الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: التطور النشوئي
-
دراسة انتشار في الكاميرون تحدد بروسيلة أبورتوس كنوع بروسيلة المستوطن في الماشية
2025 | المؤلف: Gaelle Kamdjo Guela وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)داء البروسيلات، وهو مرض حيواني مهمل، يشكل تهديدات كبيرة للاقتصادات الزراعية والصحة العامة في جميع أنحاء العالم، لا سيما في أفريقيا جنوب الصحراء حيث هو متوطن. هذه الدراسة المقطعية التي أجريت في الكاميرون من فبراير 2021 إلى مايو 2023 قيمت انتشار بروسيلة في 4,612 حيوانًا (الأبقار، الأغنام، الماعز، والخنازير) تم الحصول عليها من المسالخ عبر…
-
الحفاظ على وتغيير الخلايا العصبية الداخلية في النواة المذنبة للثدييات
2025 | المؤلف: Emily K. Corrigan وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأعصاب النمائي (Developmental Neuroscience)تحدد قسم الطرق بروتوكولات التجارب الحيوانية المستخدمة في هذه الدراسة، والتي تمت الموافقة عليها جميعًا من قبل لجان رعاية واستخدام الحيوانات المؤسسية (IACUC) المعنية. كان النموذج الأساسي المستخدم هو خط الفئران Nkx2-1-Cre;Ai14، الذي تم إنشاؤه عن طريق تزاوج سلالات فئران محددة، مع جمع الأجنة في مراحل تطور مختلفة (E15، E17، E18) لتحليل فلورية tdTomato. بالإضافة…
-
علم الأنساب الهيكلي يكشف التنوع التطوري لأنظمة الاتصال في البكتيريا إيجابية الجرام وفيروساتها
2025 | المؤلف: David Moi وآخرون | المجلة: Nature Structural & Molecular Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في قسم الطرق من ورقة البحث، يُلاحظ أنه لم يتم استخدام أي طرق إحصائية لتحديد حجم العينة قبل الدراسة. قد يؤثر هذا النهج على قوة النتائج، حيث أن حساب حجم العينة بشكل مناسب أمر حاسم لضمان القوة الإحصائية وموثوقية النتائج. قد يؤدي غياب حجم عينة محدد مسبقًا إلى تحديات في تعميم النتائج أو تقييم أهمية…
-
إصدار GTDB 10: تصنيف كامل ومنهجي لـ 715,230 جينوم بكتيري و17,245 جينوم أثري
2025 | المؤلف: Donovan H. Parks وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قاعدة بيانات تصنيف الجينوم (GTDB) تقدم تصنيفًا متسقًا من الناحية النشوء والتطور ومعدلًا موحدًا للجينومات بدائية النواة، باستخدام بيانات من قاعدة بيانات تجميع NCBI. اعتبارًا من الإصدار 10 (R10-RS226)، تشمل GTDB 715,230 جينومًا بكتيريًا و17,245 جينومًا أثريًا، منظمة في 136,646 مجموعة من الأنواع البكتيرية و6,968 مجموعة من الأنواع الأثرية. تشير النتائج إلى انخفاض معدل اكتشاف…
-
أدلة تطورية على التوسع الوطني لسلالات Brucella melitensis تدفع إعادة ظهور وباء حمى البروسيلات البشرية في جيانغسو، الصين
2025 | المؤلف: Weixiang Wang وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تستكشف الدراسة عودة داء البروسيلات البشري في مقاطعة جيانغسو، مع التركيز على مصادر وديناميات انتقال سلالات بروسيلة ميلتينسيس. باستخدام البيوتيب التقليدي، وتحليل تسلسل الجينوم الكامل، وتحليل تعدد أشكال النوكليوتيدات الفردية (WGS-SNP)، ونمط تسلسل الجينوم الأساسي (cgMLST)، قام الباحثون بتحليل 89 عينة، مؤكدين جميعها كـ B. melitensis—16 كنوع حيوي 1 و73 كنوع حيوي 3. أظهرت السلالات…
