الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الجينوميات (Genomics)
-
معايير للمراقبة الجينومية للصحة الواحدة لبكتيريا الإشريكية القولونية من أستراليا
2025 | المؤلف: A. Watt وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الغدد الصماء (Endocrinology)تسلط هذه الفقرة من ورقة البحث الضوء على الدور الحاسم للجينوميات في فهم انتقال مسببات الأمراض ضمن إطار الصحة الواحدة، مع التركيز بشكل خاص على الإشريكية القولونية. جمعت الدراسة مجموعة بيانات شاملة تتكون من 5,471 تسلسل جينومي للإشريكية القولونية من مصادر متنوعة في أستراليا، بما في ذلك البشر، والحيوانات البرية والماشية، والحيوانات الأليفة، والعينات البيئية،…
-
تحليل شامل للجينوم واكتشاف المتغيرات على نطاق واسع باستخدام DRAGEN
2024 | المؤلف: Sairam Behera وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم قسم “النتائج” النتائج الرئيسية للدراسة، مع تسليط الضوء على نتائج التجارب أو التحليلات التي تم إجراؤها. تشير البيانات إلى وجود ارتباط كبير بين المتغيرات قيد التحقيق، حيث تكشف التحليلات الإحصائية عن قيم p أقل من العتبة التقليدية 0.05، مما يشير إلى دليل قوي ضد فرضية العدم. بالإضافة إلى ذلك، تظهر النتائج أن التدخل المطبق…
-
المشهد الجينومي لـ 2,023 سرطان قولون ومستقيم
2024 | المؤلف: Alex J. Cornish وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأمراض والطب الشرعي (Pathology and Forensic Medicine)تقدم ورقة البحث تحليلًا جينوميًا شاملًا لسرطان القولون والمستقيم (CRC) من خلال تسلسل الجينوم الكامل لـ 2,023 عينة من مشروع الجينومات 100,000 في المملكة المتحدة. تحدد هذه الدراسة أكثر من 250 جينًا محتملاً للسائق، العديد منها لم يرتبط سابقًا بـ CRC أو أنواع السرطان الأخرى، وتكشف عن تغييرات جينومية متكررة تتجاوز المناطق المشفرة. يصنف المؤلفون…
-
فك رموز المجالات المكانية من الميكروبيوم المكاني متعدد الأبعاد باستخدام SpatialGlue
2024 | المؤلف: Yahui Long وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، قام المؤلفون بتقييم SpatialGlue مقابل عدة طرق منافسة باستخدام بيانات متعددة الأومكس المكانية التي تم الحصول عليها تجريبيًا والمحاكاة مع تسميات الحقيقة المعروفة. استخدمت التقييمات مقاييس إشرافية مثل التجانس، المعلومات المتبادلة، المعلومات المتبادلة المعدلة (AMI)، المعلومات المتبادلة العادية (NMI)، ومؤشر راند المعدل (ARI). تضمنت مجموعات البيانات المحاكاة وضعيتين قدمتا رؤى فريدة ومتكاملة…
-
التحليل النشوي والجينوميات المقارنة لسلالات بروسيلة أبورتوس وبروسيلة ميلتينسيس في مصر
2024 | المؤلف: Alyaa Elrashedy وآخرون | المجلة: Journal of Molecular Evolution | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس هذه الدراسة الخصائص الجينومية لثمانية سلالات من *Brucella abortus* وثمانية عشر سلالة من *Brucella melitensis* من مصر، مقارنتها بلقاحات RB51 وREV1. باستخدام مجموعة أدوات RAST، تم توضيح الجينومات، كاشفة عن أطوال تبلغ 3,250,377 زوج قاعدي لـ *B. abortus* و3,285,803 زوج قاعدي لـ *B. melitensis*، مع عدد مشابه من الجينات المرشحة المحددة في سلالات *B.…
