الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: في السليكو
-
تصميم محدد تسلسل الهدف لربط الببتيدات باستخدام نمذجة اللغة المقنعة
2025 | المؤلف: Tianlai Chen وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأورام (Oncology)يتناول القسم تطوير PepMLM، وهو أداة حسابية مصممة لإنشاء روابط ببتيدية خطية جديدة تستهدف البروتينات التي تعتبر تقليديًا “غير قابلة للعلاج”. يستخدم PepMLM استراتيجية تغطية تدمج تسلسلات الببتيد المتوافقة عند الطرف C من تسلسلات البروتين المستهدفة، مما يسمح له بتحسين نموذج لغة البروتين ESM-2. تمكن هذه الطريقة من إعادة بناء مناطق الروابط ذات درجات تعقيد…
-
إثبات مفهوم المبدأ لتحليل والتنبؤ الوظيفي للمتغيرات الجينية النادرة في جيني CYP2C19 وCYP2D6
2025 | المؤلف: Inger Johansson وآخرون | المجلة: Human Genomics | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تبحث الدراسة في تأثير المتغيرات الجينية النادرة في الجينات الدوائية، وبشكل خاص CYP2C19 و CYP2D6، على تباين استجابة الأدوية، والذي يُقدّر أنه يمثل 4-6% من الفروق بين الأفراد. باستخدام دراسات التعبير عن الإنزيمات في المختبر وتحليلات الهيكل-الوظيفة الحاسوبية، ركزت الدراسة على 11 متغيرًا نادرًا تم تحديده في بنك الأنسجة الإستوني. تم التعبير عن المتغيرات في…
-
رؤى جزيئية حول مثبطات الأغشية الحيوية لإنزيمات الغلوكوزيل ترانسفيراز من ستربتوكوكوس موتانس من خلال أساليب الحوسبة
2025 | المؤلف: Lubna Atta وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تركز هذه الفقرة من البحث على دور *Streptococcus mutans* وناقلات الجلوكوز (GTFs) في تطور تسوس الأسنان، وهو مرض مزمن شائع. تؤكد الدراسة على إمكانية استهداف GTFs لمنع تشكيل الأغشية الحيوية، وهو أمر حاسم لمرضية هذه البكتيريا. باستخدام طرق حسابية مثل نظرية الكثافة الوظيفية، والربط الجزيئي، ومحاكاة الديناميات الجزيئية، قام المؤلفون بالتحقيق في تفاعلات الربط لمثبطات…
-
تحديد إنزيمات RING E3 الزائفة في عائلة بروتينات TRIM
2025 | المؤلف: Jane Dudley-Fraser وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المناعة (Immunology)تُعرف بروتينات عائلة TRIpartite Motif (TRIM) بوظائفها الخلوية المتنوعة، والتي تُعزى بشكل أساسي إلى نشاطها كليز E3 يوبكويتين الذي يسهل بواسطة مجال RING. ومع ذلك، تشير النتائج الحديثة إلى أن بعض بروتينات TRIM لا تظهر أي نشاط يوبكويتين قابل للاكتشاف على الرغم من امتلاكها لمجال RING. تستخدم هذه الدراسة تحليلات متوازية في الخلايا، وفي المختبر،…
-
تأثيرات التثبيط لبعض مشتقات الأنثراكينون الفينولية على نشاط لاكتوبيروكسيداز: دراسة مفصلة في المختبر وفي السليكو
2025 | المؤلف: Işıl Nihan Korkmaz وآخرون | المجلة: Food Biophysics | المجال: علم السموم (Toxicology)تدرس هذه الدراسة التأثيرات المثبطة لمشتقات الأنثراكوينون على اللاكتوبيروكسيداز (LPO)، وهو إنزيم حيوي لنظام الدفاع الطبيعي في حديثي الولادة، ويُوجد بشكل خاص في حليب الأبقار. تسلط الأبحاث الضوء على الطبيعة المزدوجة للحليب كمصدر غذائي حيوي وناقل محتمل للسموم البيئية، بما في ذلك الأنثراكوينونات، التي تُستخدم على نطاق واسع في مختلف الصناعات. من خلال دراسات تثبيط…
-
محاكاة الديناميات الجزيئية للبروتين-الليغاند (PL-MDS)، وتحليلات ADMET، ودراسات النشاط الحيوي للمواد الكيميائية النباتية من الألوة فيرا: جهد اكتشاف أدوية جديدة مضادة للسكري باستخدام الحاسوب