-
تكشف الميتوجينوميات المقارنة عن المحركات التطورية للديدان الخيطية من نوع Strongyloidea التي تعيش في الجهاز الهضمي
2025 | المؤلف: Junyan Li وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تبحث الدراسة في الجينوم الميتوكوندري للسوبر عائلة سترونجيلايد، وهي مجموعة هامة من الطفيليات المعوية التي تؤثر على المجترات والماشية. هذه الدراسة هي الأولى من نوعها التي تعيد بناء النشوء والتطور للسترونجيلايد وتفحص ديناميات الاختيار الخاصة بالموائل عبر موائل معوية مختلفة، وهي الكرش، الأمعاء الدقيقة، والأمعاء الغليظة. تكشف النتائج عن تجمعات نشوء قوية بين الأنواع، تتميز…
-
تنفس أكسيد الحديد الميكروبي المرتبط بأكسدة الكبريتيد
2025 | المؤلف: Song‐Can Chen وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الهندسة البيئية (Environmental Engineering)في هذه الدراسة، تم تطوير إطار حسابي للتنبؤ بتمثيل الكبريت غير المتجانس في البكتيريا والعتائق من خلال تحليل 116 بروتينًا معنيًا بتحولات الكبريت الحمراء. تم استخدام التحليلات النشوية ونماذج ماركوف المخفية (HMMs) لتحديد المتجانسات لبروتينات دورة الكبريت عبر جينومات متنوعة، مما يكشف أن 80.5% من الفصائل البكتيرية والعتائق المعروفة ترمز إلى بروتين واحد على الأقل…
-
الجينات المقاومة للمضادات الحيوية في التربة العالمية مرتبطة بزيادة المخاطر والترابط مع مقاومة البشر
2025 | المؤلف: Yuxiang Zhao وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التلوث (Pollution)تسلط هذه القسم من ورقة البحث الضوء على الدور الحاسم للتربة كمستودع لجينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) وتأثيراتها على صحة الإنسان ضمن إطار الصحة الواحدة. تحلل الدراسة مجموعة بيانات كبيرة تتكون من 3,965 عينة ميتاجينومية من موائل مختلفة، بما في ذلك التربة والبراز والمياه العادمة، إلى جانب 8,388 جينوم لعزلات *Escherichia coli*. تشير النتائج إلى…
-
تسلسل طويل القراءة مع تحديد الجينوم يوسع التنوع الميكروبي المعروف عبر المواطن الأرضية
2025 | المؤلف: Mantas Sereika وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على التقدمات الكبيرة التي جعلها تسلسل الحمض النووي طويل القراءة وعالي الإنتاجية ممكنة في استعادة الجينومات الميكروبية من عينات بيئية معقدة. من خلال تسلسل نانوبور العميق وطويل القراءة لـ 154 عينة من التربة والرواسب من مشروع Microflora Danica، نجح المؤلفون في تحديد جينومات من 15,314 نوعًا ميكروبيًا لم يتم وصفه سابقًا. استخدمت…
-
أستار: حزمة لإعادة بناء النشوء والتطور على نطاق واسع
2025 | المؤلف: Chao Zhang وآخرون | المجلة: Molecular Biology and Evolution | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على تطوير حزمة شاملة تُدعى ASTER، والتي تدمج طرقًا مختلفة مشابهة لـ ASTRAL لاستنتاج شجرة الأنواع تأخذ في الاعتبار عدم توافق شجرة الجينات. تشمل حزمة ASTER عدة أدوات متخصصة مصممة لأنواع مختلفة من بيانات الإدخال: ASTRAL لتوبولوجيات شجرة الجينات ذات النسخة الواحدة، ASTRAL الموزونة (wASTRAL) لشجرات الجينات ذات النسخة الواحدة…