الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: ميتاجينوميات
-
يمكن تعزيز إنتاجية فول الصويا من خلال فهم الميكروبيوتا في منطقة الجذور: أدلة من تحليل الميتاجينوم من نظم زراعية متنوعة
2025 | المؤلف: Hong Ren وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علوم النبات (Plant Science)تدرس هذه الدراسة المجتمعات الميكروبية في منطقة الجذور المرتبطة بمحاصيل فول الصويا عبر 13 موقعًا جغرافيًا متنوعًا في الصين، مع التأكيد على الدور المهم لهذه المجتمعات في نمو النباتات وصحتها. باستخدام تسلسل الميتاجينوم عالي الإنتاجية، حدد الباحثون 43,337 نوعًا ميكروبيًا، بما في ذلك البكتيريا والعتائق والفطريات والفيروسات. كشفت التحليلات عن تباينات كبيرة في تنوع المجتمعات…
-
ربط التهاب المحيط بالزرع بتغيرات الميكروبيوم في الزرعات المتأثرة، والزرعات الصحية، واللعاب: دراسة تجريبية مقطعية
2025 | المؤلف: Lucinda J. Bessa وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: جراحة الفم (Oral Surgery)تدرس الدراسة دور الميكروبيوم المحيط بالزرع في مسببات التهاب المحيط بالزرع (PI)، وهي حالة تهدد نجاح زراعة الأسنان. من خلال تحليل 100 عينة من اللعاب والبيوفيلم تحت اللثة من 40 مشاركًا – مقسمين إلى مجموعة الزرع الصحي (HI) ومجموعة PI التي تحتوي على زرعات صحية ومريضة – باستخدام تسلسل الميتاجينوم الشامل، حدد الباحثون الأنواع الميكروبية…
-
التحليل الميتاجينومي لعينات البشر والحيوانات والبيئة يكشف عن مسببات الأمراض الناشئة المحتملة، ويحدد جينات مقاومة المضادات الحيوية، ويكشف عن ديناميات نقل الجينات الأفقي
2025 | المؤلف: Rajindra Napit وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث ورقة البحث في انتشار وانتقال مقاومة المضادات الحيوية (AMR) في مستوطنة مؤقتة في كاتماندو، نيبال، مع التأكيد على ضرورة اتباع نهج الصحة الواحدة الذي يدمج صحة الإنسان والحيوان والبيئة. باستخدام الميتاجينوميات الشاملة، قامت الدراسة بتحليل عينات براز بشرية وطيور، بالإضافة إلى عينات بيئية، كاشفة عن شبكة معقدة من البكتيريا المسببة للأمراض، وعوامل الضراوة (VFs)،…
-
النمذجة الأيضية تكشف عن تراجع التفاعلات الأيضية المرتبطة بالشيخوخة بين المضيف والميكروبيوم في الفئران
2025 | المؤلف: Lena Best وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في التفاعل بين الشيخوخة والميكروبيوم المعوي، باستخدام الميتاجينوميات، والترانسكريبتوميات، والميتابولوميات من الفئران المسنّة جنبًا إلى جنب مع النمذجة الأيضية. تعيد الدراسة بناء نماذج أيضية متكاملة للميكروبات المضيفة والمعوية، كاشفة عن اعتماد معقد لعملية الأيض المضيف على كل من التفاعلات الميكروبية المعروفة والجديدة. من الجدير بالذكر أن الميكروبيوم المتقدم في السن يظهر انخفاضًا كبيرًا…
-
البكتيريا المنقولة عبر البذور تحفز تجميع الميكروبيوم الجذري للقمح من خلال تقسيم الفضاء البيئي والتيسير
2025 | المؤلف: Daniel Garrido‐Sanz وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علوم النبات (Plant Science)في هذه الدراسة، شمل التصميم التجريبي استخدام تربة ضخمة من مرج سويسري مجاور لحقل قمح لإنشاء ميكروكوزم للتحقيق في المجتمعات الميكروبية. حصل الباحثون على غسيل التربة، الذي احتوى على تعليق ميكروبي، واستخراج تربة معقم ومصفى لتوفير المغذيات الدقيقة القابلة للذوبان والجزيئات العضوية. تم إدخال هذه المكونات في أنابيب زجاجية معقمة مليئة بمصفوفة التربة (0.5-4 مم…
