الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الجينوميات (Genomics)
-
تغييرات جينية وتعبيرية للخلايا الفردية في دماغ الإنسان المتقدم في العمر
2025 | المؤلف: Ailsa M. Jeffries وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث تأثير الشيخوخة على الدماغ البشري، مع التركيز بشكل خاص على القشرة الجبهية (PFC). باستخدام تقنيات متقدمة مثل تسلسل RNA أحادي النواة (snRNA-seq)، وتسلسل الجينوم الكامل للخلايا الفردية (scWGS)، والترانسكريبتوميات المكانية، تحدد الدراسة تغييرات كبيرة في التعبير الجيني والوراثي على مدار حياة الإنسان، من الطفولة إلى المعمرين. تشمل النتائج الرئيسية…
-
تكشف الميتوجينوميات المقارنة عن المحركات التطورية للديدان الخيطية من نوع Strongyloidea التي تعيش في الجهاز الهضمي
2025 | المؤلف: Junyan Li وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تبحث الدراسة في الجينوم الميتوكوندري للسوبر عائلة سترونجيلايد، وهي مجموعة هامة من الطفيليات المعوية التي تؤثر على المجترات والماشية. هذه الدراسة هي الأولى من نوعها التي تعيد بناء النشوء والتطور للسترونجيلايد وتفحص ديناميات الاختيار الخاصة بالموائل عبر موائل معوية مختلفة، وهي الكرش، الأمعاء الدقيقة، والأمعاء الغليظة. تكشف النتائج عن تجمعات نشوء قوية بين الأنواع، تتميز…
-
أستار: حزمة لإعادة بناء النشوء والتطور على نطاق واسع
2025 | المؤلف: Chao Zhang وآخرون | المجلة: Molecular Biology and Evolution | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على تطوير حزمة شاملة تُدعى ASTER، والتي تدمج طرقًا مختلفة مشابهة لـ ASTRAL لاستنتاج شجرة الأنواع تأخذ في الاعتبار عدم توافق شجرة الجينات. تشمل حزمة ASTER عدة أدوات متخصصة مصممة لأنواع مختلفة من بيانات الإدخال: ASTRAL لتوبولوجيات شجرة الجينات ذات النسخة الواحدة، ASTRAL الموزونة (wASTRAL) لشجرات الجينات ذات النسخة الواحدة…
-
إعادة بناء الجينوم التكاملي تكشف عن التباين في استخدام الكربوهيدرات عبر بكتيريا البيفيدوبكتيريا المعوية البشرية
2025 | المؤلف: Aleksandr A. Arzamasov وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “طرق” يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون نهجًا كميًا، معتمدين على التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة استخدام مجموعات التحكم، والتوزيع العشوائي، والتعمية لتقليل التحيز وضمان موثوقية النتائج. تم تحليل البيانات باستخدام برامج إحصائية مناسبة، مع تحديد الأهمية عند عتبة قيمة p تبلغ…
-
تقييم القوة التمثيلية لنماذج اللغة المعتمدة على الحمض النووي المدربة مسبقًا في علم الجينوم التنظيمي
2025 | المؤلف: Ziqi Tang وآخرون | المجلة: Genome biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم ظهور نماذج اللغة الجينومية (gLMs) طريقة جديدة وغير خاضعة للإشراف لتعلم الأنماط التنظيمية الجينية في الجينوم غير المشفر، متجاوزًا الحاجة إلى تسميات النشاط الوظيفي من البيانات التجريبية. على الرغم من الدراسات السابقة التي تشير إلى أن نماذج gLM المدربة مسبقًا يمكن أن تعزز الأداء التنبؤي في علم الجينوم التنظيمي، فإن هذا البحث يقيم قدرتها…
