الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: محاكاة ربط الجزيئات
-
RNAmigos2: الفحص الافتراضي المعتمد على الهيكل المتسارع للـ RNA باستخدام التعلم العميق للرسوم البيانية
2025 | المؤلف: Juan G. Carvajal-Patiño وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “طرق” في ورقة البحث يوضح تصميم التجربة والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من المشاركين. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، واستطلاعات، ودراسات رصدية، مما يضمن تقييمًا شاملاً للمتغيرات ذات الاهتمام. تم تحليل البيانات باستخدام برامج إحصائية مناسبة، مع تحديد مستويات الدلالة…
-
تصميم حاسوبي لبناء لقاح متعدد الإبيتوبي يستهدف بروتين السنبلة لفيروس SARS-CoV-2 ويثير استجابات مناعية قوية في السليكو
2025 | المؤلف: Varughese Deepthi وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تركز الأبحاث على تطوير بناء لقاح متعدد الإبيتوبي (MEVC) يستهدف بروتين S لفيروس SARS-CoV-2 لمعالجة التحديات التي تطرحها المتغيرات الناشئة. من خلال الفحص الحسابي الشامل، تحدد الدراسة مجموعة من الإبيتوبيات، بما في ذلك الإبيتوبيات الخطية وغير الخطية لبروتينات B، بالإضافة إلى إبيتوبيات CD8+ و CD4+ T-cell، محققة تغطية تصل إلى 90.03% من السكان العالميين. تم…
-
تحديد في السيليكو لمركبات جديدة تستهدف بروتين FKBP5 البشري المرتبط بالتوتر في الاضطرابات النفسية
2025 | المؤلف: Ovinuchi Ejiohuo وآخرون | المجلة: PLoS ONE | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تبحث الدراسة في تفاعلات مختلف الروابط مع بروتين FK506 المرتبط بـ 51 (FKBP51 أو FKBP5)، وهو منظم رئيسي للتوتر مرتبط بالاضطرابات النفسية. تستخدم الدراسة تقنية الربط الجزيئي لتقييم الروابط مثل الراباميسين، التاكروليموس، والكركم، حيث تم تحديد الروسوجينين والنيوروسوجينين كأفضل المرشحين بسبب قدرتهم على عبور حاجز الدماغ والدم وإظهار امتصاص معوي عالي. تصنف توقعات السمية هذه…
-
التحليل الحاسوبي للببتيدات المضادة للميكروبات المستهدفة لمستقبلات رئيسية في الأمراض القلبية الوعائية المرتبطة بالعدوى: رؤى من الربط الجزيئي والديناميات
2025 | المؤلف: Doni Dermawan وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)يكشف التحليل الحسابي للببتيدات المضادة للميكروبات (AMPs) التي تستهدف مستقبلات رئيسية مرتبطة بأمراض القلب والأوعية الدموية المرتبطة بالعدوى (CVDs) عن نتائج مهمة تتعلق بقدراتها على الارتباط واستقرارها. أظهرت محاكاة التفاعل الجزيئي والديناميكي أن Tachystatin وThermolysin وPleurocidin وSubtilisin A أظهرت تفاعلات ملائمة مع مستقبلات مثل ACE2 وCRP وMMP9 وNLRP3 وTLR4، متفوقة على المثبط القياسي DX600. ومن…
-
فتح الإمكانيات العلاجية للمركبات النباتية غير المستكشفة كعوامل واقية للكبد من خلال دمج علم الأدوية الشبكي والتحليل الحاسوبي
2025 | المؤلف: Pranali Jadhav وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تسلط هذه الدراسة الضوء على الحاجة الملحة لاستراتيجيات وقائية وعلاجية مبتكرة في أمراض الكبد، التي تمثل أكثر من مليوني وفاة سنويًا. تجمع الدراسة بين تقنيات الحوسبة المتقدمة والمعرفة التقليدية بالأعشاب لتحديد المركبات المحتملة الواقية للكبد. من خلال استخدام علم الأدوية الشبكي لتحديد أهداف البروتين المرتبطة باضطرابات الكبد واختيار المركبات النباتية بناءً على تنوعها الجزيئي، أجرت…
