الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
جزيئات الدهون الليبوزومية لنقل mRNA خارج الكبد
2025 | المؤلف: Miffy H. Y. Cheng وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تمت الموافقة على جميع بروتوكولات الحيوانات من قبل لجنة رعاية الحيوانات الكندية واتبعت إرشادات جامعة كولومبيا البريطانية (A22-0044، A20-0132). تم الحصول على الدهون الأيونية المستخدمة، بما في ذلك nor-MC3 وMC3 وALC-0315 وSM-102، من الدكتور ماركو تشيوفوليني، بينما تم الحصول على الدهون الإضافية والكوليسترول من أفانتي بولار ليبيدز وسيغما ألدريش، على التوالي. تم…
-
آليات مكافحة السرطان الذاتية المحدودة في الخفافيش طويلة العمر
2025 | المؤلف: Fathima Athar وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: البيئة والتطور والسلوك والتصنيف (Ecology, Evolution, Behavior and Systematics)تستكشف هذه الفقرة الآليات الكامنة وراء مقاومة السرطان وطول العمر في أنواع مختلفة من الخفافيش، التي تظهر أعمارًا تتجاوز 20-40 عامًا. تركز الدراسة على الألياف الليفية الأولية من أربعة أنواع من الخفافيش—*Myotis lucifugus*، *Eptesicus fuscus*، *Eonycteris spelaea*، و*Artibeus jamaicensis*—وتكشف أن هذه الألياف الليفية لا تخضع للشيخوخة التكرارية، تعبر عن تيلوميراز نشط، وتظهر أنماط إفراز مرتبطة…
-
بناء مكتبات CRISPR متعددة الأهداف في الطماطم للتغلب على التكرار الوظيفي على مستوى الجينوم
2025 | المؤلف: Amichai Berman وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم قيود طرق الطفرات التقليدية في برامج التربية وفحص الطفرات، لا سيما فيما يتعلق بالتكرار الجيني وعدم القدرة على استهداف جينات معينة. بينما تقدم تقنية CRISPR-Cas9 تحريرًا دقيقًا للجينات، واجهت تطبيقاتها في تحسين المحاصيل تحديات في قابلية التوسع. تتناول هذه الدراسة هذه القضايا من خلال تطوير مكتبات CRISPR متعددة الأهداف على مستوى الجينوم…
-
فك تشفير المواد الكيميائية من نوع البير-والبوليفلورو ألكيل (PFAS) في سرطان الكبد: نهج متعدد الأوميات وعلم السموم الحاسوبي
2025 | المؤلف: Yanggang Hong وآخرون | المجلة: Journal of Translational Medicine | المجال: الكيمياء البيئية (Environmental Chemistry)تبحث هذه الدراسة في دور المواد الكيميائية المعالجة بالفلور (PFAS)، وتحديداً حمض البيرفلوروأوكتانويك (PFOA) وسولفونات البيرفلوروأوكتان (PFOS)، في سرطان الكبد الخلوي (HCC) من خلال نهج شامل متعدد الأوميات. تحدد الدراسة ستة جينات رئيسية—APOA1، ESR1، IGF1، PPARGC1A، SERPINE1، وPON1—كأهداف رئيسية مرتبطة بتعرض PFAS وتقدم HCC. تشير تحليلات الإثراء الوظيفي إلى أن هذه الأهداف مرتبطة بمسارات الإشارات…
-
بناء، تعبير، وتوصيف شظية scFv ضد كاتيبسين L1H لفاسيولا جيجانتكا
2025 | المؤلف: Phawiya Suksomboon وآخرون | المجلة: Parasitology Research | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تبحث الدراسة في تطوير شظية متغيرة ذات سلسلة واحدة (scFv) من الأجسام المضادة تستهدف كاتيبسين L1H من *Fasciola gigantica* (FgCathL1H)، وهو مستضد حاسم لتشخيص الفاسيولوز، وهو مرض حيواني المنشأ يؤثر على البشر والماشية. نجحت الدراسة في بناء وإنتاج أجسام مضادة scFv المؤتلفة المشتقة من خلايا الطحال الفأرية في *Escherichia coli* HB2151. تم تضخيم شظايا السلسلة…
