الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الميتاجينوم
-
نهج متكامل لمراقبة مسببات الأمراض وتحليل الميتاجينوم بالأسلوب الشامل في تربية سمك السلمون الأطلسي
2026 | المؤلف: Ottavia Benedicenti وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم المناعة (Immunology)تقدم الدراسة سير عمل قابل للنشر في الميدان مصمم لاكتشاف مسببات الأمراض المائية في تربية الأحياء المائية، مع التركيز بشكل خاص على إنتاج السلمون الأطلسي. يدمج هذا السير عمل الحمض النووي البيئي (eDNA) وترشيح الحمض النووي الريبي البيئي (eRNA) مع PCR الكمي العكسي المستهدف (RT-qPCR) والميتاباركويدينغ. كان الهدف الأساسي هو تقييم جدوى وأداء هذا النهج…
-
تسلسل الحمض النووي الميتاجينومي باستخدام تقنية النانو بورت الطويلة لمراقبة التنوع البيولوجي في الأنهار والحياة البرية والتلوث والصحة البيئية
2026 | المؤلف: Orestis Nousias وآخرون | المجلة: NAR Genomics and Bioinformatics | المجال: علم البيئة (Ecology)تناقش هذه القسم الحاجة الملحة لمراقبة التنوع البيولوجي وظهور الأمراض المعدية في سياق ارتفاع درجات الحرارة العالمية ونمو السكان البشر. يقترح المؤلفون استخدام تسلسل الميتاجينوم الطويل القراءة من الحمض النووي البيئي (eDNA) كاختبار شامل لتقييم تنوع الأنواع عبر شجرة الحياة، من الفيروسات إلى الكائنات متعددة الخلايا المعقدة، تحديدًا ضمن نظام نهر أفوكا في مقاطعة ويكلو،…
-
مانان الكبريتات من الدياتومات يختار ميكروبيوتا محددة للمضيف في المحيط المشمس
2026 | المؤلف: Joris Krull وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم المحيطات (Oceanography)تسلط هذه الفقرة من البحث الضوء على دور الدياتومات، وهي شعبة حيوية في نظم الأرض البيئية، في إنتاج الأكسجين وثبيت ثاني أكسيد الكربون، مما يدعم شبكات الغذاء العالمية. تبحث الدراسة في كيفية استقطاب الدياتومات الانتقائي للبروكاريوتات ذات الخصائص الأيضية التكميلية، كاشفةً أنها تطلق α-1,3-mannan مضاف إليه سلفيت C6 يعمل كمصدر كربون انتقائي للبكتيريا Polaribacter. تم…
-
استخدام المضادات الحيوية وتركيب الميكروبيوم المعوي من بيانات وصفات الأفراد لـ 14,979 فرد
2026 | المؤلف: Gabriel Baldanzi وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة العلاقة بين استخدام المضادات الحيوية وتنوع الميكروبيوم المعوي، كاشفة أن كل من الاستخدام الحديث والقديم للمضادات الحيوية يرتبط بتقليل تنوع الأنواع. لتحديد المتغيرات المناسبة للنمذجة الإحصائية، طور الباحثون رسمين بيانيين موجهين غير دائريين (DAGs). ركز نموذج DAG الأساسي على المتغيرات المستقرة زمنياً مثل العمر، الجنس، التعليم، حالة التدخين، وبلد الميلاد، بينما دمج نموذج…
-
تجميع عالي الجودة للميتا جينوم من قراءات النانو بورا باستخدام nanoMDBG
2026 | المؤلف: Gaëtan Benoit وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم التقدم في تجميع الميتاجينوم الذي يسهل استخدام تقنيات التسلسل الطويلة من الجيل الثالث، مع تسليط الضوء بشكل خاص على قدرات PacBio HiFi وتقنيات أكسفورد نانوبور (ONT). تُعرف قراءات PacBio HiFi بدقتها العالية، مما يمكن من إنتاج مئات من الجينومات المجمعة من الميتاجينوم شبه الكاملة (MAGs) من عينة واحدة. في الوقت نفسه، أدت…
-
