثابت، مرتبط بالدورة الشهرية، وغير متوازن غير ثابت، باستخدام أداة تصنيف تُدعى VALODY. لوحظت اختلافات…
-
تحديد علامات خلايا T المستنفدة الجديدة CD8 + في سرطان الثدي
2024 | المؤلف: Hengrui Liu وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأورام (Oncology)تتناول هذه الدراسة التحدي الكبير الذي تمثله صحة العامة بسبب سرطان الثدي، مع التركيز بشكل خاص على دور خلايا المناعة في بيئة الورم الدقيقة. باستخدام مجموعات بيانات خلايا المناعة الفردية، حدد الباحثون مجموعات جينات العلامة لخلايا CD8+ T المستنفدة (CD8Tex) في سرطان الثدي. من خلال استخدام تقنيات التعلم الآلي، قاموا بتجميع الأنماط الفرعية وتطوير نماذج…
-
تحليل سريع وعميق للبروتينات الفوسفاتية باستخدام مطياف الكتلة Orbitrap Astral
2024 | المؤلف: Noah M. Lancaster وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تناقش هذه القسم أهمية فسفرة البروتينات في العمليات الخلوية والتحديات المرتبطة بالكشف عنها وقياسها. يقدم المؤلفون نهجًا جديدًا باستخدام مطياف الكتلة Orbitrap Astral، مع دمج اكتساب البيانات المستقل (DIA)، مما يسمح بتحليل سريع وشامل للفسفورومات في نماذج الإنسان والفأر. لقد نجحوا في رسم خريطة لحوالي 30,000 موقع فسفرة بروتيني فريد في غضون 30 دقيقة وكشفوا…
-
ببتيدات مشفرة بواسطة LncRNA في السرطان
2024 | المؤلف: Yaguang Zhang | المجلة: Journal of Hematology & Oncology | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)لقد انتقلت RNAs غير المشفرة الطويلة (lncRNAs) من كونها تُعتبر مجرد ضجيج نسخي إلى كونها منظمات معترف بها للتعبير الجيني، لا سيما في بيولوجيا السرطان. تشير الدراسات الحديثة إلى أن بعض lncRNAs يمكن أن تشفر ببتيدات مشتقة من إطارات قراءة مفتوحة صغيرة (sORF)، والتي تلعب أدوارًا مهمة في نشوء السرطان. يجمع هذا الاستعراض بين النتائج…
-
تعلم الآلة من طيف رامان يتنبأ بإطلاق الدواء من الطلاءات متعددة السكاريد للتوصيل المستهدف إلى القولون
2024 | المؤلف: Youssef Abdalla وآخرون | المجلة: Journal of Controlled Release | المجال: العلوم الصيدلانية (Pharmaceutical Science)تسلط الأبحاث الضوء على إمكانيات أنظمة توصيل الأدوية القولونية، مع التأكيد على مزاياها مثل الوصول المباشر إلى الأهداف العلاجية وتحسين توافر الدواء البيولوجي بسبب الخصائص الفريدة لظهارة القولون. غالبًا ما تكون الطرق التقليدية لتطوير هذه الأنظمة مستهلكة للوقت ومنخفضة الإنتاجية، خاصة في تحديد المواد المتعددة السكاريد المناسبة لاستهداف القولون. تقدم هذه الدراسة نهجًا جديدًا يستخدم…