الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الميتاجينوم
-
تحليل ميتاجينومي مقارن للميكروبيوم الفموي في مرضى COVID-19 والأفراد الأصحاء
2025 | المؤلف: Piyush Bhanu وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تبحث الدراسة في تأثير COVID-19، الناجم عن SARS-CoV-2، على الميكروبيوم الفموي، كاشفة عن تغييرات كبيرة في التنوع والتركيبة الميكروبية بين الأفراد المصابين مقارنةً بالضوابط الصحية. أظهرت تسلسلات الميتاجينوم تقليلاً في التنوع الميكروبي، يتميز بانخفاض التنوع ألفا وملفات تنوع بيتا مميزة، إلى جانب زيادة انتشار مسببات الأمراض الانتهازية. حدد تحليل الميكروبيوم الأساسي أنواعًا فريدة قد تكون…
-
تباين مستوى السلالة بين Lactobacillus crispatus وLactobacillus iners كما تم تحديده بواسطة الميتاجينوميات المقارنة
2025 | المؤلف: Sai Ravi Chandra Nori وآخرون | المجلة: npj Biofilms and Microbiomes | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تدرس الدراسة الميكروبيوم المهبلي للنساء الحوامل في أيرلندا، مع التركيز على نظامه البيئي ذو التنوع المنخفض الذي يهيمن عليه بشكل أساسي أنواع اللاكتوباسيلس، وخاصة اللاكتوباسيلس كريسباتوس واللاكتوباسيلس إينيرس. باستخدام تسلسل الشوتغن لتحليل 354 ميتاجينوم مهبلي، تحدد الأبحاث أنواعًا فرعية مختلفة وتؤكد على أهمية التباين على مستوى السلالة في فهم آليات الاستعمار وتفاعلات المضيف والميكروب. تشمل…
-
التوافق الجيني والترابط البيئي يدفعان انتشار جينات مقاومة المضادات الحيوية
2025 | المؤلف: David Lund وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطب الجزيئي (Molecular Medicine)تسلط الأبحاث الضوء على القضية الحرجة لجينات مقاومة المضادات الحيوية المتنقلة (ARGs) التي تنتشر من خلال النقل الجيني الأفقي (HGT)، مما يشكل تهديدًا كبيرًا للصحة العامة العالمية. تهدف الدراسة إلى توضيح العوامل الجينية والبيئية التي تسهل نقل ARG بنجاح، باستخدام نهج تطوري لتحليل حوالي 1 مليون جينوم بكتيري. تم تكملة هذا التحليل بأكثر من 20,000…
-
التحديات في التقاط الميكروبيوم الفطري من بيانات الميتاجينوم الشامل: نقص البرمجيات وقواعد البيانات
2025 | المؤلف: Ekaterina Avershina وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة الحالة الحالية لأدوات المعلوماتية الحيوية لتوصيف الميكروبيوم الفطري، وهو المكون الفطري للميكروبيوم المعوي، باستخدام بيانات ميتاجينومية محاكاة. قام المؤلفون بتقييم سبعة أدوات لتعيين التصنيف التسلسلي للفطريات، باستثناء أداة واحدة قديمة تتطلب تعديلات كبيرة. قاموا بإنشاء 18 مجتمعًا وهميًا بتنوع في غنى الأنواع ووفرتها، تضم ما يصل إلى 165 نوعًا من الفطريات من شُعبتي…
-
استطلاع عالمي للميتابولوميات وتحليلات جينومية متعمقة لـ Ruminococcus gnavus تكشف عن اختلافات عبر أنماط حياة المضيف وحالة الصحة
2025 | المؤلف: Sam Nooij وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تبحث هذه الدراسة في بكتيريا الأمعاء Ruminococcus gnavus، التي تتواجد بشكل شائع في أكثر من 90% من الأفراد الأصحاء ولكنها مرتبطة أيضًا بالأمراض الالتهابية المزمنة، وخاصة مرض كرون. قامت الدراسة بتحليل 12,791 ميتاجينوم معوي، مؤكدة الروابط المعروفة مع الأمراض الأيضية ومرض الأمعاء الالتهابي، بينما كشفت عن انتشار أعلى لـ R. gnavus في السكان الغربيين ووفرة…
-
الميكروبيومات البذرية تعزز إنبات بذور Astragalus mongholicus من خلال قمع مسببات الأمراض وتحلل السليلوز
2025 | المؤلف: Da Li وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علوم النبات (Plant Science)تستكشف الدراسة دور الميكروبات المرتبطة بالبذور في إنبات *Astragalus mongholicus* ومقاومة الأمراض. باستخدام تسلسل الميتاجينوم الأمبليكون والطلقات، تكشف الأبحاث أن إنبات البذور يزيد بشكل كبير من تنوع الميكروبات، بشكل أساسي من خلال تمايز النطاق البيئي. يتم إثراء البكتيريا المفيدة مثل *Pseudomonas* و *Pantoea* في البذور المنبتة، بينما يكون الممرض *Fusarium* أكثر انتشارًا في البذور غير…
-
زراعة الميكروبات المستهدفة الموجهة بواسطة الميتاجينوم
2025 | المؤلف: Jeremy Armetta وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على أنواع مختلفة مصنفة تحت ترتيب Clostridiales، وبشكل خاص تلك التي تم تحديدها على أنها “أنواع غير مؤكدة”، مما يشير إلى عدم اليقين في تصنيفها الضريبي. تسرد عدة إدخالات مع بيانات وصفية مرتبطة، بما في ذلك الإشارات إلى سلالات أو أنواع محددة، مثل “mO TU v25 125 16” و “mO…
-
تسلسل الميكروبات في الحياة المبكرة في الأمعاء يتبع أنماطًا شائعة في البشر حول العالم
2025 | المؤلف: Guilherme Fahur Bottino وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “الطرق” يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون نهجًا كميًا، حيث قاموا بتطبيق التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لملاحظة تأثيراتها على النتائج ذات الأهمية. شملت جمع البيانات استخدام أدوات موحدة لضمان الموثوقية والصلاحية، مع التركيز…
-
الديناميات البيئية لعائلة الإشريكية في ميكروبيوم الأمعاء البشرية عبر السكان العالميين
2025 | المؤلف: Qi Yin وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في الديناميات البيئية لبكتيريا الأمعاء من عائلة Enterobacteriaceae، والتي تُعتبر مساهمًا مهمًا في العدوى الانتهازية على مستوى العالم. باستخدام مجموعة بيانات شاملة تضم 12,238 ميتاجينوم بشري من 45 دولة، تستخدم الدراسة تقنيات التعلم الآلي لتحديد بصمة ميكروبيوم الأمعاء المتسقة المرتبطة باستعمار Enterobacteriaceae عبر حالات صحية ومناطق جغرافية مختلفة. تصنف التحليلات 172 نوعًا ميكروبيًا…
-
آثار تحويل البيانات واختيار النموذج على أهمية الميزات في بيانات تصنيف الميكروبيوم
2025 | المؤلف: Zuzanna Karwowska وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يناقش المؤلفون أهمية تصنيف الأنماط الظاهرة للمضيف بدقة من بيانات الميكروبيوم لتعزيز العلاجات المعتمدة على الميكروبيوم، مع تسليط الضوء على التحديات التي تطرحها تعقيدات الميكروبيوم المعوي، وندرة البيانات، والتركيب، والخصوصية السكانية. يؤكدون أنه بينما يمكن أن تخفف تحولات بيانات الميكروبيوم من بعض هذه التحديات، فإن تطبيقها في مهام التعلم الآلي لا يزال…
