الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
الكشف في الوقت الحقيقي عن 20 حمض أميني وتمييز الببتيدات ذات الصلة المرضية باستخدام مسام نانوية مفعلة
2024 | المؤلف: Ming Zhang وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: الهندسة الطبية الحيوية (Biomedical Engineering)تقدم هذه الدراسة نهجًا جديدًا للتحديد الدقيق والكمية لجميع الأحماض الأمينية البروتينية العشرين باستخدام مسام نانوية من Mycobacterium smegmatis مفعلة بالنحاس (II) مع استبدال N91H. هذه الطريقة، عند دمجها مع خوارزمية تعلم الآلة، تحقق دقة تحقق تبلغ 99.1% ومعدل استرداد إشارة يبلغ 30.9%. يظهر النظام القدرة على الكمية الفائقة الحساسية للأحماض الأمينية على مستوى النانومول…
-
تحسين الكشف عن الطفرات الناتجة عن الكوليبكتين بواسطة الإشريكية القولونية الجينية في الأعضاء العضوية وسرطان القولون والمستقيم
2024 | المؤلف: Axel Rosendahl Huber وآخرون | المجلة: Cancer Cell | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)في هذه الدراسة، أظهرت الثقافة المشتركة للأعضاء المعوية مع سلالة *E. coli* المنتجة للكوليباكتين (EcC) وجود توقيعات طفرية مرتبطة بسرطان القولون والمستقيم (CRC). ومن الملاحظ أن *E. coli* Nissle 1917 (EcN)، وهو بروبيوتيك مستخدم على نطاق واسع، وُجد أنه يحتوي على عملية pks ويؤدي إلى كسر في خيوط الحمض النووي المزدوجة، مما يثير القلق بشأن…
-
بصمة ميكروبية معوية لحجب نقاط التفتيش المناعية المركبة عبر أنواع السرطان
2024 | المؤلف: Ashray Gunjur وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في العقد الماضي، شهد مجال المناعة والعلاج المناعي تقدمًا كبيرًا، ويرجع ذلك أساسًا إلى الاعتماد الواسع على علاجات حجب نقاط التفتيش المناعية (ICB). تستهدف هذه العوامل بشكل محدد بروتين اللمفاويات التائية السامة 4 (CTLA-4) وبروتين موت الخلايا المبرمج 1 (PD-1)، بالإضافة إلى ligand الخاص به، ligand موت الخلايا المبرمج 1 (PD-L1). ومن الجدير بالذكر أن…
-
تقنيات تسلسل الحمض النووي عبر المسام وتطبيقاتها في بروتيوميات الجزيئات الفردية
2024 | المؤلف: Adam Dorey وآخرون | المجلة: Nature Chemistry | المجال: الهندسة الطبية الحيوية (Biomedical Engineering)تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدم في تسلسل الأحماض النووية باستخدام تقنية النانوثقب، مع تسليط الضوء على مزاياها مثل سرعة القراءة العالية، الدقة العالية، التكلفة المنخفضة، وقابلية النقل. تتيح هذه الطريقة الخالية من العلامات تسلسل الجزيئات الفردية، مما يمثل إنجازًا كبيرًا في هذا المجال. علاوة على ذلك، يتم مناقشة إمكانيات النانوثقوب لتسلسل البوليببتيدات، مع…
-
ترميز عالي الإنتاجية للجزيئات النانوية يحدد مواد شبيهة بالدهون قابلة للتحلل لنقل mRNA إلى الرئتين في نماذج إناث قبل السريرية
2024 | المؤلف: Lulu Xue وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تظهر الجسيمات النانوية الدهنية (LNPs) كأنظمة توصيل حيوية لعلاجات mRNA، خاصة في علاج الأمراض المرتبطة بالرئة. ومع ذلك، لا يزال هناك تحدٍ كبير في تقييم ملفات توصيل الرئة بشكل فعال لمكتبات الدهون المتنوعة. تقدم هذه الدراسة نظام فحص عالي الإنتاجية مع باركود مصمم لتقييم فعالية استهداف الرئة لـ 180 دهنًا كاتيونيًا قابلًا للتحلل تم تصنيعه.…
