تجمع الميتابولوميات مع الفسيولوجيا والترنسكريبتوميات للكشف عن تنظيم المسارات الأيضية الرئيسية للنيتروجين في البرسيم من خلال الرش الورقي مع نانو-سيلينيوم
Metabolomics combined with physiology and transcriptomics reveal the regulation of key nitrogen metabolic pathways in alfalfa by foliar spraying with nano-selenium

المجلة: Journal of Nanobiotechnology، المجلد: 23، العدد: 1
DOI: https://doi.org/10.1186/s12951-024-03073-4
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39755664
تاريخ النشر: 2025-01-05
المؤلف: Pengbo Sun وآخرون
الموضوع الرئيسي: السيلينيوم في الأنظمة البيولوجية

نظرة عامة

تدرس هذه الدراسة آثار النانو سيلينيوم على استقلاب النيتروجين والجودة الغذائية في البرسيم، باستخدام طريقة وسم 15N جنبًا إلى جنب مع تحليل متعدد الأوميات. تشير النتائج إلى أن النانو سيلينيوم يعزز استقلاب النيتروجين في النباتات والتمثيل الضوئي من خلال تحسين التقاط الطاقة الضوئية وزيادة نشاط إنزيمات استقلاب النيتروجين الرئيسية، وخاصة مختزل النترات (NR)، مختزل النيتريت (Nir)، سينثاز الجلوتامين (GS)، وسينثاز الجلوتامات (GOGAT). يؤدي هذا التعزيز إلى زيادة تراكم النيتروجين ومحتوى المادة الجافة في البرسيم.

تكشف التحليلات النسخية والتمثيلية أن النانو سيلينيوم يؤثر بشكل أساسي على عدة مسارات استقلابية، بما في ذلك “تخليق الأحماض الأمينية”، “استقلاب النشا والسكروز”، “تحويلات البنتوز والجلوكورونات”، “مسار فوسفات البنتوز”، و”تخليق الفلافونويد”. ينظم العلاج المبكر بالنانو سيلينيوم التعبير عن الجينات المرتبطة بهذه المسارات، مما يؤدي إلى زيادة مستويات المركبات المفيدة مثل حمض L-جلوتاميك، L-هيستيدين، جليسرون-P، كونيفيرين، ونارينجين شالكون. ومع ذلك، تتناقص آثار النانو سيلينيوم مع مرور الوقت. بشكل عام، توفر هذه الأبحاث رؤى قيمة حول الآليات الجزيئية التي من خلالها يعدل النانو سيلينيوم المسارات الأيضية الرئيسية في البرسيم، مما يسهم في الإنتاج الآمن والفعال لمحاصيل غنية بالسيلينيوم.

مقدمة

تسلط المقدمة الضوء على أهمية السيلينيوم كعنصر تتبع أساسي لصحة الإنسان والحيوان، وخاصة دوره في السيلينوبروتينات مثل بيروكسيداز الجلوتاثيون، التي تساهم في الدفاعات المضادة للأكسدة وقد تقلل من خطر الأمراض مثل الحالات القلبية الوعائية والسرطان. تقليديًا، تم استخدام أشكال السيلينيوم غير العضوية مثل السيلينات والسيلينيت للتغذية الحيوية، لكن نطاق الجرعة الآمنة الضيق لها دفع إلى استكشاف جزيئات السيلينيوم النانوية (النانو سيلينيوم) كبديل أكثر فعالية. يتميز النانو سيلينيوم بحجم جزيئي صغير (0-100 نانومتر) وخصائص فريدة، مما يوفر مزايا تشمل التوافر البيولوجي العالي، والاستقرار، وانخفاض السمية، وزيادة القدرة على التقاط الجذور الحرة، مما يجعله عنصرًا محوريًا في الزراعة الدقيقة.

