الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: بروتيوميات
-
تحديد وتوصيف مناطق الخلايا في الأنسجة من بيانات الأوميكس المكانية بدقة خلوية واحدة
2025 | المؤلف: Jingyang Qian وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم القسم scNiche، وهو إطار عمل حسابي جديد مصمم لتحديد وتوصيف أماكن الخلايا من بيانات الأوميكس المكانية بدقة خلوية فردية. يقارن المؤلفون scNiche ضد كل من مجموعات البيانات المحاكاة والبيولوجية، مما يظهر أدائه المتفوق في تحديد أماكن الخلايا بفعالية مقارنة بالطرق الحالية. ومن الجدير بالذكر أن scNiche يكشف عن تأثير البيئة الدقيقة على الأنماط الخلوية…
-
تكامل متعدد الأوميات القائم على الأيضيات والبروتيوميات يكشف عن تغييرات مبكرة في المستقلبات في إصابة الكلى الحادة المرتبطة بالإنتان
2025 | المؤلف: Pengfei Huang وآخرون | المجلة: BMC Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة إصابة الكلى الحادة المرتبطة بالإنتان (SA-AKI)، وهي مضاعفة شائعة وخطيرة مرتبطة بمعدلات وفيات مرتفعة. الكشف المبكر عن SA-AKI أمر حاسم للعلاج الفعال. قام الباحثون بإجراء تحليلات بروتينية واستقلابية غير مستهدفة على أنسجة الكلى من نماذج الفئران المصابة بـ SA-AKI والإنتان المستحث بواسطة LPS، مستخدمين مراقبة معدل الترشيح الكبيبي (GFR) لتقييم وظيفة الكلى في…
-
تطهير النظام الغليمفاتي وخطر مرض الزهايمر: دراسة واسعة للبروتينات في السائل الدماغي الشوكي
2025 | المؤلف: Natàlia Cullell وآخرون | المجلة: Alzheimer s Research & Therapy | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)تستكشف الدراسة دور النظام الغليمفاتي (GS) في مرض الزهايمر (AD) وإمكاناته كمصدر لمؤشرات حيوية جديدة. باستخدام نهج بروتيومي ثنائي المراحل، قام الباحثون بتقييم صحة GS لدى الأفراد الذين يعانون من ضعف إدراكي خفيف أميني (aMCI) من خلال تطبيق عامل تباين قائم على الغادولينيوم (GBCA) وتصوير الرنين المغناطيسي التسلسلي T1 3T. في المرحلة الأولى، حددوا سبعة…
-
نسخ جديدة من EMT التي تقود التحول الخبيث لليف الأنسجة تحت المخاطية الفموية
2025 | المؤلف: Smitha Sammith Shetty وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تبحث الدراسة في التليف تحت المخاطي الفموي (OSF)، وهو حالة مزمنة من الغشاء المخاطي الفموي مرتبطة بزيادة خطر الإصابة بالسرطان. تركز الدراسة على تحديد وتأكيد الجينات الجديدة المعنية في تنظيم الانتقال من الظهارة إلى الميزانشيم (EMT) في OSF. باستخدام تحليل التعبير الجيني التفاضلي مع عتبة LogFC تبلغ -1 و +1 وقيمة padj < 0.05، قام…
-
إعداد وتطبيق بروتين اندماج متعدد الأبيتوبي بناءً على المعلوماتية الحيوية وتقنية البروتيوميات المعتمدة على العلامات الكتلية المتسلسلة
2025 | المؤلف: Qi Wu وآخرون | المجلة: Frontiers in Immunology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تتناول ورقة البحث التحديات في تشخيص داء البروسيلات، وهو مرض حيواني مهم، بسبب قيود الطرق الحالية مثل الفحوصات المصلية وزراعة البكتيريا. لتعزيز دقة التشخيص، استخدم المؤلفون تحليل البروتينات باستخدام علامة الكتلة المتسلسلة (TMT) على كل من سلالة بروسيلة أبورتوس البرية DT21 وسلالة اللقاح B. abortus A19. حدد هذا التحليل 152 بروتينًا بمستويات تعبير عالية في…