-
الأساليب المتكاملة في المختبر، والمحاكاة، وفي الكائنات الحية لتوضيح الآليات المضادة للسكري لاستخراج الحمص وجراثيم الشعير الثانوية
2025 | المؤلف: Asif Shahzad وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علوم النبات (Plant Science)تبحث الدراسة في الإمكانات المضادة للسكري لـ *Cicer arietinum* (الحمص) و *Hordeum vulgare* (الشعير)، مع التركيز على محتواهما من المركبات الكيميائية النباتية وتأثيراتهما العلاجية. تستخدم الدراسة مجموعة من المنهجيات في المختبر، وفي الحاسوب، وفي الجسم الحي لتقييم فعالية هذه المستخلصات النباتية. تشير النتائج إلى أن كلا من *C. arietinum* (IC50 55.08 ميكروغرام/مل) و *H. vulgare*…
-
استكشاف في السيليكو لمشتقات الزانثون الطبيعية كمثبطات محتملة لتكاثر فيروس كورونا المسبب لمتلازمة التنفس الحاد الشديد 2 (SARS-CoV-2) ودخول الخلايا
2025 | المؤلف: Vincent A. Obakachi وآخرون | المجلة: Journal of Computer-Aided Molecular Design | المجال: علم السموم (Toxicology)لقد أبرزت جائحة COVID-19 ضرورة وجود علاجات مضادة للفيروسات فعالة، خاصة ضد المتغيرات المقاومة للقاحات الناشئة. تستكشف هذه الدراسة مشتقات الزانثون الطبيعية كعوامل مثبطة محتملة لمستقبل ACE2، الذي يسهل دخول SARS-CoV-2 إلى خلايا الإنسان. حدد تحليل حسابي لـ 91 مركب زانثون من *Swertia chirayita* مرشحين، XAN71 و XAN72، اللذان أظهرا تقارب ارتباط متفوق يبلغ -70.97…
-
التوصيف الدوائي الشامل وتحليل الربط الجزيئي للمركبات الطبيعية النشطة بيولوجيًا المستهدفة لمؤشرات الأورام في سرطان الثدي
2025 | المؤلف: Basim Othman وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)تدرس هذه الدراسة إمكانيات أربعة مركبات طبيعية—البربرين، الكركمين، الويذافيرين A، وحمض الإيلاجيك—كعوامل علاجية تستهدف علامات سرطان الثدي الرئيسية: بروتين اللمفومة B-2 (BCL-2)، ligand 1 المبرمج للموت (PDL-1)، كيناز الدورات المعتمدة على السيكلين 4/6 (CDK4/6)، ومستقبل عامل نمو الألياف (FGFR). هذه العلامات الحيوية حاسمة في تقدم الورم، استجابة المناعة، وتنظيم دورة الخلية. تستخدم الأبحاث ملف تعريف…
-
الصيدلة الشبكية والتحقق التجريبي للتحقيق في آلية الإيزوليكويريتجينين لعلاج مرض الزهايمر
2025 | المؤلف: Waimao Gao وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تدرس الدراسة الآليات الجزيئية التي من خلالها يمارس الإيزوليكويريتجينين (ISL)، وهو فلافون مشتق من العرقسوس، تأثيراته المضادة للالتهابات ومضادات الأكسدة في سياق مرض الزهايمر (AD). من خلال استخدام قواعد بيانات متنوعة، حدد الباحثون الأهداف المتداخلة بين مرض الزهايمر وISL، تلاها تحليل إثراء مسارات علم الأحياء الجزيئي (GO) وكيودو (KEGG). سلط تحليل شبكة التفاعل بين البروتينات…
-
توقع ملف ADMET والقدرة المضادة للالتهابات للكاموانغون
2025 | المؤلف: Sompot Jantarawong وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)يتناول القسم المعنون “نظرة عامة” النمذجة التنبؤية لملف ADMET (الامتصاص، التوزيع، الأيض، الإخراج، والسمية) والقدرة المضادة للالتهابات لمركب الشاموانغون، وهو مركب تم التحقيق فيه من قبل سومبوت جانتاراوونغ. تستخدم الدراسة طرق حسابية لتقييم الخصائص الدوائية والسلامة للشاموانغون، بهدف إثبات جدواه كعامل علاجي. تشير النتائج الرئيسية إلى أن الشاموانغون يظهر خصائص ADMET ملائمة، مما يشير إلى…
