الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: بروتيوميات
-
يتيح InstaNovo تسلسل الببتيدات الجديد المدعوم بالانتشار في تجارب البروتيوميات على نطاق واسع
2025 | المؤلف: Kevin Eloff وآخرون | المجلة: Nature Machine Intelligence | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تناقش هذه القسم التقدمات في علم البروتيوميات القائم على مطيافية الكتلة، مع التركيز بشكل خاص على تحديد الببتيدات من خلال مطيافية الكتلة المت tandem. تعتمد الطرق التقليدية عادةً على قواعد بيانات البروتين لتحديد الببتيدات، مما يمكن أن يكون محدودًا في سياقات معينة. لمعالجة هذه القيود، يقدم المؤلفون InstaNovo، وهو نموذج تحويل يقوم بترجمة قمم أيونات…
-
تحليل النسخ الجيني المقارن يكشف عن اختلافات في الاستجابات المناعية لأيونات النحاس في Sepia esculenta تحت ظروف درجات الحرارة العالية
2025 | المؤلف: Yancheng Zhao وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)تدرس الدراسة الاستجابات المناعية ليرقات *Sepia esculenta* لتعرضها للنحاس (Cu) تحت ظروف درجات حرارة متغيرة، باستخدام تقنيات النسخ الجيني. تشير النتائج إلى أن اليرقات المعرضة لكل من النحاس ودرجات الحرارة المرتفعة (مجموعة CuT) أظهرت زيادة ملحوظة في إثراء جينات عائلة ناقلات المحاليل (SLC) والجينات المرتبطة بتكرار الحمض النووي والتلف مقارنة بتلك المعرضة للنحاس فقط. سلط…
-
رسم الخرائط المكاني الزمني للبروتينات خارج الخلوية عبر TyroID المتوافق مع الحياة
2025 | المؤلف: Zijuan Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الخلوي (Cell Biology)تعتبر البروتينات خارج الخلوية حاسمة للإشارات داخل الخلوية والتواصل بين الخلايا، مما يؤثر بشكل كبير على الصحة والمرض. لقد أدت التطورات الأخيرة في تقنيات وسم القرب (PL) إلى تحسين رسم خرائط البروتينات خارج الخلوية؛ ومع ذلك، كانت قابليتها للتطبيق في الجسم الحي محدودة. تقدم هذه الدراسة TyroID، وهي طريقة مبتكرة متوافقة مع الجسم الحي للوسم…
-
العوامل الاجتماعية السلبية تسرع من الشيخوخة
2025 | المؤلف: Mika Kivimäki وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: الطب النفسي البيولوجي (Biological Psychiatry)يقدم هذا القسم نظرة عامة على العمليات البيولوجية المرتبطة بـ 14 بروتين وسيط يربط بين العوامل الاجتماعية السلبية والأمراض المرتبطة بالعمر المحددة. تم تحديد هذه الروابط باستخدام بيانات من قاعدة بيانات البروتينات العالمية (UniProt)، التي تعمل كقاعدة بيانات شاملة لتسلسلات البروتينات والمعلومات الوظيفية. تسلط النتائج الضوء على دور هذه البروتينات الوسيطة في توضيح الآليات التي…
-
تحديد الجليكوسينatures التشخيصية لسرطان المثانة من خلال تحليل N-glycomics للجزئيات خارج الخلوية في البول
2025 | المؤلف: Yang Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم الحصول على عينات من البول والأنسجة البشرية من مستشفى شنغهاي تشانغهاي، مع الحصول على موافقة أخلاقية من لجنة الأخلاقيات في مستشفى شنغهاي تشانغهاي (رقم الموافقة CHEC2023-069). المواد المستخدمة في البحث تضمنت مجموعة متنوعة من الكواشف والمواد الكيميائية الضرورية للإجراءات التجريبية. تم الحصول على ثنائي ميثيل سلفوكسيد (DMSO) من شركة سينوفارم للمواد…