-
تحليل ميتاجينومي مقارن للميكروبيوم الفموي في مرضى COVID-19 والأفراد الأصحاء
2025 | المؤلف: Piyush Bhanu وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تبحث الدراسة في تأثير COVID-19، الناجم عن SARS-CoV-2، على الميكروبيوم الفموي، كاشفة عن تغييرات كبيرة في التنوع والتركيبة الميكروبية بين الأفراد المصابين مقارنةً بالضوابط الصحية. أظهرت تسلسلات الميتاجينوم تقليلاً في التنوع الميكروبي، يتميز بانخفاض التنوع ألفا وملفات تنوع بيتا مميزة، إلى جانب زيادة انتشار مسببات الأمراض الانتهازية. حدد تحليل الميكروبيوم الأساسي أنواعًا فريدة قد تكون…
-
تباين مستوى السلالة بين Lactobacillus crispatus وLactobacillus iners كما تم تحديده بواسطة الميتاجينوميات المقارنة
2025 | المؤلف: Sai Ravi Chandra Nori وآخرون | المجلة: npj Biofilms and Microbiomes | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تدرس الدراسة الميكروبيوم المهبلي للنساء الحوامل في أيرلندا، مع التركيز على نظامه البيئي ذو التنوع المنخفض الذي يهيمن عليه بشكل أساسي أنواع اللاكتوباسيلس، وخاصة اللاكتوباسيلس كريسباتوس واللاكتوباسيلس إينيرس. باستخدام تسلسل الشوتغن لتحليل 354 ميتاجينوم مهبلي، تحدد الأبحاث أنواعًا فرعية مختلفة وتؤكد على أهمية التباين على مستوى السلالة في فهم آليات الاستعمار وتفاعلات المضيف والميكروب. تشمل…
-
ميزات مميزة لميكروبيوم الأمعاء تميز عدوى فاسيولا هيباتيكا وتنبئ بنتائج علاج التريكلا بندازول لدى المرضى البيروفيين
2025 | المؤلف: Giljae Lee وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس هذه الدراسة العلاقة بين عدوى *Fasciola hepatica* والميكروبيوم المعوي، مع التركيز على تداعياتها على فعالية علاج التريكلا بندازول (TCBZ). باستخدام تسلسل الجينوم الميتاجينومي، قام الباحثون بتحليل عينات من 30 فردًا مصابًا و60 فردًا غير مصاب متطابقين في العمر والجنس في بيرو. تكشف النتائج أن أنواعًا ميكروبية معينة، مثل زيادة وفرة الأنواع من الأجناس *Negativibacillus*…
-
التحديات في التقاط الميكروبيوم الفطري من بيانات الميتاجينوم الشامل: نقص البرمجيات وقواعد البيانات
2025 | المؤلف: Ekaterina Avershina وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة الحالة الحالية لأدوات المعلوماتية الحيوية لتوصيف الميكروبيوم الفطري، وهو المكون الفطري للميكروبيوم المعوي، باستخدام بيانات ميتاجينومية محاكاة. قام المؤلفون بتقييم سبعة أدوات لتعيين التصنيف التسلسلي للفطريات، باستثناء أداة واحدة قديمة تتطلب تعديلات كبيرة. قاموا بإنشاء 18 مجتمعًا وهميًا بتنوع في غنى الأنواع ووفرتها، تضم ما يصل إلى 165 نوعًا من الفطريات من شُعبتي…
-
VITAP: أداة عالية الدقة لتصنيف الفيروسات DNA وRNA بناءً على بيانات ميتا-أوميكية
2025 | المؤلف: Kaiyang Zheng وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم البيئة (Ecology)تقدم هذه القسم خط أنابيب تصنيف الفيروسات (VITAP)، وهو أداة جديدة مصممة لتعزيز تصنيف تسلسلات الفيروسات من الحمض النووي والحمض النووي الريبي. يدمج VITAP طرق قائمة على المحاذاة مع نظرية الرسوم البيانية لتحقيق دقة عالية في التصنيف الضريبي، مقدماً مستويات ثقة لكل وحدة تصنيفية. يقوم بتحديث قاعدة بياناته تلقائياً بما يتماشى مع اللجنة الدولية لتصنيف…