-
اعتبار مدفوع بالبيانات للاضطرابات الجينية لبرامج الفحص الجيني العالمي لحديثي الولادة
2025 | المؤلف: Thomas Minten وآخرون | المجلة: Genetics in Medicine | المجال: علم الوراثة (Genetics)يتناول هذا القسم من ورقة البحث الجهود المستمرة لأكثر من 30 دراسة دولية تهدف إلى تحسين تسلسل حديثي الولادة (NBSeq) لتوسيع نطاق الاضطرابات الجينية التي يتم التعرف عليها في فحص حديثي الولادة. يبرز المؤلفون التباين الكبير في اختيار الجينات بين برامج NBSeq المختلفة، مما يبرز ضرورة وجود منهجية منهجية لتحديد أولويات الجينات للإدراج. لمعالجة ذلك،…
-
رؤى جينومية وجينية حول جينات البازلاء لمندل
2025 | المؤلف: Cong Feng وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علوم النبات (Plant Science)في هذا القسم، يقدم المؤلفون نهجًا شاملاً يدمج خريطة جينومية قائمة على التسلسل مع خريطة تنوع ظاهري قائمة على الصفات، جنبًا إلى جنب مع تحليلات ارتباط الهبلايوتype-الظاهرة. يتم تطبيق هذه المنهجية على مجموعة كبيرة من جينات البازلاء، بهدف تحديد هويات الجينات والسياقات الجينومية للأليلات المرتبطة بسبع صفات كلاسيكية لمندل. تشير النتائج إلى أن هذا الإطار…
-
علم الأوبئة الجينومية والديناميكا النشئية لعزلات Acinetobacter baumannii في مجرى الدم في الصين
2025 | المؤلف: Qixia Luo وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطب الجزيئي (Molecular Medicine)في السنوات الأخيرة، أصبح Acinetobacter baumannii مسببًا رئيسيًا للعدوى المكتسبة من المستشفيات على مستوى العالم، وخاصة المرتبطة بعدوى مجرى الدم (BSIs) التي تظهر معدلات وفيات تتجاوز 60%. قامت هذه الدراسة بتحليل 1506 عزلة فريدة من A. baumannii المسببة لـ BSI من 76 مستشفى في جميع أنحاء الصين على مدى عقد من الزمن (2011-2021)، كاشفة عن…
-
الجينوم وجينوم بنك الجينات لنبات التبغ الألوتيترايبلويك تقدم رؤى حول تطور الجينوم وتنظيم الصفات المعقدة
2025 | المؤلف: Yanjun Zan وآخرون | المجلة: Nature Genetics | المجال: التقنية الحيوية (Biotechnology)تناقش هذه القسم التحديات المرتبطة بالتكرار غير المكتمل للجينومات، خاصة في سياق *Nicotiana tabacum* (التبغ) وأنواعها السلفية. يبرز عدة آليات تم الإشارة إليها في هذه العملية، بما في ذلك تبادل الكروموسومات المتجانسة، وإعادة تنشيط العناصر القابلة للتحويل (TEs)، وإعادة نمذجة الميثيل الحمضي النووي. ومع ذلك، تقدم الأدبيات نتائج متضاربة بشأن هذه الآليات، مما يشير إلى…
-
التحليل الجينومي لـ 1,325 صنف من الكاميليا يسلط الضوء على الصفات الزراعية والتمثيلية لتحسين نبات الشاي
2025 | المؤلف: Weilong Kong وآخرون | المجلة: Nature Genetics | المجال: علم الأمراض والطب الشرعي (Pathology and Forensic Medicine)تقدم البحث تحليلًا شاملاً للأساس الجيني الذي يكمن وراء الصفات الزراعية والتمثيلية الرئيسية في نبات الشاي، وهو محصول مشروب غير كحولي ذو أهمية عالمية. من خلال إجراء إعادة تسلسل عميق جديد لـ 802 نبات شاي وإصداراتها ذات الصلة، قام المؤلفون بإنشاء خريطة لتنوع الجينات على مستوى الجينوم تتضمن تعليقات على الطفرات الضارة لـ 1,325 إصدارًا.…