الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الجينوميات اللاجينية
-
TRAPT: إطار عمل عميق متعدد المراحل للتعلم المدمج لتوقع المنظمات النسخية استنادًا إلى بيانات الإبيجينوم الواسعة النطاق
2025 | المؤلف: Guorui Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)إن تحديد المنظمين النسخيين التنظيميين (TRs) أمر حاسم لفهم التعبير الجيني في سياق ظهور الأمراض وتقدمها. تقدم هذه الدراسة أداة توقع نشاط المنظم النسخي (TRAPT)، وهي إطار تعلم عميق متعدد الوسائط مصمم لاستنتاج نشاط TR من خلال دمج الإمكانيات التنظيمية لعناصر التنظيم الجيني المستهدفة ومواقع الربط على مستوى الجينوم. تظهر النتائج التجريبية من 570 مجموعة…
-
تسلسل القراءة الطويل يعزز اكتشاف التغيرات المرضية والجديدة في المرضى الذين يعانون من أمراض نادرة
2025 | المؤلف: Shruti Sinha وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الوراثة (Genetics)يستعرض قسم “الطرق” الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يوضح اختيار المشاركين، بما في ذلك معايير الإدراج والاستبعاد، بالإضافة إلى حسابات حجم العينة لضمان القوة الإحصائية. استخدمت الدراسة تصميم تجربة عشوائية محكومة، حيث تم توزيع المشاركين على مجموعة العلاج أو مجموعة التحكم. شملت جمع البيانات تقييمات وقياسات موحدة، تم إجراؤها في البداية وفي فترات المتابعة.…
-
تعديلات الهيستون على مستوى الخلية الواحدة لتتبع سلالة الأجنة
2025 | المؤلف: Min Liu وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، تبحث الدراسة في آثار ثلاثة أنواع محددة من RNA المتداخل الصغير (siRNAs) تستهدف جينات معينة، باستخدام تركيز إجمالي قدره 20 ميكرومتر لكل مجموعة علاج. تم استخدام siRNA غير المستهدف (NC) أيضًا بنفس التركيز ليكون بمثابة مقارنة أساسية. التسلسل المحدد لـ siRNA غير المستهدف هو UGGGACUUGCAGGCCUGAUAUTT، بينما الجين المستهدف في هذا السياق هو…
-
تحليل تكاملي يكشف عن ارتباطات بين اختلال ميكروبيوتا الفم والتشوهات الجينية والوراثية المضاعفة في سرطان الخلايا الحرشفية في تجويف الفم
2024 | المؤلف: Liuyang Cai وآخرون | المجلة: npj Biofilms and Microbiomes | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تدرس هذه الدراسة العلاقة بين اختلال التوازن في الميكروبات الفموية وسرطان الخلايا الحرشفية في تجويف الفم (OSCC)، مع التركيز على التفاعلات بين البكتيريا المسببة للأمراض والتغيرات الجينية والوراثية المضيفة. قام الباحثون بتوصيف مجتمع البكتيريا المخاطية، والتعبير الجيني على مستوى الجينوم المضيف، وميثيلين DNA CpG في كل من الأنسجة الورمية والأنسجة الطبيعية المجاورة من مرضى OSCC.…