-
المشهد المناعي المرضي لنقص TCRα البشري: من المتغيرات النادرة إلى الشائعة
2024 | المؤلف: Marie Materna وآخرون | المجلة: Science | المجال: علم المناعة (Immunology)القسم المعنون “نظرة عامة” يقدم الورقة البحثية التي تركز على الآثار المناعية المرضية لنقص TCRα البشري، مسلطًا الضوء على الانتقال من المتغيرات الجينية النادرة إلى الشائعة المرتبطة بهذه الحالة. يهدف المؤلفون إلى توضيح الآليات الأساسية والتجليات السريرية لنقص TCRα، وهو أمر حاسم لتطوير خلايا T ووظيفة المناعة. تؤكد الدراسة على أهمية فهم كل من المتغيرات…
-
تدخلات النسخ الجيني والبروتينات والتمثيل الغذائي تعزز تحسين المحاصيل ضد سمية المعادن
2024 | المؤلف: Ali Raza وآخرون | المجلة: Plant Cell Reports | المجال: الكيمياء التحليلية (Analytical Chemistry)إن الزيادة في انتشار سمية المعادن (أو المعادن الشبيهة) في النظم البيئية الزراعية، المدفوعة بتغير المناخ والأنشطة البشرية، تشكل مخاطر كبيرة على إنتاجية المحاصيل والأمن الغذائي العالمي. إن تلوث التربة لا يهدد سلامة الغذاء من خلال الإمدادات الملوثة فحسب، بل يساهم أيضًا في قضايا بيئية أوسع، بما في ذلك تلوث التربة والمياه. استجابةً لذلك، طورت…
-
المؤشرات العصبية والآليات الجزيئية للذاكرة والتعلم
2024 | المؤلف: Simone Battaglia وآخرون | المجلة: International Journal of Molecular Sciences | المجال: علم الأعصاب الإدراكي (Cognitive Neuroscience)تؤكد هذه القسم على أهمية البحث قبل السريري والطب الحسابي في توضيح الأسس العصبية الحيوية للوظائف الإدراكية والاضطرابات. من خلال محاكاة الآليات الإدراكية، تسهل هذه الأساليب استكشاف التفاعلات المعقدة بين الوراثة والبيئة وعلم الأدوية والأمراض المصاحبة. تعزز النتائج ال في هذه القضية الخاصة فهمنا للآليات المرضية المرتبطة بالحالات الطبيعية والمرضية، وتدعم تقييم العلاجات المحتملة، وتوفر…
-
ترجمة البروتين: العمليات البيولوجية والاستراتيجيات العلاجية للأمراض البشرية
2024 | المؤلف: Xuechao Jia وآخرون | المجلة: Signal Transduction and Targeted Therapy | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط المراجعة الضوء على الدور الحاسم لترجمة البروتين في التعبير الجيني وعدم تنظيمها كعامل مهم في مسببات الأمراض لمجموعة متنوعة من الأمراض البشرية، بما في ذلك الاضطرابات العصبية التنكسية، السرطان، الأمراض المعدية، وأمراض القلب والأوعية الدموية. تناقش المراجعة الآليات الكامنة وراء عدم تنظيم الترجمة، مثل التغيرات في عوامل الترجمة، tRNA، mRNA، ووظيفة الريبوسوم، والتي يمكن…
-
توفر تضمينات لغة الكودون إشارات قوية للاستخدام في هندسة البروتين
2024 | المؤلف: Carlos Outeiral وآخرون | المجلة: Nature Machine Intelligence | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على فعالية تمثيلات البروتين المستمدة من نماذج اللغة العميقة في هندسة البروتين الحسابية، مع التأكيد على التحول من الأساليب التقليدية التي تعطي الأولوية لعدد المعلمات. يقترح المؤلفون تدريب نماذج اللغة الكبيرة على الكودونات بدلاً من تسلسلات الأحماض الأمينية، موضحين أن هذه الطريقة تنتج تمثيلات متفوقة. تشير نتائجهم إلى أن النماذج المعتمدة على…