الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الجينوم
-
ديناميات التطور لجينومات الميتوكوندريا والنقل داخل الخلايا بين أنواع القطن ثنائية الصيغة الصبغية والأليوبوليد
2025 | المؤلف: Jiali Kong وآخرون | المجلة: BMC Biology | المجال: علوم النبات (Plant Science)تبحث الدراسة في التباين الهيكلي ومعدلات الطفرات في الجينومات الميتوكوندرية (الميتوجينومات) في جنس القطن (Gossypium)، الذي يشمل أنواع القطن المهمة. نجحت الدراسة في تجميع 19 ميتوجينوم من أنواع مختلفة من Gossypium، باستخدام طريقة تجميع قائمة على الرسوم البيانية التي كشفت عن أشكال هيكلية بديلة لم يتم التعرف عليها سابقًا. سمح هذا النهج بتحديد ثمانية تكوينات…
-
نظام CRISPR-Cas9 يحمي E. coli من اكتساب جينات مقاومة المضادات الحيوية
2025 | المؤلف: Danna Lee وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)مقاومة المضادات الحيوية (AMR) هي قضية صحية عالمية حرجة، مما يستلزم تطوير استراتيجيات علاجية جديدة للعدوى البكتيرية. تعتبر البروبيوتيك المهندسة، وخاصة تلك التي تستخدم تقنية CRISPR-Cas9، طريقًا واعدًا لمواجهة هذا التحدي. تصف الدراسة المذكورة في هذا القسم إنشاء نظام CRISPR-Cas9 مصمم لمنع نقل الجينات الأفقي (HGT) لجينات AMR في البكتيريا. من خلال استهداف ثمانية جينات…
-
التقييم السريري للكشف عن بصمة الإيبي باستخدام تسلسل القراءة الطويلة في الاضطرابات التنموية
2025 | المؤلف: Mathilde Geysens وآخرون | المجلة: Genome Medicine | المجال: علم الوراثة (Genetics)تبحث الدراسة في إمكانية تسلسل الجينوم الكامل طويل القراءة (lrWGS) لاكتشاف التغيرات الميثيلية الخاصة بالأمراض على مستوى الجينوم، والمعروفة باسم الإبيساينتشر، في الاضطرابات التنموية (DD). شملت الدراسة تسلسل الجينوم الكامل باستخدام تقنية النانو بورا لـ 40 ضابطًا و20 مريضًا تم تأكيد أو الاشتباه في ارتباطهم بالإبيساينتشر، تغطي 13 مرضًا متميزًا. كشفت النتائج أن أنماط الميثيلوم…
-
التقييم الوظيفي والتصنيف السريري لمتغيرات BRCA2
2025 | المؤلف: Huaizhi Huang وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تتناول الأبحاث التحديات السريرية التي تطرحها متغيرات فقدان الوظيفة في جين BRCA2، والتي ترتبط بزيادة مخاطر الإصابة بالسرطان، وخاصة سرطان الثدي والمبيض. على الرغم من تحديد هذه المتغيرات من خلال الاختبارات الجينية، إلا أن العديد منها يصنف كمتغيرات ذات دلالة غير مؤكدة (VUS)، مما يحد من فائدتها السريرية. لتعزيز التوصيف الوظيفي وتصنيف متغيرات BRCA2، استخدمت…
-
تحليل الحمض النووي الخالي من الخلايا متعدد الوسائط للكشف عن إشارات سرطان محددة
2025 | المؤلف: Dimitris Vavoulis وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)في هذا القسم، يوضح المؤلفون الطرق المستخدمة للتحقق من صحة خط أنابيبهم لتمييز عينات البلازما السرطانية وغير السرطانية. قاموا بتوليد بيانات في السليكو من خلال محاكاة عينات البلازما مع نسب متغيرة من الحمض النووي الورمي المتداول (ctDNA)، باستخدام عينات بلازما فعلية كقوالب. بالنسبة لعينات غير السرطان، تم نمذجة إشارة التغطية الإجمالية للذراع الكروموسومي \( k…
-
التحرير الوراثي متعدد الجينات القابل للتوريث: الحدود التالية في الطب الجينومي؟
