الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الميتاجينوم
-
التحليل الميتاجينومي لعينات البشر والحيوانات والبيئة يكشف عن مسببات الأمراض الناشئة المحتملة، ويحدد جينات مقاومة المضادات الحيوية، ويكشف عن ديناميات نقل الجينات الأفقي
2025 | المؤلف: Rajindra Napit وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث ورقة البحث في انتشار وانتقال مقاومة المضادات الحيوية (AMR) في مستوطنة مؤقتة في كاتماندو، نيبال، مع التأكيد على ضرورة اتباع نهج الصحة الواحدة الذي يدمج صحة الإنسان والحيوان والبيئة. باستخدام الميتاجينوميات الشاملة، قامت الدراسة بتحليل عينات براز بشرية وطيور، بالإضافة إلى عينات بيئية، كاشفة عن شبكة معقدة من البكتيريا المسببة للأمراض، وعوامل الضراوة (VFs)،…
-
تحليل ميتاجينومي مقارن للميكروبيوم الفموي في مرضى COVID-19 والأفراد الأصحاء
2025 | المؤلف: Piyush Bhanu وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تبحث الدراسة في تأثير COVID-19، الناجم عن SARS-CoV-2، على الميكروبيوم الفموي، كاشفة عن تغييرات كبيرة في التنوع والتركيبة الميكروبية بين الأفراد المصابين مقارنةً بالضوابط الصحية. أظهرت تسلسلات الميتاجينوم تقليلاً في التنوع الميكروبي، يتميز بانخفاض التنوع ألفا وملفات تنوع بيتا مميزة، إلى جانب زيادة انتشار مسببات الأمراض الانتهازية. حدد تحليل الميكروبيوم الأساسي أنواعًا فريدة قد تكون…
-
تباين مستوى السلالة بين Lactobacillus crispatus وLactobacillus iners كما تم تحديده بواسطة الميتاجينوميات المقارنة
2025 | المؤلف: Sai Ravi Chandra Nori وآخرون | المجلة: npj Biofilms and Microbiomes | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تدرس الدراسة الميكروبيوم المهبلي للنساء الحوامل في أيرلندا، مع التركيز على نظامه البيئي ذو التنوع المنخفض الذي يهيمن عليه بشكل أساسي أنواع اللاكتوباسيلس، وخاصة اللاكتوباسيلس كريسباتوس واللاكتوباسيلس إينيرس. باستخدام تسلسل الشوتغن لتحليل 354 ميتاجينوم مهبلي، تحدد الأبحاث أنواعًا فرعية مختلفة وتؤكد على أهمية التباين على مستوى السلالة في فهم آليات الاستعمار وتفاعلات المضيف والميكروب. تشمل…
-
التوافق الجيني والترابط البيئي يدفعان انتشار جينات مقاومة المضادات الحيوية
2025 | المؤلف: David Lund وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الطب الجزيئي (Molecular Medicine)تسلط الأبحاث الضوء على القضية الحرجة لجينات مقاومة المضادات الحيوية المتنقلة (ARGs) التي تنتشر من خلال النقل الجيني الأفقي (HGT)، مما يشكل تهديدًا كبيرًا للصحة العامة العالمية. تهدف الدراسة إلى توضيح العوامل الجينية والبيئية التي تسهل نقل ARG بنجاح، باستخدام نهج تطوري لتحليل حوالي 1 مليون جينوم بكتيري. تم تكملة هذا التحليل بأكثر من 20,000…
-
التحديات في التقاط الميكروبيوم الفطري من بيانات الميتاجينوم الشامل: نقص البرمجيات وقواعد البيانات
2025 | المؤلف: Ekaterina Avershina وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة الحالة الحالية لأدوات المعلوماتية الحيوية لتوصيف الميكروبيوم الفطري، وهو المكون الفطري للميكروبيوم المعوي، باستخدام بيانات ميتاجينومية محاكاة. قام المؤلفون بتقييم سبعة أدوات لتعيين التصنيف التسلسلي للفطريات، باستثناء أداة واحدة قديمة تتطلب تعديلات كبيرة. قاموا بإنشاء 18 مجتمعًا وهميًا بتنوع في غنى الأنواع ووفرتها، تضم ما يصل إلى 165 نوعًا من الفطريات من شُعبتي…