تناقش الورقة بشكل خاص دور النانو سيلينيوم في تعزيز العائد والجودة الغذائية للبرسيم (Medicago sativa L.)، وهو محصول علفي مزروع على نطاق واسع. بينما ركزت الدراسات السابقة بشكل أساسي على السيلينيوم غير العضوي، تهدف المؤلفون إلى التحقيق في الآليات الجزيئية التي من خلالها يؤثر النانو سيلينيوم على استقلاب النيتروجين في البرسيم. باستخدام وسم نظائر النيتروجين الفسيولوجية، وتسلسل RNA-Seq، والتمثيل غير المستهدف، ستقوم الدراسة بتحليل التغيرات الفسيولوجية وتحديد الجينات المعبر عنها بشكل مختلف (DEGs) والمستقلبات (DAMs) استجابةً لعلاج النانو سيلينيوم. تسعى هذه الأبحاث إلى توضيح الآليات الجزيئية التي تكمن وراء التأثيرات التنظيمية للنانو سيلينيوم على استقلاب النيتروجين، مما يوفر أساسًا نظريًا لتطبيقه في الزراعة.

طرق

في هذه الدراسة، بحث المؤلفون في آثار جزيئات السيلينيوم النانوية (NPs-Se) على نمو البرسيم (Medicago sativa) واستقلاب النيتروجين. تم الحصول على التربة التجريبية من مدينة هارلينجر، مدينة باوتو، منغوليا الداخلية، الصين، والتي تتميز بدرجة حموضة 7.4 ومحتوى مغذيات محدد. كانت سلالة البرسيم المستخدمة هي ‘WL232HQ’، وتم إجراء التجارب في بيئة دفيئة في جامعة الزراعة في منغوليا الداخلية. تم استخدام محلول مخزون بتركيز 5% من NPs-Se، وتم إجراء وسم النظائر المستقرة باستخدام نترات البوتاسيوم ($K^{15}NO_3$) لتتبع ديناميات النيتروجين.

تم تطبيق NPs-Se على الأوراق بتركيز 50 ملغ L$^{-1}$ على فترات 7 أيام، مع استخدام الماء المقطر كتحكم. تم قياس معلمات فلوروسينس الكلوروفيل في 1 و7 و14 يومًا بعد العلاج، بينما تم تحليل عينات الأوراق لأنشطة الإنزيمات المتعلقة باستقلاب النيتروجين، والملفات النسخية والتمثيلية. شمل التصميم التجريبي ثلاث تكرارات لكل مجموعة علاج، تم تصنيفها على أنها CK (تحكم) وSe (معالجة بالسيلينيوم)، مع حصاد عينات النبات لاحقًا لتحليل النيتروجين الكلي و$^{15}N$.

نتائج

يقدم قسم “النتائج” في ورقة البحث النتائج الرئيسية المستمدة من التجارب أو التحليلات التي تم إجراؤها. يوضح النتائج التي توصلت إليها الدراسة، مع تسليط الضوء على نقاط البيانات والاتجاهات المهمة التي لوحظت طوال البحث. عادةً ما تكون النتائج مدعومة بتحليلات إحصائية، وتمثيلات بصرية مثل الرسوم البيانية أو الجداول، ومقارنات مع الأدبيات الموجودة لوضع النتائج في سياقها.

في هذا القسم، قد يناقش المؤلفون أيضًا تداعيات نتائجهم، مشيرين إلى كيف تساهم في المجال الأوسع للدراسة. يتم تناول أي نتائج غير متوقعة أو شذوذ، مما يوفر رؤى حول المجالات المحتملة لمزيد من التحقيق. بشكل عام، تعتبر النتائج أساسًا للنقاشات والاستنتاجات اللاحقة التي تم التوصل إليها في الورقة.

