الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: بروتيوميات
-
اكتشاف العلامات الحيوية المدفوع بتحليل متعدد الأوميك ورؤى مرضية حول التهاب الرئة الناتج عن Pseudomonas aeruginosa
2025 | المؤلف: Zhiwei Lin وآخرون | المجلة: BMC Infectious Diseases | المجال: علم المناعة (Immunology)تستكشف هذه الدراسة الآليات الجزيئية الكامنة وراء التهاب الرئة الناتج عن *Pseudomonas aeruginosa*، وهو سبب رئيسي لالتهاب الرئة المكتسب في المستشفى، خاصةً لدى المرضى الذين يعانون من ضعف المناعة. باستخدام نهج متعدد الأوميات المتكامل، أجرى الباحثون تحليلات بروتينية واستقلابية شاملة على عينات سريرية، بما في ذلك سائل غسل القصبات الهوائية (BALF) والمصل، لتوضيح الاستجابات المحلية…
-
تحتوي الهيستونات في الفخاخ خارج الخلوية للعدلات (NETs) على تعديلات ما بعد الترجمة المؤكسدة الناتجة عن المؤكسد ميويلوبيروكسيداز حمض الهيبوكلوروس
2025 | المؤلف: Helen Hemmling وآخرون | المجلة: Redox Biology | المجال: علم المناعة (Immunology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على التعديلات الانتقالية التي يسببها حمض الهيبوكلوروس (HOCl)، وهو مؤكسد يتم إنتاجه بواسطة الميالوبيروكسيداز. هذه التعديلات مهمة لأنها يمكن أن تغير وظيفة البروتين وتساهم في حالات مرضية متنوعة. تسلط الأبحاث الضوء على الآليات التي يتفاعل من خلالها HOCl مع البروتينات، مما يؤدي إلى تغييرات في هيكلها ونشاطها، مما قد يكون…
-
توصيف البروتينات اللثوية في سائل الشق اللثوي واللعاب باستخدام SWATH-MS
2025 | المؤلف: Triana Blanco‐Pintos وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تبحث هذه الدراسة في ملفات البروتينات في سائل الشق اللثوي (GCF) واللعاب لدى الأفراد الذين يتمتعون بصحة لثوية مقارنةً بأولئك الذين يعانون من التهاب اللثة (المراحل III-IV). تم تضمين 44 شخصًا صحيًا و41 مريضًا بالتهاب اللثة في الدراسة. تم إجراء تحليل البروتينات باستخدام تقنية اكتساب النوافذ المتسلسلة لجميع الأطياف الكتلية النظرية (SWATH-MS)، مع تحديد البروتينات…
-
تعقيد الميتوكوندريا يتم تنظيمه في مواقع الاتصال بين الشبكة الإندوبلازمية والميتوكوندريا عبر ربط PDZD8-FKBP8
2025 | المؤلف: Koki Nakamura وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يحقق المؤلفون في المجالات المحددة لـ PDZD8 التي تسهل تفاعله مع FKBP8. من خلال تجارب التفاعل المناعي المشترك (co-IP) التي تشمل طفرات الحذف المختلفة لـ PDZD8، يثبتون أن المجالات الغشائية (TM) و SMP كافية للارتباط بـ FKBP8. للقضاء على العوامل المربكة المحتملة من تفاعل PDZD8 مع نفسه، استخدم الباحثون خط خلايا الأنسجة…
-
خرائط البروتيوميات البصرية العميقة لتحديد السمية البروتينية في مرض الكبد الوراثي
2025 | المؤلف: Florian A. Rosenberger وآخرون | المجلة: Nature | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)يتناول قسم ورقة البحث التحديات التي تطرحها أمراض طي البروتين غير الصحيح، وخاصة نقص α1-أنتي تريبسين (AATD)، ويقدم نهجًا جديدًا باستخدام البروتيوميات المكانية مع التعلم الآلي للتحقيق في هذه الحالات في أنسجة الكبد البشرية. من خلال استخدام البروتيوميات البصرية العميقة (DVP) جنبًا إلى جنب مع تحليل الخلايا الفردية، نجح البحث في رسم خرائط الأحداث الجزيئية…
-
PTM-Mamba: نموذج لغة بروتين مدرك للتعديلات ما بعد الترجمة مع كتل Mamba ذات البوابات ثنائية الاتجاه
2025 | المؤلف: Zhenyun Du وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم القسم نظرة عامة على PTM-Mamba، وهو نموذج لغة بروتين جديد (LM) مصمم لدمج التعديلات ما بعد الترجمة (PTMs) في ترميز خصائص البروتين. تعتبر PTMs، مثل الفسفرة واليوبيكويتين، حاسمة لتعزيز تنوع البروتينات ولها تأثير كبير على هيكل البروتين ووظيفته وتفاعلاته. يدمج نموذج PTM-Mamba رموز PTM من خلال كتل Mamba ثنائية الاتجاه ويستخدم آلية بوابة لدمجها…
-
يسهل التمرين البدني طويل الأمد تدفق الأوعية اللمفاوية الجليمفاتية والسمحاقية المحتملة في البشر
2025 | المؤلف: Roh‐Eul Yoo وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)يستعرض قسم الطرق الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يوضح معايير اختيار المشاركين، وتصميم التجارب، والتقنيات الإحصائية المستخدمة في تحليل البيانات. استخدم الباحثون إطار تجربة عشوائية محكومة لضمان موثوقية النتائج، مع إيلاء اهتمام خاص للتحكم في المتغيرات المربكة. شملت جمع البيانات أدوات وبروتوكولات موحدة لقياس النتائج ذات الصلة، مما يضمن الاتساق عبر جميع التجارب. تم…
-
جزيئات نانوية شبيهة بالإكسوزوم من بلاتيكودون غرانديفلوروم: الأساس المادي لتميز بلاتيكودون غرانديفلوروم الطازج وآليته في تنظيم إصابة الرئة الحادة
2025 | المؤلف: Jingmin Fu وآخرون | المجلة: Journal of Nanobiotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في الإمكانيات العلاجية لـ Platycodon grandiflorum (PG) الطازج في علاج إصابة الرئة الحادة (ALI)، مع تسليط الضوء على تفوقه على الأشكال المجففة. إصابة الرئة الحادة، التي تتميز بالتهاب واسع النطاق، يمكن أن تتفاقم بسبب عوامل سريرية متنوعة. تؤكد الدراسة أنه بينما تم التعرف على فعالية PG في علاج الالتهاب الرئوي، فإن الفوائد المحددة…
-
يتيح InstaNovo تسلسل الببتيدات الجديد المدعوم بالانتشار في تجارب البروتيوميات على نطاق واسع
2025 | المؤلف: Kevin Eloff وآخرون | المجلة: Nature Machine Intelligence | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تناقش هذه القسم التقدمات في علم البروتيوميات القائم على مطيافية الكتلة، مع التركيز بشكل خاص على تحديد الببتيدات من خلال مطيافية الكتلة المت tandem. تعتمد الطرق التقليدية عادةً على قواعد بيانات البروتين لتحديد الببتيدات، مما يمكن أن يكون محدودًا في سياقات معينة. لمعالجة هذه القيود، يقدم المؤلفون InstaNovo، وهو نموذج تحويل يقوم بترجمة قمم أيونات…