-
التسربات الباردة هي نقاط ساخنة محتملة لفقدان النيتروجين في أعماق البحار مدفوعة بالميكروبات عبر 21 شعبة
2025 | المؤلف: Qiuyun Jiang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الكيمياء البيئية (Environmental Chemistry)تسلط هذه القسم من ورقة البحث الضوء على أهمية توافر النيتروجين الحيوي في الإنتاجية المحيطية والدورات البيوجيوكيميائية العالمية، لا سيما في التسربات الباردة في أعماق البحار. تبحث الدراسة في عمليات فقدان النيتروجين، مع التركيز على البكتيريا المنزعة للنيتروجين والبكتيريا المؤكسدة للأمونيا اللاهوائية (أناموكس)، والتي لا تفهم جيدًا في هذه البيئات. من خلال مجموعة من القياسات…
-
استطلاع عالمي للميتابولوميات وتحليلات جينومية متعمقة لـ Ruminococcus gnavus تكشف عن اختلافات عبر أنماط حياة المضيف وحالة الصحة
2025 | المؤلف: Sam Nooij وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تبحث هذه الدراسة في بكتيريا الأمعاء Ruminococcus gnavus، التي تتواجد بشكل شائع في أكثر من 90% من الأفراد الأصحاء ولكنها مرتبطة أيضًا بالأمراض الالتهابية المزمنة، وخاصة مرض كرون. قامت الدراسة بتحليل 12,791 ميتاجينوم معوي، مؤكدة الروابط المعروفة مع الأمراض الأيضية ومرض الأمعاء الالتهابي، بينما كشفت عن انتشار أعلى لـ R. gnavus في السكان الغربيين ووفرة…
-
الديناميات الطولية للفيروسات والبكتيريا في ميكروبيوم الأمعاء في الحياة المبكرة
2025 | المؤلف: Michael J. Tisza وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “طرق” في ورقة البحث يوضح تصميم التجربة والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في سؤال البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لملاحظة آثارها على النتائج ذات الأهمية. شمل جمع البيانات استخدام أدوات وبروتوكولات موحدة لضمان…
-
الميكروبيومات البذرية تعزز إنبات بذور Astragalus mongholicus من خلال قمع مسببات الأمراض وتحلل السليلوز
2025 | المؤلف: Da Li وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علوم النبات (Plant Science)تستكشف الدراسة دور الميكروبات المرتبطة بالبذور في إنبات *Astragalus mongholicus* ومقاومة الأمراض. باستخدام تسلسل الميتاجينوم الأمبليكون والطلقات، تكشف الأبحاث أن إنبات البذور يزيد بشكل كبير من تنوع الميكروبات، بشكل أساسي من خلال تمايز النطاق البيئي. يتم إثراء البكتيريا المفيدة مثل *Pseudomonas* و *Pantoea* في البذور المنبتة، بينما يكون الممرض *Fusarium* أكثر انتشارًا في البذور غير…
-
يمكن أن تؤدي الجينومات البشرية المرجعية غير المكتملة إلى تحيزات جنسية خاطئة وكشف معلومات تعريف المرضى في بيانات الميتاجينوم
2025 | المؤلف: Caitlin Guccione وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)في هذا القسم، قام المؤلفون بتقييم فعالية ثلاث طرق لتصفية المضيف على عينات مختلفة من الكتلة الحيوية الميكروبية، بما في ذلك بيانات الإكسوم البشري وعينات الميتاجينوم من الأنسجة والجلد والبراز. قاموا بتحليل 30 عينة من تسلسل الإكسوم البشري من مورد عينات الجينوم الدولي (IGSR) ووجدوا أن الطريقة 2 كانت الأكثر فعالية، حيث تركت أقل عدد…