نقاش

يسلط النقاش الضوء على الآثار المفيدة للنانو سيلينيوم على نمو البرسيم واستقلاب النيتروجين. وُجد أن الجرعات المعتدلة من السيلينيوم الخارجي تعزز التمثيل الضوئي، واستقلاب الكربون والنيتروجين، وتراكم الأحماض الأمينية الأساسية والمستقلبات الثانوية، مما يحسن الجودة الغذائية للنبات. بشكل خاص، زادت تطبيقات النانو سيلينيوم بتركيزات من 50-100 ملغ L$^{-1}$ بشكل كبير من الوزن الجاف لجذور البرسيم، والسيقان، والأوراق مقارنةً بمجموعة التحكم. يُعزى هذا التعزيز في الكتلة الحيوية إلى تحسين التقاط الطاقة الضوئية وكفاءة التحويل، كما يتضح من التغيرات في معلمات فلوروسينس الكلوروفيل وزيادة التعبير عن الجينات المرتبطة بالتمثيل الضوئي.

علاوة على ذلك، استخدمت الدراسة طريقة وسم النظائر 15N لإظهار أن النانو سيلينيوم يعزز استخدام النيتروجين ويعزز إعادة توزيعه داخل النبات. أظهرت الإنزيمات الرئيسية المعنية في استقلاب النيتروجين، مثل مختزل النترات (NR) ومختزل النيتريت (Nir)، زيادة في النشاط استجابةً لعلاج النانو سيلينيوم، مما يشير إلى قدرة معززة على استيعاب النيتروجين. كشفت التحليلات النسخية والتمثيلية عن تغييرات كبيرة في التعبير الجيني وملفات المستقلبات، خاصة في المسارات المتعلقة بتخليق الأحماض الأمينية وتخليق الفلافونويد. بشكل عام، تشير النتائج إلى أن النانو سيلينيوم لا يعزز فقط كتلة النبات ولكن أيضًا يحسن استقلاب النيتروجين، مما يسهم في تحسين العائد والجودة العلفية في البرسيم.

Journal: Journal of Nanobiotechnology, Volume: 23, Issue: 1
DOI: https://doi.org/10.1186/s12951-024-03073-4
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39755664
Publication Date: 2025-01-05
Author(s): Pengbo Sun et al.
Primary Topic: Selenium in Biological Systems

Overview

This study investigates the effects of nano-selenium on nitrogen metabolism and nutritional quality in alfalfa, utilizing the 15N labeling method alongside multi-omics analysis. The findings indicate that nano-selenium enhances plant nitrogen metabolism and photosynthesis by improving light energy capture and increasing the activity of key nitrogen metabolism enzymes, specifically nitrate reductase (NR), nitrite reductase (Nir), glutamine synthetase (GS), and glutamate synthase (GOGAT). This enhancement leads to increased nitrogen accumulation and dry matter content in alfalfa.

The transcriptomic and metabolomic analyses reveal that nano-selenium primarily influences several metabolic pathways, including ‘biosynthesis of amino acids’, ‘starch and sucrose metabolism’, ‘pentose and glucuronate interconversions’, ‘pentose phosphate pathway’, and ‘flavonoid biosynthesis’. Early treatment with nano-selenium regulates the expression of genes associated with these pathways, resulting in elevated levels of beneficial compounds such as L-glutamic acid, L-histidine, glycerone-P, coniferin, and naringenin chalcone. However, the effects of nano-selenium diminish over time. Overall, this research provides valuable insights into the molecular mechanisms by which nano-selenium modulates key metabolic pathways in alfalfa, contributing to the safe and efficient production of selenium-enriched crops.

Introduction

The introduction highlights the significance of selenium as an essential trace element for human and animal health, particularly its role in selenoproteins like glutathione peroxidase, which contribute to antioxidant defenses and may reduce the risk of diseases such as cardiovascular conditions and cancer. Traditionally, inorganic selenium forms like selenate and selenite have been used for biofortification, but their narrow safe dosage range has prompted the exploration of selenium nanoparticles (nanoselenium) as a more effective alternative. Nanoselenium, characterized by its small particle size (0-100 nm) and unique properties, offers advantages including high bioavailability, stability, low toxicity, and enhanced free radical scavenging ability, positioning it as a pivotal component in precision agriculture.