-
تحليل مدعوم بالتعلم العميق لتتبع الجسيمات الفردية من أجل الارتباط الآلي بين الانتشار والوظيفة
2025 | المؤلف: Jacob Kæstel‐Hansen وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: الفيزياء الحيوية (Biophysics)يقدم هذا القسم نظرة عامة على إطار عمل جديد للتعلم العميق، DeepSPT، مصمم لتحليل الانتشار تحت الخلوي في الأنظمة الحية. يتناول هذا الإطار التحديات المرتبطة بالعملية الشاقة لاستخراج المعلومات الوظيفية من انتشار الجزيئات والعضيات على النانو. لقد مكنت التقدمات الأخيرة في المجهر الضوئي من تتبع هذا الانتشار بدقة، لكن التفسير الآلي لا يزال عقبة كبيرة.…
-
أطلس خلوية متكامل للتعبير الجيني للأورغانويدات المشتقة من الأديم الباطن البشري
2025 | المؤلف: Quan Xu وآخرون | المجلة: Nature Genetics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، لم تتطلب الطرق التجريبية المستخدمة موافقة من لجنة الأخلاقيات، مما يشير إلى أن البحث قد شمل مواضيع غير بشرية أو استخدم بيانات لم تتطلب إشرافًا أخلاقيًا. إن غياب مثل هذه الموافقة يشير إلى نهج مبسط في المنهجية، مع التركيز المحتمل على التحليلات الحاسوبية أو النظرية بدلاً من التجارب المباشرة على البشر أو…
-
تحليل النسخ الجيني على مستوى الخلية الواحدة يكشف عن تآزر الميكروبيوم المعوي والعلاج المناعي من خلال تعديل بيئة الورم
2025 | المؤلف: Minyuan Cao وآخرون | المجلة: Signal Transduction and Targeted Therapy | المجال: علم الأورام (Oncology)تبحث هذه الدراسة في دور ميكروبات الأمعاء في تعزيز فعالية مثبطات نقاط التفتيش المناعية (ICIs) في علاج السرطان المناعي، مع التركيز على بيئة الورم الدقيقة (TME) بدقة خلوية واحدة. باستخدام تسلسل RNA أحادي الخلية، تكشف الدراسة أن ميكروبات الأمعاء الصحية، بالتزامن مع ICIs، تزيد بشكل كبير من نسب خلايا CD8\(^+\)، CD4\(^+\)، وخلايا T γδ، بينما…
-
CarboTag: نهج معياري للتصوير الحي والوظيفي لجدران خلايا النباتات
2025 | المؤلف: Maarten Besten وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علوم النبات (Plant Science)في قسم الطرق، يوضح المؤلفون بروتوكولات التخليق الكيميائي الشاملة المستخدمة في دراستهم، والتي تم تفصيلها في المعلومات التكميلية. يتضمن ذلك تقديم الهياكل الكيميائية، كما هو موضح في الأشكال التكميلية 15 و16، إلى جانب أطياف الفلورسنت الموضحة في الشكل التكميلية 17. علاوة على ذلك، يشير القسم إلى تحليلات كيميائية إضافية، والتي تم تقديمها في الأشكال التكميلية…
-
تحليل الجينوم والتعبير الجيني للخلايا الفردية لخلل تنسج القشرة البؤري الموزائي
2025 | المؤلف: Sara Baldassari وآخرون | المجلة: Nature Neuroscience | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يحدد قسم المنهجية النهج المنهجي المستخدم في البحث. يوضح تصميم التجربة، بما في ذلك اختيار المشاركين، وتقنيات جمع البيانات، وإجراءات التحليل. يتم وصف الأدوات والأجهزة المحددة المستخدمة في القياس، مما يضمن إمكانية إعادة إنتاج النتائج وموثوقيتها. تم إجراء تحليلات إحصائية لتقييم البيانات، مع تطبيق الاختبارات المناسبة بناءً على طبيعة المتغيرات المعنية. يبرز القسم أهمية الالتزام…