-
بروتيوميات اللعاب والميتابروتيوميات تحدد بصمات جزيئية وتصنيفية مميزة لمرض السكري من النوع الثاني
2025 | المؤلف: Diana Samodova وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تستقصي هذه الدراسة البروتينات اللعابية والبروتينات الميتابروتينية لدى الأفراد الذين تم تشخيصهم حديثًا بمرض السكري من النوع الثاني (T2D) مقارنةً بالأشخاص الأصحاء. باستخدام تقنيات مطيافية الكتلة المتقدمة (MS)، حدد الباحثون أكثر من 4500 بروتين بشري وبكتيري من عينات اللعاب لـ 15 مريضًا بمرض السكري من النوع الثاني و15 شخصًا صحيًا متطابقين في العمر ومؤشر كتلة…
-
الخصائص المضادة للالتهابات ومضادات الأكسدة للأوليوروبين في الكيراتينوسيت البشرية الموصوفة بواسطة بروتيوميات من الأسفل إلى الأعلى
2025 | المؤلف: Huifang Li وآخرون | المجلة: Frontiers in Pharmacology | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)تبحث الدراسة في الخصائص المضادة للالتهابات ومضادات الأكسدة للأوليو رابين، وهو مركب فينولي شائع في مكونات مستحضرات التجميل مثل أوراق الزيتون وزهور الياسمين. في نموذج التهاب خلوي يعتمد على أحادية النواة البشرية (خلايا THP-1)، قلل الأوليو رابين (بتركيزات تتراوح بين 12-200 ميكرومتر) بشكل كبير من السيتوكين المؤيد للالتهابات إنترلوكين (IL)-6 بنسبة 38.8%-45.5%. بالإضافة إلى ذلك،…
-
توقيعات البروتيوم في البلازما للعزلة الاجتماعية والوحدة المرتبطة بالمراضة والوفيات
2025 | المؤلف: Chun Shen وآخرون | المجلة: Nature Human Behaviour | المجال: الصحة (Health)تبحث هذه الدراسة في الآليات البيولوجية التي تربط العلاقات الاجتماعية بنتائج الصحة، باستخدام بيانات من 42,062 مشاركًا وتحليل 2,920 بروتين بلازما من بنك المملكة المتحدة الحيوي. تحدد الدراسة توقيعات بروتينية مرتبطة بالعزلة الاجتماعية والوحدة من خلال دراسة ارتباط شاملة للبروتينات وتحليل شبكة التعبير المشترك للبروتينات. تشير النتائج الرئيسية إلى أن البروتينات المرتبطة بهذه المفاهيم تشارك…
-
π-PrimeNovo: نموذج تعلم عميق غير تكراري دقيق وفعال لتسلسل الببتيدات من جديد
2025 | المؤلف: Xiang Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه القسم التقدم في تسلسل الببتيدات من خلال مطيافية الكتلة المتسلسلة (MS/MS)، مع التأكيد على قيود طرق البحث التقليدية في قواعد البيانات في علم البروتينات. يبرز إدخال نموذج π-PrimeNovo، وهو نموذج قائم على Transformer غير تكراري مصمم لتسلسل الببتيدات من جديد. يعالج هذا النموذج تحديات تراكم الأخطاء وسرعات الاستدلال البطيئة المرتبطة بالنماذج التكرارية. لا…
-
تمكين diaTracer من التحليل المركزي للطيف لبيانات بروتيوميات diaPASEF
2025 | المؤلف: Kai Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدم في قياس الببتيدات والبروتينات من خلال الاستحواذ المستقل عن البيانات (DIA) في علم البروتيوميات باستخدام الكروماتوغرافيا السائلة-مطيافية الكتلة (LC-MS/MS). يسلط الضوء على دمج فصل حركة الأيونات عبر تقنية diaPASEF على منصة timsTOF من Bruker، مما يعزز دقة القياس وتغطية البروتين. يقدم المؤلفون diaTracer، أداة حسابية مصممة لبيانات diaPASEF،…