الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الجينوميات اللاجينية
-
TRAPT: إطار عمل عميق متعدد المراحل للتعلم المدمج لتوقع المنظمات النسخية استنادًا إلى بيانات الإبيجينوم الواسعة النطاق
TRAPT: a multi-stage fused deep learning framework for predicting transcriptional regulators based on large-scale epigenomic data2025 | المؤلف: Guorui Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)إن تحديد المنظمين النسخيين التنظيميين (TRs) أمر حاسم لفهم التعبير الجيني في سياق ظهور الأمراض وتقدمها. تقدم هذه الدراسة أداة توقع نشاط المنظم النسخي (TRAPT)، وهي إطار تعلم عميق متعدد الوسائط مصمم لاستنتاج نشاط TR من خلال دمج الإمكانيات التنظيمية لعناصر التنظيم الجيني المستهدفة ومواقع الربط على مستوى الجينوم. تظهر النتائج التجريبية من 570 مجموعة…
-
تحليل تكاملي يكشف عن ارتباطات بين اختلال ميكروبيوتا الفم والتشوهات الجينية والوراثية المضاعفة في سرطان الخلايا الحرشفية في تجويف الفم
Integrative analysis reveals associations between oral microbiota dysbiosis and host genetic and epigenetic aberrations in oral cavity squamous cell carcinoma2024 | المؤلف: Liuyang Cai وآخرون | المجلة: npj Biofilms and Microbiomes | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تدرس هذه الدراسة العلاقة بين اختلال التوازن في الميكروبات الفموية وسرطان الخلايا الحرشفية في تجويف الفم (OSCC)، مع التركيز على التفاعلات بين البكتيريا المسببة للأمراض والتغيرات الجينية والوراثية المضيفة. قام الباحثون بتوصيف مجتمع البكتيريا المخاطية، والتعبير الجيني على مستوى الجينوم المضيف، وميثيلين DNA CpG في كل من الأنسجة الورمية والأنسجة الطبيعية المجاورة من مرضى OSCC.…