الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: التطور النشوئي
-
سلالات متعددة من بروسيلة المالطية تدفع وباء البروسيلات البشرية في مقاطعة شانشي، الصين: دليل من تحليل تسلسل الجينوم الكامل
2024 | المؤلف: Cuihong An وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس الدراسة الديناميات الوبائية لحمى مالطا البشرية الناتجة عن *Brucella melitensis* في مقاطعة شانشي، الصين، باستخدام التصنيف الحيوي التقليدي وتسلسل الجينوم الكامل للبوليمورفisms أحادية النوكليوتيد (SNPs) لتحليل 189 سلالة. كشفت النتائج أن 189 سلالة تم تصنيفها على أنها *B. melitensis*، مع 14 في البيوفار 1، و145 في البيوفار 3، و30 كمتغيرات، موزعة عبر جميع المدن…
-
أصل وتطور جينوم القمح الطري
2024 | المؤلف: Emile Cavalet-Giorsa وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علوم النبات (Plant Science)تناقش هذه القسم تأثير تعدد الصبغيات والت domestication على التنوع الجيني للقمح، مع تسليط الضوء على الاختناقات الجينية الكبيرة خلال هذه العمليات. يشير إلى أنه بينما استفاد القمح من التهجين المتكرر مع الأقارب البرية وأنواع أخرى مستأنسة، مما أدى إلى زيادة التنوع الجيني، إلا أن جينوم D لا يزال أقل تنوعًا مقارنة بجينومات A و…
-
تحليل وباء بروسيلة المالطية في شينجيانغ: تحديد النمط، التعدد الشكلي، مقاومة المضادات الحيوية والتتبع
2024 | المؤلف: Xiaowen Yang وآخرون | المجلة: Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس الدراسة وبائيات Brucella spp.، وخاصة Brucella melitensis biovar 3، في شينجيانغ، حيث أعادت البروسيلوز الظهور كتهديد حيواني كبير. تم تحديد ما مجموعه 144 عزلة من Brucella باستخدام طرق تقليدية وتسلسل 16S rRNA، إلى جانب تحليل تكرار عدد المتغيرات متعدد المواقع (MLVA)، واختبار مقاومة الأدوية، واكتشاف تعدد الأشكال النوكليوتيدية على مستوى الجينوم الكامل (wgSNP). تكشف…
-
تحليل تسلسل الجينوم الكامل لبكتيريا بروسيلا من البشر والحيوانات الأليفة والحياة البرية في جنوب أفريقيا
2024 | المؤلف: Koketso Desiree Mazwi وآخرون | المجلة: The Journal of Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تبحث هذه الدراسة في التركيب الجينومي السكاني لبكتيريا Brucella spp.، وبشكل خاص Brucella abortus وB. melitensis، في جنوب أفريقيا، حيث تشكل البروسيلوز مخاطر صحية كبيرة على البشر والحيوانات الأليفة والحياة البرية. قامت الدراسة بتسلسل الجينومات الكاملة لـ 19 عينة استرجاعية وحللتها باستخدام هوية النوكليوتيد المتوسطة (ANI) والبانجينوميات وطرق تعدد الأشكال النوكليوتيدية الفردية للجينوم الكامل (wgSNP).…
-
معيشة إنسان دينيسوف في الكهف الكارستي بايشيا خلال العصر الجليدي الأوسط والمتأخر
2024 | المؤلف: Huan Xia وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الأنثروبولوجيا (Anthropology)في كهف بايشيا كارست (BKC)، كشفت تحليل شامل لـ 2,567 عينة حيوانية أن 78.1% تم التعرف عليها تصنيفياً، وتتكون في الغالب من الماعز، وخاصة البهارال (Pseudois nayaur). تشير المجتمع الحيواني إلى منظر طبيعي يهيمن عليه العشب خلال أواخر العصر الأوسط وأواخر العصر الجليدي، مع وجود ملحوظ للثيران والخيول، إلى جانب أنواع الغابات والشجيرات التي تشير…
-
مجموعة متعددة الممالك من 33,804 جينوم مرجعي للميكروبيوم المهبلي البشري
2024 | المؤلف: Liansha Huang وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)قسم “الطرق” في ورقة البحث يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في سؤال البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، متضمنة تحليلات إحصائية لتقييم البيانات المجمعة من تجارب مختلفة. شملت المنهجيات المحددة تجارب مختبرية محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لمراقبة تأثيراتها على النتائج ذات الأهمية. شمل جمع البيانات تدابير نوعية وكمية، مما يضمن فهمًا…
-
أطلس عالمي لفيروسات التربة يكشف عن تنوع بيولوجي غير مستكشف وتأثيرات جيوكيميائية محتملة
2024 | المؤلف: Emily Graham وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم البيئة (Ecology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على أطلس الفيروسات التربة العالمي، وهو مجموعة بيانات هامة مشتقة من 2,953 ميتاجينوم للتربة، والتي تشمل 616,935 جينوم فيروس غير مزروع و38,508 وحدات تصنيف تشغيلي فيروسية فريدة (OTUs). تسلط هذه الدراسة الضوء على الدور الحاسم لفيروسات التربة في الدورات البيوجيوكيميائية العالمية، على الرغم من إهمالها التاريخي في علم البيئة الميكروبية.…
-
vSNP: خط أنابيب SNP لتوليد مصفوفات SNP الشفافة وأشجار النشوء والتطور من مجموعات بيانات تسلسل الجينوم الكامل
2024 | المؤلف: Jessica Hicks وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تعتبر أنبوب vSNP أداة متخصصة تم تطويرها على مدار العقد الماضي لمعالجة التحديات الفريدة التي تواجهها المختبرات التشخيصية أثناء التحقيقات في تفشي الأمراض. تسهل تسلسل الجينوم الكامل بسرعة وتضمن التحقق من دقة التسلسل والتحقق منها عبر مختلف مسببات الأمراض. ينتج الأنبوب مخرجات سهلة الاستخدام، بما في ذلك مصفوفات SNP والأشجار النشوء والتطور، والتي تم تصميمها…
-
التسلسل الكامل والتحليل المقارن لكروموسومات الجنس في القردة
2024 | المؤلف: Kateryna D. Makova وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الوراثة (Genetics)تقدم الدراسة تحليلًا شاملاً لكروموسومات الجنس لدى أنواع مختلفة من القردة، مع التركيز على الكروموسوم Y الخاص بالذكور والكروموسوم X، الذي يوجد في كلا الجنسين. باستخدام تقنيات التسلسل المتقدمة، أنشأت الدراسة تجميعات خالية من الفجوات للكروموسومات X وY لخمسة أنواع من القردة العظيمة وقردة أصغر واحدة، كاشفة عن اختلافات هيكلية وتطورية كبيرة. أظهرت الكروموسومات Y…
-
التحليل النشوي والجينوميات المقارنة لسلالات بروسيلة أبورتوس وبروسيلة ميلتينسيس في مصر
2024 | المؤلف: Alyaa Elrashedy وآخرون | المجلة: Journal of Molecular Evolution | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس هذه الدراسة الخصائص الجينومية لثمانية سلالات من *Brucella abortus* وثمانية عشر سلالة من *Brucella melitensis* من مصر، مقارنتها بلقاحات RB51 وREV1. باستخدام مجموعة أدوات RAST، تم توضيح الجينومات، كاشفة عن أطوال تبلغ 3,250,377 زوج قاعدي لـ *B. abortus* و3,285,803 زوج قاعدي لـ *B. melitensis*، مع عدد مشابه من الجينات المرشحة المحددة في سلالات *B.…