-
تحد الخلايا الدبقية الشائخة-like من إعادة الميالين من خلال النمط الإفرازي المرتبط بالشائخة
2025 | المؤلف: Phillip S. Gross وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: طب الأعصاب (Neurology)تبحث الدراسة في العلاقة بين الشيخوخة الخلوية وضعف إعادة الميالين في سياق الشيخوخة والتصلب المتعدد (MS). وُجد أن الخلايا الشيخوخة تتراكم في الآفات غير الميالينية بعد الإصابة، وأن تطبيق العلاجات السنويلية يعزز إعادة الميالين في الفئران الشابة ومتوسطة العمر، ولكن ليس في الفئران المسنّة. في الفئران الشابة، هناك زيادة أولية في التعبير عن النسخ المرتبطة…
-
دكتور بايو رايت 2.0: دردشة آلية مدعومة بنموذج لغوي كبير لتحليل البروتيوميات الوظيفية للسرطان على نطاق واسع
2025 | المؤلف: Wei Liu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تستعرض هذه الفقرة التقدم في البروتيوميات الوظيفية التي تهدف إلى تعزيز فهمنا لآليات السرطان وتسهيل تحديد العلامات الحيوية والأهداف العلاجية الجديدة. أنشأ المؤلفون موردًا شاملاً يستخدم مصفوفات البروتين العكسية (RPPAs)، والتي تدمج البيانات من حوالي 8,000 عينة من المرضى من أطلس جينوم السرطان (TCGA) وحوالي 900 عينة من موسوعة خطوط خلايا السرطان (CCLE). تحتوي مجموعة…
-
بروتيوميات القرب تكشف عن آلية نقل الأحماض الدهنية في مواقع الاتصال بين قطرات الدهون والميتوكوندريا والشبكة الإندوبلازمية
2025 | المؤلف: Ayenachew Bezawork‐Geleta وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الكيمياء الحيوية (Biochemistry)تسلط هذه القسم من ورقة البحث الضوء على أهمية مواقع الاتصال الغشائية بين العضيات، وخاصة قطرات الدهون (LDs) والميتوكوندريا، في نقل الجزيئات الحيوية الضرورية لعملية الأيض الخلوي. تستخدم الدراسة تقنيات البيوتينيلشن المعتمدة على القرب لتحديد 71 بروتينًا مرتبطًا بمواقع الاتصال بين قطرات الدهون والميتوكوندريا، وخاصةً مركب متعدد الوحدات يتكون من سينابتوتاجمين الممتد (ESYT) 1، وESYT2،…
-
تحديد علامات البروتينات في البلازما التي تكمن وراء المخاطر المتعددة الجينات لمرض السكري من النوع 2 والأمراض المصاحبة ذات الصلة
2025 | المؤلف: Douglas P. Loesch وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الوراثة (Genetics)في هذا القسم، يصف المؤلفون نهجهم المنهجي في العشوائية المندلية (MR)، مع تسليط الضوء على قيود استخدام موضع واحد، مما قد يؤدي إلى تحليلات ضعيفة وصعوبات في تقدير التعددية. لمعالجة هذه التحديات، استخدموا طريقة MR-Link-2 جنبًا إلى جنب مع تحليل MR التقليدي. أشارت النتائج إلى درجة عالية من التوافق بين الطريقتين؛ ومع ذلك، نجحت MR-Link-2…
-
تباين ألياف العضلات الهيكلية البشرية بما يتجاوز سلاسل الميوسين الثقيلة
2025 | المؤلف: Roger Moreno‐Justicia وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في تباين العضلات الهيكلية، مع التركيز على أنواع الألياف العضلية في البشر، وتحديدًا التصنيف إلى ألياف بطيئة (النوع 1) وسريعة (النوع 2A والنوع 2X). من خلال استخدام التحليلات النسخية والبروتينية على 1050 و 1038 ألياف عضلية فردية من عضلة الفاستوس لاتراليس، تكشف الدراسة أن هناك تباين متعدد الأبعاد كبير داخل وبين هذه الأنواع…