-
استراتيجيات أكورديون الجينوم لفيروس جدري القرود
2024 | المؤلف: Sara Monzón وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الفيروسات (Virology)في هذا القسم، يحدد المؤلفون نهجهم التجريبي للتحقيق في آثار المناطق ذات التعقيد المنخفض (LCRs) على الاستقرار، النسخ، والترجمة لإطارات القراءة المفتوحة الفيروسية (ORFs) في جينات محددة (OPG153، OPG204، وOPG208). لقد حددوا أن التغيرات في OPG204 وOPG208 تحدث بالقرب من المنطقة الطرفية N، مما يشير إلى دور محتمل في تنظيم تخليق البروتين. ومن الجدير بالذكر…
-
الجينوميات العميقة للطحالب الكبيرة تكشف عن مسارات متعددة نحو تعدد الخلايا المائية والضوئية
2024 | المؤلف: David R. Nelson وآخرون | المجلة: Molecular Plant | المجال: علم المحيطات (Oceanography)تستكشف هذه الدراسة التنوع الجينومي والآليات التطورية للتعدد الخلوي في الطحالب الكبيرة، والتي تعتبر ضرورية للحفاظ على المناخ ولها تطبيقات بيولوجية تكنولوجية هامة. من خلال تسلسل 110 جينوم من الطحالب الكبيرة من مناخات وفصائل مختلفة، حدد الباحثون ميزات جينومية مميزة تميز الطحالب الكبيرة عن نظيراتها من الطحالب الدقيقة. تشمل النتائج الرئيسية وجود جينات مرتبطة بالالتصاق…
-
مقاومة مضادات الميكروبات لنيسرية السيلان في أوروبا في عام 2020 مقارنة بعام 2013 و2018: دراسة رصد جينومي استعادية
2024 | المؤلف: Daniel Golparian وآخرون | المجلة: The Lancet Microbe | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تدرس الدراسة السكان السيلاني في المنطقة الاقتصادية الأوروبية (EEA) في عام 2020، مع التركيز على مقاومة المضادات الحيوية (AMR) وبيانات المرضى. باستخدام بيانات من برنامج المراقبة الأوروبية لمقاومة المضادات الحيوية للسيلان (Euro-GASP)، قام الباحثون بتحليل 1,932 عينة سيلانية من 21 دولة في المنطقة الاقتصادية الأوروبية، مقارنة النتائج مع بيانات من 2013 و2018. تم استخدام تسلسل…
-
تجميع الجينوم على مقياس الكروموسومات لقصب السكر الهجين المزروع حديثًا يوفر رؤى حول الأصل والتطور
2024 | المؤلف: Yixue Bao وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علوم النبات (Plant Science)قصب السكر هو محصول حيوي ذو أهمية اقتصادية وصناعية كبيرة، ومع ذلك لا يزال جينومه المعقد غير محسوم بسبب تعدد الصبغيات العالي وإعادة التركيب الواسعة بين تحت الجينومات الخاصة به. تقدم هذه الدراسة تجميعًا لجينوم على مستوى الكروموسومات، تم حله حسب الأنماط الوراثية لزراعة قصب السكر الهجينة ZZ1، ويشمل 10.4 جيجابايت من تسلسلات الجينوم و68,509…
-
تعقيد تطور الطيور كما تكشفه الجينومات على مستوى العائلة
2024 | المؤلف: Josefin Stiller وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الوراثة (Genetics)تتناول الدراسة النقاشات الطويلة الأمد بشأن العلاقات النشوء والتطور بين السلالات الطيرية، وخاصة ضمن النيوأفيات، من خلال تحليل جينومات 363 نوعًا من الطيور عبر 218 عائلة تصنيفية، تمثل 92% من التنوع الكلي. باستخدام المناطق بين الجينات وطرق التلاقي، تقدم الدراسة شجرة نشوء وتطور مدعومة جيدًا تؤكد على انتشار سريع للنيوأفيات حول حدود العصر الطباشيري-الباليوجيني. تشير…