The paper specifically addresses the role of nanoselenium in enhancing the yield and nutritional quality of alfalfa (Medicago sativa L.), a widely cultivated forage crop. While previous studies have primarily focused on inorganic selenium, the authors aim to investigate the molecular mechanisms by which nanoselenium influences nitrogen metabolism in alfalfa. Utilizing physiological nitrogen isotope labeling, RNA-Seq sequencing, and non-targeted metabolomics, the study will analyze physiological changes and identify differentially expressed genes (DEGs) and metabolites (DAMs) in response to nanoselenium treatment. This research seeks to elucidate the molecular mechanisms underlying nanoselenium’s regulatory effects on nitrogen metabolism, thereby providing a theoretical basis for its further application in agriculture.

Methods

In this study, the authors investigated the effects of selenium nanoparticles (NPs-Se) on alfalfa (Medicago sativa) growth and nitrogen metabolism. The experimental soil was sourced from Harlinger Town, Baotou City, Inner Mongolia, China, characterized by a pH of 7.4 and specific nutrient content. The alfalfa variety used was ‘WL232HQ’, and the experiments were conducted in a greenhouse setting at Inner Mongolia Agricultural University. A 5% NPs-Se stock solution was utilized, and stable isotope labeling with $^{15}N$ was performed using potassium nitrate ($K^{15}NO_3$) to trace nitrogen dynamics.

Foliar applications of NPs-Se were administered at a concentration of 50 mg L$^{-1}$ at 7-day intervals, with distilled water serving as a control. Chlorophyll fluorescence parameters were measured at 1, 7, and 14 days post-treatment, while leaf samples were analyzed for enzyme activities related to nitrogen metabolism, transcriptomic, and metabolomic profiles. The experimental design included three replicates for each treatment group, labeled as CK (control) and Se (selenium-treated), with plant samples subsequently harvested for total nitrogen and $^{15}N$ analysis.

Results

The “Results” section of the research paper presents the key findings derived from the conducted experiments or analyses. It details the outcomes of the study, highlighting significant data points and trends observed throughout the research. The results are typically supported by statistical analyses, visual representations such as graphs or tables, and comparisons with existing literature to contextualize the findings.

In this section, the authors may also discuss the implications of their results, indicating how they contribute to the broader field of study. Any unexpected outcomes or anomalies are addressed, providing insights into potential areas for further investigation. Overall, the results serve as a foundation for the subsequent discussion and conclusions drawn in the paper.

Discussion

The discussion highlights the beneficial effects of nanoselenium on alfalfa growth and nitrogen metabolism. Moderate doses of exogenous selenium were found to enhance photosynthesis, carbon and nitrogen metabolism, and the accumulation of essential amino acids and secondary metabolites, thereby improving the nutritional quality of the plant. Specifically, the application of nanoselenium at concentrations of 50-100 mg L$^{-1}$ significantly increased the dry weight of alfalfa roots, stems, and leaves compared to the control group. This enhancement in biomass is attributed to improved light energy capture and conversion efficiency, as evidenced by changes in chlorophyll fluorescence parameters and the upregulation of genes associated with photosynthesis.

Furthermore, the study utilized a 15N isotope labeling method to demonstrate that nanoselenium enhances nitrogen utilization and promotes its redistribution within the plant. Key enzymes involved in nitrogen metabolism, such as nitrate reductase (NR) and nitrite reductase (Nir), exhibited increased activity in response to nanoselenium treatment, indicating a strengthened capacity for nitrogen assimilation. Transcriptomic and metabolomic analyses revealed significant changes in gene expression and metabolite profiles, particularly in pathways related to amino acid and flavonoid biosynthesis. Overall, the findings suggest that nanoselenium not only boosts plant biomass but also optimizes nitrogen metabolism, contributing to improved forage yield and quality in alfalfa.