الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الميتاجينوم
-
استخدام المضادات الحيوية وتركيب الميكروبيوم المعوي من بيانات وصفات الأفراد لـ 14,979 فرد
2026 | المؤلف: Gabriel Baldanzi وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة العلاقة بين استخدام المضادات الحيوية وتنوع الميكروبيوم المعوي، كاشفة أن كل من الاستخدام الحديث والقديم للمضادات الحيوية يرتبط بتقليل تنوع الأنواع. لتحديد المتغيرات المناسبة للنمذجة الإحصائية، طور الباحثون رسمين بيانيين موجهين غير دائريين (DAGs). ركز نموذج DAG الأساسي على المتغيرات المستقرة زمنياً مثل العمر، الجنس، التعليم، حالة التدخين، وبلد الميلاد، بينما دمج نموذج…
-
تجميع عالي الجودة للميتا جينوم من قراءات النانو بورا باستخدام nanoMDBG
2026 | المؤلف: Gaëtan Benoit وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم التقدم في تجميع الميتاجينوم الذي يسهل استخدام تقنيات التسلسل الطويلة من الجيل الثالث، مع تسليط الضوء بشكل خاص على قدرات PacBio HiFi وتقنيات أكسفورد نانوبور (ONT). تُعرف قراءات PacBio HiFi بدقتها العالية، مما يمكن من إنتاج مئات من الجينومات المجمعة من الميتاجينوم شبه الكاملة (MAGs) من عينة واحدة. في الوقت نفسه، أدت…
-
التحليلات الميتاجينومية للبلستسفير تكشف عن إمكانات وظيفية شائعة عبر المحيطات
2026 | المؤلف: Stefan Lips وآخرون | المجلة: Environmental Pollution | المجال: التلوث (Pollution)تبحث هذه الدراسة في المجتمعات الميكروبية المرتبطة بالحطام البلاستيكي في المحيطات، والمعروفة باسم “البلاستيسفير”. من خلال تحليل الميتاجينومات البكتيرية المحللة جينومياً من بقع القمامة في شمال الأطلسي وشمال الهادئ، تكشف الدراسة أن هذه المجتمعات تظهر إمكانات جينية مميزة مقارنة بالبلانكتون المحيط. ومن الجدير بالذكر أن البلاستيسفير تحتوي على عدد أكبر من الجينات المشفرة، وأحجام جينومية…
-
إزالة النيتروجين هي سمة مجتمعية مع مسارات جزئية تهيمن عبر الجينومات والبيئات الميكروبية
2025 | المؤلف: Grace Pold وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التلوث (Pollution)قسم “الطرق” في ورقة البحث يوضح الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة مزيجًا من الأساليب الكمية والنوعية، بما في ذلك التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات المجمعة من تجارب مختلفة. تم تنفيذ منهجيات محددة، مثل التجارب المسيطر عليها، الاستطلاعات، أو المحاكاة، لضمان موثوقية وصلاحية النتائج. تم تحليل البيانات باستخدام برامج إحصائية مناسبة، مع…
-
الجينات المقاومة للمضادات الحيوية في التربة العالمية مرتبطة بزيادة المخاطر والترابط مع مقاومة البشر
2025 | المؤلف: Yuxiang Zhao وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التلوث (Pollution)تسلط هذه القسم من ورقة البحث الضوء على الدور الحاسم للتربة كمستودع لجينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) وتأثيراتها على صحة الإنسان ضمن إطار الصحة الواحدة. تحلل الدراسة مجموعة بيانات كبيرة تتكون من 3,965 عينة ميتاجينومية من موائل مختلفة، بما في ذلك التربة والبراز والمياه العادمة، إلى جانب 8,388 جينوم لعزلات *Escherichia coli*. تشير النتائج إلى…
-
مقاومة الأغذية تتشكل من خلال بيئات المعالجة والإنتاج
2025 | المؤلف: Narciso M. Quijada وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط ورقة البحث الضوء على الدور الهام لأسطح الاتصال بالطعام (FCSs) في انتشار جينات مقاومة المضادات الحيوية (AMRGs) داخل منشآت إنتاج اللحوم والألبان. تكشف الدراسة أن بيئات إنتاج اللحوم تظهر تباينًا كبيرًا في عمليات التصنيع وأنواع المنتجات النهائية، مما يؤدي إلى ملفات مقاومة مميزة. ومن الجدير بالذكر أن المواد الخام أظهرت انتشارًا أقل لجينات AMRGs…
-
تسلسل طويل القراءة مع تحديد الجينوم يوسع التنوع الميكروبي المعروف عبر المواطن الأرضية
2025 | المؤلف: Mantas Sereika وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على التقدمات الكبيرة التي جعلها تسلسل الحمض النووي طويل القراءة وعالي الإنتاجية ممكنة في استعادة الجينومات الميكروبية من عينات بيئية معقدة. من خلال تسلسل نانوبور العميق وطويل القراءة لـ 154 عينة من التربة والرواسب من مشروع Microflora Danica، نجح المؤلفون في تحديد جينومات من 15,314 نوعًا ميكروبيًا لم يتم وصفه سابقًا. استخدمت…
-
اختلال ميكروبيوم الفم لدى النساء اللاتي لديهن تاريخ من فقدان الحمل: دراسة مقطعية ميتاجينومية
2025 | المؤلف: Ling Liu وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تبحث هذه الدراسة في العلاقة بين الميكروبيوم الفموي وفقدان الحمل بين النساء في سن الإنجاب، وهي حالة تؤثر بشكل كبير على الخصوبة والصحة النفسية. شملت الدراسة 182 امرأة، مقسمة إلى مجموعتين: أولئك الذين لديهم تاريخ من فقدان الحمل (عدد = 70) ومجموعة ضابطة بدون نتائج حمل سلبية (عدد = 112). كشفت التحليلات الميتاجينومية لعينات الغشاء…
-
الرضاعة الطبيعية والت colonization الميكروبي المدفوع بواسطة بيفيدوبكتيريوم في مرحلة مبكرة تشكل مقاومة الأمعاء لدى الرضع
2025 | المؤلف: Anna Samarra وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)تجمع مقاومة الأمعاء خلال الحياة المبكرة أمر حاسم لصحة الرضع، حيث أن عوامل معينة حول الولادة مثل الولادة القيصرية (C-section)، التعرض للمضادات الحيوية، وعدم الرضاعة الطبيعية تؤثر سلبًا على تطور الميكروبات وتزيد من جينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs). قامت هذه الدراسة بتحليل 265 ميتاجينوم أمعائي طولي من 66 زوجًا من الأمهات والرضع لتقييم كيفية تأثير…
-
مؤشرات حيوية جديدة محتملة للتنبؤ بتسوس الأسنان في الطفولة عبر التحليل الميتاجينومي
2025 | المؤلف: Hui Zhang وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تبحث الدراسة في دور الميكروبيوم الفموي في تطور تسوس الأسنان بين الأطفال، وهو مصدر قلق صحي عالمي كبير. باستخدام التحليل الميتاجينومي، تم تصنيف عينات اللعاب من 241 طفلاً تتراوح أعمارهم بين 6 إلى 9 سنوات إلى مجموعات خالية من التسوس (CF)، منخفضة التسوس (CL)، وشديدة التسوس (CS). وجدت الدراسة اختلافات ملحوظة في تركيب المجتمع الميكروبي،…