2025 | المؤلف: Babatunde Temitope Ogunyemi وآخرون | المجلة: Discover Chemistry. | المجال: علوم النبات (Plant Science)تتناول الأبحاث القضية الصحية العالمية الملحة لمرض السكري، مع تسليط الضوء على الزيادة المتزايدة في الانتشار والقيود المفروضة على العلاجات الحالية. لتحديد عوامل مضادة للسكري جديدة، تستخدم الدراسة نهج تصميم الأدوية المعتمد على الكمبيوتر (CADD)، وتحديداً ربط الجزيئات، لتقييم القدرة المثبطة لـ 103 مركب نباتي معزول من الألوة فيرا ضد مستقبل الألفا-أميلاز (PDB ID: 3BAJ).…
-
تصميم حاسوبي لبناء لقاح متعدد الإبيتوبي يستهدف بروتين السنبلة لفيروس SARS-CoV-2 ويثير استجابات مناعية قوية في السليكو
2025 | المؤلف: Varughese Deepthi وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تركز الأبحاث على تطوير بناء لقاح متعدد الإبيتوبي (MEVC) يستهدف بروتين S لفيروس SARS-CoV-2 لمعالجة التحديات التي تطرحها المتغيرات الناشئة. من خلال الفحص الحسابي الشامل، تحدد الدراسة مجموعة من الإبيتوبيات، بما في ذلك الإبيتوبيات الخطية وغير الخطية لبروتينات B، بالإضافة إلى إبيتوبيات CD8+ و CD4+ T-cell، محققة تغطية تصل إلى 90.03% من السكان العالميين. تم…
-
تحديد في السيليكو لمركبات جديدة تستهدف بروتين FKBP5 البشري المرتبط بالتوتر في الاضطرابات النفسية
2025 | المؤلف: Ovinuchi Ejiohuo وآخرون | المجلة: PLoS ONE | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تبحث الدراسة في تفاعلات مختلف الروابط مع بروتين FK506 المرتبط بـ 51 (FKBP51 أو FKBP5)، وهو منظم رئيسي للتوتر مرتبط بالاضطرابات النفسية. تستخدم الدراسة تقنية الربط الجزيئي لتقييم الروابط مثل الراباميسين، التاكروليموس، والكركم، حيث تم تحديد الروسوجينين والنيوروسوجينين كأفضل المرشحين بسبب قدرتهم على عبور حاجز الدماغ والدم وإظهار امتصاص معوي عالي. تصنف توقعات السمية هذه…
-
فتح الإمكانيات العلاجية للمركبات النباتية غير المستكشفة كعوامل واقية للكبد من خلال دمج علم الأدوية الشبكي والتحليل الحاسوبي
2025 | المؤلف: Pranali Jadhav وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تسلط هذه الدراسة الضوء على الحاجة الملحة لاستراتيجيات وقائية وعلاجية مبتكرة في أمراض الكبد، التي تمثل أكثر من مليوني وفاة سنويًا. تجمع الدراسة بين تقنيات الحوسبة المتقدمة والمعرفة التقليدية بالأعشاب لتحديد المركبات المحتملة الواقية للكبد. من خلال استخدام علم الأدوية الشبكي لتحديد أهداف البروتين المرتبطة باضطرابات الكبد واختيار المركبات النباتية بناءً على تنوعها الجزيئي، أجرت…
-
الأساليب المتكاملة في المختبر، والمحاكاة، وفي الكائنات الحية لتوضيح الآليات المضادة للسكري لاستخراج الحمص وجراثيم الشعير الثانوية
2025 | المؤلف: Asif Shahzad وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علوم النبات (Plant Science)تبحث الدراسة في الإمكانات المضادة للسكري لـ *Cicer arietinum* (الحمص) و *Hordeum vulgare* (الشعير)، مع التركيز على محتواهما من المركبات الكيميائية النباتية وتأثيراتهما العلاجية. تستخدم الدراسة مجموعة من المنهجيات في المختبر، وفي الحاسوب، وفي الجسم الحي لتقييم فعالية هذه المستخلصات النباتية. تشير النتائج إلى أن كلا من *C. arietinum* (IC50 55.08 ميكروغرام/مل) و *H. vulgare*…