الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الميتاجينوميات
-
استكشاف تحلل الحمض النووي في الموقع وفي تخزين المتاحف من خلال علم الجينوم والميتا جينوم
2025 | المؤلف: Anne Eriksen وآخرون | المجلة: Communications Biology | المجال: الحفظ (Conservation)في هذه الدراسة، قمنا بفحص تدهور الحمض النووي للعظام على مدى 43 عامًا تحت حالتين متميزتين: في الموقع وداخل مجموعة متحفية. شمل تحقيقنا التصنيف الضريبي للميكروبيوم العظمي، وفحص إنزيمات تدهور العظام، وتحليل أنماط تلف الحمض النووي لتقييم صلاحية البكتيريا الموجودة. أشارت النتائج إلى أن الحمض النووي من العظام التي تُركت في الموقع أظهر حفظًا أفضل…
-
الخصائص السريرية وتوقع شدة المرض في عدوى الكلاميديا psittaci بناءً على تسلسل الجينوم التالي
2025 | المؤلف: Mingzhu Huang وآخرون | المجلة: Infection and Drug Resistance | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تدرس الدراسة التهاب رئة الطيور، وهو عدوى حيوانية المنشأ تسببها *Chlamydia psittaci*، مع التركيز على مظاهره السريرية وتوقع شدته. أجريت في مقاطعة تشجيانغ، الصين، من يناير 2021 إلى أبريل 2024، حيث قامت البحث بتحليل بيانات من 110 مرضى تم تشخيصهم، وكشفت عن متوسط عمر يبلغ 62 عامًا. كانت الأمراض المصاحبة الأكثر شيوعًا تشمل ارتفاع ضغط…
-
استطلاع عالمي للميتابولوميات وتحليلات جينومية متعمقة لـ Ruminococcus gnavus تكشف عن اختلافات عبر أنماط حياة المضيف وحالة الصحة
2025 | المؤلف: Sam Nooij وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تبحث هذه الدراسة في بكتيريا الأمعاء Ruminococcus gnavus، التي تتواجد بشكل شائع في أكثر من 90% من الأفراد الأصحاء ولكنها مرتبطة أيضًا بالأمراض الالتهابية المزمنة، وخاصة مرض كرون. قامت الدراسة بتحليل 12,791 ميتاجينوم معوي، مؤكدة الروابط المعروفة مع الأمراض الأيضية ومرض الأمعاء الالتهابي، بينما كشفت عن انتشار أعلى لـ R. gnavus في السكان الغربيين ووفرة…
-
زراعة الميكروبات المستهدفة الموجهة بواسطة الميتاجينوم
2025 | المؤلف: Jeremy Armetta وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على أنواع مختلفة مصنفة تحت ترتيب Clostridiales، وبشكل خاص تلك التي تم تحديدها على أنها “أنواع غير مؤكدة”، مما يشير إلى عدم اليقين في تصنيفها الضريبي. تسرد عدة إدخالات مع بيانات وصفية مرتبطة، بما في ذلك الإشارات إلى سلالات أو أنواع محددة، مثل “mO TU v25 125 16” و “mO…
-
تسلسل الميكروبات في الحياة المبكرة في الأمعاء يتبع أنماطًا شائعة في البشر حول العالم
2025 | المؤلف: Guilherme Fahur Bottino وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “الطرق” يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون نهجًا كميًا، حيث قاموا بتطبيق التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لملاحظة تأثيراتها على النتائج ذات الأهمية. شملت جمع البيانات استخدام أدوات موحدة لضمان الموثوقية والصلاحية، مع التركيز…
-
نمو الميكروبات في أنماط الحياة التنافسية يعزز زيادة الجينات المقاومة للمضادات الحيوية في ميكروبات التربة: رؤى مستندة إلى الصفات الجينية
2025 | المؤلف: Zishu Liu وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: التلوث (Pollution)تبحث الدراسة في ديناميات جينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) داخل المجتمعات الميكروبية في التربة تحت تركيزات متغيرة من المضاد الحيوي أوكسي تتراسيكلين (OTC). باستخدام زراعة الميكروكوزم وعلم الجينوميات الميتاجينية، تكشف الدراسة أن وفرة وغنى ARGs تظهر علاقة غير أحادية مع تركيز المضاد الحيوي، حيث تصل إلى ذروتها عند مستويات متوسطة (0.1 و 0.5 ملغ/ل). ومن…
-
تدفق جينات مقاومة المضادات الحيوية الإقليمية بين قطاعات الصحة الواحدة في الصين
2025 | المؤلف: Yuqing Feng وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: التلوث (Pollution)تبحث هذه الدراسة في انتقال جينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) عبر القطاعات البشرية والغذائية والبيئية في دينغفنج، مقاطعة خنان، الصين، باستخدام تسلسل الميتاجينوم واسع النطاق جنبًا إلى جنب مع زراعة عزلات بكتيرية مقاومة من 592 عينة. تم تحديد ما مجموعه 40 نوعًا من ARG و743 نوعًا فرعيًا، مع انتشار ملحوظ لجينات المقاومة المتعددة. تشير النتائج…
-
آثار تحويل البيانات واختيار النموذج على أهمية الميزات في بيانات تصنيف الميكروبيوم
2025 | المؤلف: Zuzanna Karwowska وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يناقش المؤلفون أهمية تصنيف الأنماط الظاهرة للمضيف بدقة من بيانات الميكروبيوم لتعزيز العلاجات المعتمدة على الميكروبيوم، مع تسليط الضوء على التحديات التي تطرحها تعقيدات الميكروبيوم المعوي، وندرة البيانات، والتركيب، والخصوصية السكانية. يؤكدون أنه بينما يمكن أن تخفف تحولات بيانات الميكروبيوم من بعض هذه التحديات، فإن تطبيقها في مهام التعلم الآلي لا يزال…
-
الحليب غير المبستر يعزز الاستعمار المبكر والثبات لأنواع Lactobacillus في العجول الحلوب مما يعزز ميكروبيوم الأمعاء الخلفية المستقر
2025 | المؤلف: Shengnan Qiu وآخرون | المجلة: Animal Advances | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس هذه الدراسة آثار الحليب المبستر مقابل الحليب غير المبستر على أداء النمو وميكروبيوم الأمعاء الخلفية للعجول، مع التركيز على الآثار طويلة الأجل على تطوير ميكروبات الأمعاء. تم إجراء تحليل طولي يشمل 15 عجلاً حديث الولادة على مدار شهرهم الأول، باستخدام تقنيات التسلسل عالي الإنتاج وزراعة الميكروبات. تشير النتائج إلى أنه بينما لا يؤثر الحليب…
-
التنوع والبيوجغرافيا للميكروبيوم البكتيري في الجداول المغذية من الأنهار الجليدية
2025 | المؤلف: Leïla Ezzat وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم البيئة (Ecology)تشير النتائج من تحليل تقسيم التباين لميكروبيوم GFS إلى أن النموذج قد غطى 54.9% من إجمالي التباين في تركيب الميكروبيوم. تم هيكلة هذا التباين مكانيًا عبر مقاييس مختلفة، مع مساهمات محددة من التدرجات الخطية (15.9%، $F_{3,134}=9.8$، $p=0.001$)، بين سلاسل الجبال (20.8%، $F_{9,131}=5.97$، $p=0.001$)، وداخل سلاسل الجبال (16.4%، $F_{60,122}=1.7$، $p=0.001$). من الجدير بالذكر أن العمليات المكانية…
