الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الجينوم
-
التوصيل الفيروسي لمحرر الجينوم الموجه بواسطة RNA لتحرير الخط الجرثومي بدون نقل جينات في الأرابيدوبسيس
Viral delivery of an RNA-guided genome editor for transgene-free germline editing in Arabidopsisتناقش هذه الفقرة التقدم في تحرير الجينوم داخل علم الأحياء النباتية، مع تسليط الضوء على التحديات المرتبطة بتوصيل أنظمة التحرير إلى النباتات. غالبًا ما تكون الطرق التقليدية، مثل زراعة الأنسجة والتحويل، بطيئة وتعتمد على النمط الجيني، مما يتطلب إجراءات معقدة لتحقيق تعديلات خالية من الجينات المنقولة. يقترح المؤلفون حلاً مبتكرًا من خلال هندسة فيروس رattle…
-
تجميع الجينوم من طرف التيلومير إلى طرف التيلومير مقترنًا ببيانات متعددة الأوميك يوفر رؤى حول تطور القمح الخبزي سداسي الصيغة الصبغية
A telomere-to-telomere genome assembly coupled with multi-omic data provides insights into the evolution of hexaploid bread wheatيقدم القسم تحليلًا مقارنًا لتجميعات جينوم القمح CS-IAAS و CS RefSeq (الإصدار 2.1)، مع تسليط الضوء على الفروق المهمة في إحصائيات جينومية مختلفة. يتكون تجميع CS-IAAS من 14.51 مليار قاعدة مثبتة، متجاوزًا 14.01 مليار قاعدة في CS RefSeq بنسبة 3.57%. ومن الجدير بالذكر أن CS-IAAS يظهر انخفاضًا ملحوظًا في الفجوات (0 مقارنة بـ 183,603 في…
-
الكتّاب والقرّاء وممحيات ميثيلوم N6-ميثيل أدينوسين (m6A) في اللفت الزيتية: التعريف، التطور الجزيئي، وتحليل التعبير
Writers, readers, and erasers of N6-Methyladenosine (m6A) methylomes in oilseed rape: identification, molecular evolution, and expression profilingتبحث هذه الدراسة في نظام تعديل RNA m6A في Brassica napus، وهو محصول زيت رئيسي، مع تسليط الضوء على أهميته في نمو النبات وتطوره واستجابته للضغوط. تحدد الدراسة 92 جينًا من جينات تنظيم m6A، مصنفة إلى 13 كاتبًا، و29 مزيلًا، و50 قارئًا، والتي يتم تصنيفها أيضًا إلى سلالات تطورية متميزة. يُعزى توسع هذه العائلات الجينية…
-
MaveDB 2024: قاعدة بيانات مجتمعية مُنسقة تحتوي على أكثر من سبعة ملايين تأثير متغير من اختبارات وظيفية متعددة.
MaveDB 2024: a curated community database with over seven million variant effects from multiplexed functional assaysتحديث 2024 لـ MaveDB، وهو مورد محوري للاختبارات المتعددة لتأثير المتغيرات (MAVEs)، يقدم تحسينات كبيرة تهدف إلى تحسين الوصول إلى بيانات المتغيرات الجينية واستخدامها. تشمل التطورات الرئيسية دمج أكثر من 7 ملايين قياس لتأثير المتغيرات، ونموذج بيانات مطور يستوعب أنواع الاختبارات المختلفة مثل تحرير الجينوم المشبع، وتقديم أدوات جديدة للاستكشاف والتصور. بالإضافة إلى ذلك، تم…
-
ديناميات التطور لجينومات الميتوكوندريا والنقل داخل الخلايا بين أنواع القطن ثنائية الصيغة الصبغية والأليوبوليد
Evolutionary dynamics of mitochondrial genomes and intracellular transfers among diploid and allopolyploid cotton speciesتبحث الدراسة في التباين الهيكلي ومعدلات الطفرات في الجينومات الميتوكوندرية (الميتوجينومات) في جنس القطن (Gossypium)، الذي يشمل أنواع القطن المهمة. نجحت الدراسة في تجميع 19 ميتوجينوم من أنواع مختلفة من Gossypium، باستخدام طريقة تجميع قائمة على الرسوم البيانية التي كشفت عن أشكال هيكلية بديلة لم يتم التعرف عليها سابقًا. سمح هذا النهج بتحديد ثمانية تكوينات…
-
اندماج الريتروترانس بوزون المتمركز حول المركز عبر الكروماتين CENH3 في الأرابيدوبسيس
Centrophilic retrotransposon integration via CENH3 chromatin in Arabidopsisتسلط الأبحاث الضوء على الطبيعة الديناميكية للسنتروميرات عبر الكائنات الحية المختلفة، مع التركيز بشكل خاص على دور تسلسلات التكرار السريعة التطور، مثل التكرارات المتتالية (TRs) والعناصر القابلة للتحويل (TEs)، في هيكل ووظيفة السنترومير. تكشف الدراسة أن العناصر القابلة للتحويل العكسية، وبالتحديد عناصر التكرار الطويل (LTR) Ty3 وTy1، تظهر دورانًا سريعًا داخل TRs السنتروميرية لأنواع الأرابيدوبسيس.…
-
تعقيد تطور الطيور كما تكشفه الجينومات على مستوى العائلة
Complexity of avian evolution revealed by family-level genomesتتناول الدراسة النقاشات الطويلة الأمد بشأن العلاقات النشوء والتطور بين السلالات الطيرية، وخاصة ضمن النيوأفيات، من خلال تحليل جينومات 363 نوعًا من الطيور عبر 218 عائلة تصنيفية، تمثل 92% من التنوع الكلي. باستخدام المناطق بين الجينات وطرق التلاقي، تقدم الدراسة شجرة نشوء وتطور مدعومة جيدًا تؤكد على انتشار سريع للنيوأفيات حول حدود العصر الطباشيري-الباليوجيني. تشير…