الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الجينوم
-
مجموعة متعددة الممالك من 33,804 جينوم مرجعي للميكروبيوم المهبلي البشري
2024 | المؤلف: Liansha Huang وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)قسم “الطرق” في ورقة البحث يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في سؤال البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، متضمنة تحليلات إحصائية لتقييم البيانات المجمعة من تجارب مختلفة. شملت المنهجيات المحددة تجارب مختبرية محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لمراقبة تأثيراتها على النتائج ذات الأهمية. شمل جمع البيانات تدابير نوعية وكمية، مما يضمن فهمًا…
-
التسميد العضوي يختار بشكل مشترك جينات مقاومة المضادات الحيوية والمعادن (اللويد) المرتبطة جينياً في الميكروبيوم التربة العالمي
2024 | المؤلف: Ziteng Liu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التلوث (Pollution)يتناول هذا القسم من ورقة البحث التعايش بين جينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) وجينات مقاومة المعادن (MRGs) في النظم البيئية الزراعية المخصبة بالمواد العضوية. يكشف تحليل 511 ميتاجينوم للتربة الزراعية العالمية أن التخصيب العضوي مرتبط بزيادة ثلاثة أضعاف في تنوع الكتل الحاملة لجينات ARG-MRG (AMCCs)، مع تحديد 63 نوعًا في التربة العضوية مقارنة بـ 22…
-
دمج فعال للجينات الكبيرة في خلايا الثدييات عبر إعادة التركيب المتطورة باستمرار وتحرير الجينات الأساسي
2024 | المؤلف: Smriti Pandey وآخرون | المجلة: Nature Biomedical Engineering | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث طريقة مبتكرة تُسمى تحرير الجينات المعزز بمساعدة الفاجات (PASSIGE)، والتي تحسن بشكل كبير من التكامل المستهدف للجينات في الجينومات الثديية. تجمع هذه الطريقة بين قابلية برمجة التحرير الأساسي ودقة إعادة التركيب، مما يسمح بتكامل تسلسلات DNA كبيرة تتجاوز 10 كيلو بايت. تشير الدراسة إلى أن المتغيرات المطورة والمصممة من إعادة التركيب Bxb1 (evoBxb1…
-
vSNP: خط أنابيب SNP لتوليد مصفوفات SNP الشفافة وأشجار النشوء والتطور من مجموعات بيانات تسلسل الجينوم الكامل
2024 | المؤلف: Jessica Hicks وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تعتبر أنبوب vSNP أداة متخصصة تم تطويرها على مدار العقد الماضي لمعالجة التحديات الفريدة التي تواجهها المختبرات التشخيصية أثناء التحقيقات في تفشي الأمراض. تسهل تسلسل الجينوم الكامل بسرعة وتضمن التحقق من دقة التسلسل والتحقق منها عبر مختلف مسببات الأمراض. ينتج الأنبوب مخرجات سهلة الاستخدام، بما في ذلك مصفوفات SNP والأشجار النشوء والتطور، والتي تم تصميمها…
-
التحليل النشوي والجينوميات المقارنة لسلالات بروسيلة أبورتوس وبروسيلة ميلتينسيس في مصر
2024 | المؤلف: Alyaa Elrashedy وآخرون | المجلة: Journal of Molecular Evolution | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس هذه الدراسة الخصائص الجينومية لثمانية سلالات من *Brucella abortus* وثمانية عشر سلالة من *Brucella melitensis* من مصر، مقارنتها بلقاحات RB51 وREV1. باستخدام مجموعة أدوات RAST، تم توضيح الجينومات، كاشفة عن أطوال تبلغ 3,250,377 زوج قاعدي لـ *B. abortus* و3,285,803 زوج قاعدي لـ *B. melitensis*، مع عدد مشابه من الجينات المرشحة المحددة في سلالات *B.…
-
استكشاف بروتينات فيروس جدري القرود وتقنيات الكشف السريع
2024 | المؤلف: Kamila Sagdat وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: علم الفيروسات (Virology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على جدري القرود (mpox)، وهو مرض معدٍ تسببه فيروس جدري القرود (MPXV)، والذي يطرح تحديات تشخيصية كبيرة بسبب تشابه الأعراض مع عدوى أخرى. تؤكد المراجعة على مسببات المرض، وطرق الانتقال، والتجليات السريرية لجدري القرود، مع تسليط الضوء على أدوار البروتينات الفيروسية المختلفة، بما في ذلك فيروس مغلف خارج الخلية (EEV)…
-
جينومات خالية من الفجوات بين التيلوميرات تكشف عن رؤى حول تطور الفلفل وبيوسينثيس الكابسيسينويد
2024 | المؤلف: Weikai Chen وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علوم النبات (Plant Science)في هذه الدراسة، تم الحصول على المواد النباتية من خط C. annuum ثنائي الصبغيات ‘G1-36576’ والوصول البري C. rhomboideum ‘PI 645680’، المزروعة في بيئة دفيئة في معهد بكين للعلوم الزراعية المتقدمة خلال صيف وخريف 2022. تم حصاد أوراق طازجة من نباتات عمرها أربعة أسابيع لاستخراج الحمض النووي وتسلسله. بالإضافة إلى ذلك، تم جمع أنسجة مختلفة…
-
استراتيجيات أكورديون الجينوم لفيروس جدري القرود
2024 | المؤلف: Sara Monzón وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الفيروسات (Virology)في هذا القسم، يحدد المؤلفون نهجهم التجريبي للتحقيق في آثار المناطق ذات التعقيد المنخفض (LCRs) على الاستقرار، النسخ، والترجمة لإطارات القراءة المفتوحة الفيروسية (ORFs) في جينات محددة (OPG153، OPG204، وOPG208). لقد حددوا أن التغيرات في OPG204 وOPG208 تحدث بالقرب من المنطقة الطرفية N، مما يشير إلى دور محتمل في تنظيم تخليق البروتين. ومن الجدير بالذكر…
-
الجينوميات العميقة للطحالب الكبيرة تكشف عن مسارات متعددة نحو تعدد الخلايا المائية والضوئية
2024 | المؤلف: David R. Nelson وآخرون | المجلة: Molecular Plant | المجال: علم المحيطات (Oceanography)تستكشف هذه الدراسة التنوع الجينومي والآليات التطورية للتعدد الخلوي في الطحالب الكبيرة، والتي تعتبر ضرورية للحفاظ على المناخ ولها تطبيقات بيولوجية تكنولوجية هامة. من خلال تسلسل 110 جينوم من الطحالب الكبيرة من مناخات وفصائل مختلفة، حدد الباحثون ميزات جينومية مميزة تميز الطحالب الكبيرة عن نظيراتها من الطحالب الدقيقة. تشمل النتائج الرئيسية وجود جينات مرتبطة بالالتصاق…
-
مقاومة مضادات الميكروبات لنيسرية السيلان في أوروبا في عام 2020 مقارنة بعام 2013 و2018: دراسة رصد جينومي استعادية
2024 | المؤلف: Daniel Golparian وآخرون | المجلة: The Lancet Microbe | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تدرس الدراسة السكان السيلاني في المنطقة الاقتصادية الأوروبية (EEA) في عام 2020، مع التركيز على مقاومة المضادات الحيوية (AMR) وبيانات المرضى. باستخدام بيانات من برنامج المراقبة الأوروبية لمقاومة المضادات الحيوية للسيلان (Euro-GASP)، قام الباحثون بتحليل 1,932 عينة سيلانية من 21 دولة في المنطقة الاقتصادية الأوروبية، مقارنة النتائج مع بيانات من 2013 و2018. تم استخدام تسلسل…