التحليلات الميتاجينومية للبلستسفير تكشف عن إمكانات وظيفية شائعة عبر المحيطات
2026 | المؤلف: Stefan Lips وآخرون | المجلة: Environmental Pollution | المجال: التلوث (Pollution)تبحث هذه الدراسة في المجتمعات الميكروبية المرتبطة بالحطام البلاستيكي في المحيطات، والمعروفة باسم “البلاستيسفير”. من خلال تحليل الميتاجينومات البكتيرية المحللة جينومياً من بقع القمامة في شمال الأطلسي وشمال الهادئ، تكشف الدراسة أن هذه المجتمعات تظهر إمكانات جينية مميزة مقارنة بالبلانكتون المحيط. ومن الجدير بالذكر أن البلاستيسفير تحتوي على عدد أكبر من الجينات المشفرة، وأحجام جينومية…
-
التنوع والأدوار البيئية للاعبين الفيروسي المخفيين في الميكروبيومات المائية الجوفية
2026 | المؤلف: Akbar Adjie Pratama وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم البيئة (Ecology)تدرس هذه الدراسة الفيروسات في نظم البيئات المائية الجوفية، والتي تتميز بمجتمعات ميكروبية فريدة تتكيف مع ظروف نقص الطاقة والضوء. من خلال تحليل 1.24 تيرابايت من بيانات الميتاجينوم والميتاترنسكريبتوم من سبعة آبار في منطقة هاينيش الحرجة الاستكشافية (CZE)، حدد الباحثون 257,252 وحدة تصنيفية فيروسية تشغيلية (vOTUs) لا تقل عن 5 كيلو بايت، مع كون 99%…
-
انتشار جينات مقاومة المضادات الحيوية في أنظمة معالجة مياه الصرف المختلفة والتربة المروية بالمياه العادمة من خلال التحليل الميتاجيني
2026 | المؤلف: Hua Fang وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: التلوث (Pollution)تدرس الدراسة انتشار ونقل جينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) في أنظمة معالجة مياه الصرف الصحي (WWTS) وتأثيرها على التربة عند استخدام المياه المعاد تدويرها للري. تم جمع عينات من عمليتي WWTS – “AB+AAO” و “AAO+MBR” – عبر مواسم مختلفة. كشفت تسلسلات الميتاجينوم أن الأنواع الرئيسية من ARGs التي تم تحديدها تشمل مقاومة متعددة الأدوية، والتتراسيكلين،…
-
تدرجات مقاومة الميكروبات والفيروسات عبر الفئات الهيكلية لميكروبيوم سرطان القولون والمستقيم
2026 | المؤلف: AbdulAziz Ascandari وآخرون | المجلة: npj Biofilms and Microbiomes | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في العلاقة بين الميكروبيوم المعوي وسرطان القولون والمستقيم (CRC) من خلال إجراء تحليل ميتاجينومي قائم على التجميع لأكثر من 500 عينة من ثلاث مجموعات جغرافية متميزة. تحدد الدراسة تدرجين وظيفيين كامنَين مهمين يتعلقان بمقاومة المضادات الحيوية وعوامل الضراوة من خلال إطار نمذجة معتمد على التحقق المتبادل باستخدام تحليل المربعات الصغرى الجزئية (PLS). يتميز…
-
إزالة النيتروجين هي سمة مجتمعية مع مسارات جزئية تهيمن عبر الجينومات والبيئات الميكروبية
2025 | المؤلف: Grace Pold وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التلوث (Pollution)قسم “الطرق” في ورقة البحث يوضح الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة مزيجًا من الأساليب الكمية والنوعية، بما في ذلك التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات المجمعة من تجارب مختلفة. تم تنفيذ منهجيات محددة، مثل التجارب المسيطر عليها، الاستطلاعات، أو المحاكاة، لضمان موثوقية وصلاحية النتائج. تم تحليل البيانات باستخدام برامج إحصائية مناسبة، مع…