2025 | المؤلف: Peter M. Visscher وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على المنهجيات المتنوعة ومجالات البحث المعنية في الدراسة، مع تسليط الضوء على الطبيعة متعددة التخصصات للعمل. يذكر استخدام خطوط خلايا حقيقية النواة، والتي تعتبر حاسمة للتجارب البيولوجية، جنبًا إلى جنب مع التطبيقات في علم الحفريات وعلم الآثار، مما يشير إلى نطاق واسع يشمل كل من التحقيقات البيولوجية التاريخية والمعاصرة. بالإضافة…
-
ليبتوسبيرا غوريسيا سب. نوفي، ل. سينكونياي سب. نوفي، ل. مغودي سب. نوفي، ل. ميليري سب. نوفي و ل. أيواينسيس سب. نوفي: خمس أنواع جديدة معزولة من مصادر المياه في الولايات المتحدة الوسطى
2025 | المؤلف: Camila Hamond وآخرون | المجلة: INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY | المجال: علم الطفيليات (Parasitology)في هذه الدراسة، تم زراعة عزلات من *Leptospira spp.* من مصادر المياه عبر خمسة مواقع في وسط ولاية آيوا، الولايات المتحدة الأمريكية، وتم تصنيفها من خلال تسلسل الجينوم الكامل. أظهرت العزلات شكل لولبي وحركية، مع تحليل الجينوم الذي كشف عن تصنيفات متميزة ضمن جنس *Leptospira*. على وجه التحديد، تضمنت العزلات نوعًا واحدًا من تحت مجموعة…
-
DFAST_QC: أداة تقييم الجودة والتعرف الضريبي للجينومات بدائية النواة
2025 | المؤلف: Mohamed Elmanzalawi وآخرون | المجلة: BMC Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)توضح هذه القسم تطوير وقدرات DFAST_QC، وهي أداة جديدة مصممة لتعزيز التصنيف الضريبي ومراقبة الجودة للجينومات بدائية النواة. يعد التصنيف الضريبي الدقيق أمرًا حيويًا للبحث البيولوجي، ومع ذلك، غالبًا ما تتطلب أدوات التحقق من الجينوم الحالية موارد حاسوبية واسعة ووقتًا طويلاً، مما يحد من إمكانية الوصول إليها للمشاريع واسعة النطاق. تتناول DFAST_QC هذه التحديات من…
-
التجميع من جديد لجينوم الميتوكوندريا لنبات الجذور العرقية وتحديد نوعين من تكوينات إعادة التركيب المتماثلة الناتجة عن تسلسلات متكررة
2025 | المؤلف: Guang Yu Zhou وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)في هذه الدراسة، تم تجميع وتوضيح الجينومات الميتوكوندرية والكلوروبلاستية لنبات *Glycyrrhiza glabra*، وهو نبات طبي بارز، بنجاح باستخدام تقنيات تسلسل القراءة القصيرة (Illumina) والطويلة (Oxford Nanopore). وُجد أن الجينوم الميتوكوندري له هيكل دائري يمتد على 421,293 قاعدة مع محتوى GC يبلغ 45.1%، ويحتوي على 56 جينًا موضحًا. كانت إحدى النتائج المهمة هي تحديد 514 تسلسلًا…
-
هندسة عقلانية للنوكليازات ذات المناعة الدنيا للعلاج الجيني
2025 | المؤلف: Rumya Raghavan وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “الطرق” يوضح الأساليب التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يتناول تصميم التجارب، بما في ذلك اختيار المواد، إعداد العينات، والبروتوكولات المحددة المتبعة لضمان القابلية للتكرار. كما يتم وصف الأساليب الإحصائية المستخدمة في تحليل البيانات، مع تسليط الضوء على التقنيات المستخدمة لتقييم الأهمية والمعايير المستخدمة لتفسير النتائج. بالإضافة إلى ذلك، قد يتضمن القسم معلومات عن النماذج…