الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الميتاجينوميات
-
فك شفرة الميكروبيوم المعوي لسمك العشب من خلال نهج متعدد الأوميات
2024 | المؤلف: Ming Li وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم المناعة (Immunology)تبحث الدراسة في الميكروبيوم المعوي لسمك العشب، مشددة على أهميته في تربية الأحياء المائية والحاجة الملحة للبدائل للمضادات الحيوية في علف الأسماك. من خلال تسلسل الميتاجينوم، حددت الدراسة 575,856 جين غير متكرر، كاشفة عن تركيبة ميكروبيوم معوي مميزة في سمك العشب مقارنة بالثدييات. صنفت تحليل التواجد المشترك الميكروبات إلى مجموعتين وظيفيتين: المجموعة الوظيفية 1 (Proteobacteria)…
-
تحسين توقعات بنية البروتينات الأحادية والمعقدة باستخدام DeepMSA2 مع بيانات الميتاجينوم الضخمة
2024 | المؤلف: Wei Zheng وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تم تقديم خط أنابيب DeepMSA2 كنهج جديد لبناء محاذاة متعددة التسلسلات الموحدة (MSAs) للبروتينات أحادية ومتعددة السلاسل، باستخدام بحث محاذاة تكراري عبر قواعد البيانات الجينومية والميتا جينومية. تشير الاختبارات الشاملة إلى أن MSAs التي تم إنشاؤها بواسطة DeepMSA2 تعزز بشكل كبير دقة توقعات الهيكل الثلاثي والرباعي للبروتين مقارنة بالطرق الحالية المتطورة. ومن الجدير بالذكر أنه…