الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: بروتيوميات
-
المشهد البروتيني الحاسوبي للميكروبات والمضيف في سرطان الفم يكشف عن مسارات وظيفية واستقلابية رئيسية بين فوسوبكتيريوم نوكليتوم وتقدم السرطان
2025 | المؤلف: Camila Paz Muñoz-Grez وآخرون | المجلة: International Journal of Oral Science | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تستقصي هذه الدراسة دور مسببات الأمراض اللثوية، وتحديداً *Fusobacterium nucleatum* (F. nucleatum)، في تقدم سرطان الخلايا الحرشفية الفموية (OSCC). باستخدام البروتيوميات الحاسوبية، قام الباحثون بتحليل السركتوم لعينات خزعة من مرضى OSCC وأشخاص أصحاء من خلال مطيافية الكتلة. وجدوا زيادة ملحوظة في تنظيم البروتينات المضيفة المتعلقة باستجابة الليببوليسكاريد (LPS)، وهجرة/التصاق الخلايا، واستقلاب الأحماض الأمينية في بروتيوم…
-
التحليل الجزيئي والمكاني للهياكل اللمفاوية الثانوية في متلازمة سجوجرن
2025 | المؤلف: Saba Nayar وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه الفقرة أهمية الهياكل اللمفاوية الثلاثية (TLS) في كل من الحالات المناعية الذاتية وغير المناعية، مع التركيز بشكل خاص على دورها في الأمراض مثل متلازمة سجوجرن ومتلازمة سيكا. يستخدم المؤلفون مزيجًا من تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة، وعلم النسخ الجغرافي، والبروتيوميات لتحليل الغدد اللعابية الصغيرة من المرضى المتأثرين، بهدف توضيح المصادر الخلوية والديناميات…
-
التغيرات البروتينية عند العلاج بالسيماغلوتيد لدى الأفراد الذين يعانون من السمنة
2025 | المؤلف: Lasse Maretty وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث تأثير السيماغلوتيد، وهو دواء للسمنة ومرض السكري من النوع 2، على البروتينات الدائرة، استنادًا إلى عينات مصل تم جمعها من تجربتين سريريتين من المرحلة الثالثة: STEP 1 (n = 1,311) و STEP 2 (n = 645). وجدت الدراسة أن السيماغلوتيد يؤثر على مجموعة واسعة من العمليات البيولوجية، بما في…
-
التنبؤ بالأمراض باستخدام البيانات متعددة الأوميات والبيانات الحيوية يعزز الاكتشافات الجينية في دراسة الحالة–التحكم في بنك المملكة المتحدة الحيوي
2024 | المؤلف: Manik Garg وآخرون | المجلة: Nature Genetics | المجال: علم الوراثة (Genetics)يقدم قسم “النتائج” في ورقة البحث النتائج الرئيسية المستمدة من التجارب والتحليلات التي تم إجراؤها. تشير البيانات إلى وجود علاقة كبيرة بين المتغيرات المدروسة، حيث كشفت التحليلات الإحصائية عن قيمة p أقل من 0.05، مما يشير إلى أن التأثيرات الملحوظة من غير المحتمل أن تكون بسبب الصدفة. بالإضافة إلى ذلك، تظهر النتائج أن النموذج المقترح…
-
تحليل سريع وعميق للبروتينات الفوسفاتية باستخدام مطياف الكتلة Orbitrap Astral
2024 | المؤلف: Noah M. Lancaster وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تناقش هذه القسم أهمية فسفرة البروتينات في العمليات الخلوية والتحديات المرتبطة بالكشف عنها وقياسها. يقدم المؤلفون نهجًا جديدًا باستخدام مطياف الكتلة Orbitrap Astral، مع دمج اكتساب البيانات المستقل (DIA)، مما يسمح بتحليل سريع وشامل للفسفورومات في نماذج الإنسان والفأر. لقد نجحوا في رسم خريطة لحوالي 30,000 موقع فسفرة بروتيني فريد في غضون 30 دقيقة وكشفوا…
-
كوانتيمز: خط أنابيب قائم على السحابة للبروتيوميات الكمية يمكّن من إعادة تحليل بيانات البروتيوميات العامة
2024 | المؤلف: Chengxin Dai وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)إن الزيادة في حجم بيانات البروتيوميات العامة تقدم تحديات حسابية كبيرة لإعادة التحليل على نطاق واسع. لمعالجة ذلك، يقدم المؤلفون quantms، وهو خط أنابيب مفتوح المصدر قائم على السحابة مصمم لتحليل بيانات البروتيوميات بشكل متوازي بشكل كبير. باستخدام quantms، أعادوا تحليل 83 مجموعة بيانات عامة من ProteomeXchange، تشمل 29,354 ملف أداة من 13,132 عينة بشرية،…
-
معيشة إنسان دينيسوف في الكهف الكارستي بايشيا خلال العصر الجليدي الأوسط والمتأخر
2024 | المؤلف: Huan Xia وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الأنثروبولوجيا (Anthropology)في كهف بايشيا كارست (BKC)، كشفت تحليل شامل لـ 2,567 عينة حيوانية أن 78.1% تم التعرف عليها تصنيفياً، وتتكون في الغالب من الماعز، وخاصة البهارال (Pseudois nayaur). تشير المجتمع الحيواني إلى منظر طبيعي يهيمن عليه العشب خلال أواخر العصر الأوسط وأواخر العصر الجليدي، مع وجود ملحوظ للثيران والخيول، إلى جانب أنواع الغابات والشجيرات التي تشير…
-
توصيف البروتيوميات الحسية لمشروب قائم على بروتين البازلاء المخمر بواسطة Lactobacillus Johnsonii: استراتيجية واعدة لتعزيز إحساس الأومامي والكوكومي مع تقليل المرارة
2024 | المؤلف: Andrea Spaccasassi وآخرون | المجلة: Journal of Agricultural and Food Chemistry | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)تستكشف هذه الدراسة آليات تعزيز النكهة في مشروب قائم على بروتين البازلاء المخمر مع Lactobacillus johnsonii NCC533. باستخدام مزيج من السنسومكس والسنسوبروتيومكس، حددت الأبحاث زيادة في المركبات النشطة طعمياً، بما في ذلك الأحماض الأمينية، والنيوكليوتيدات، والأحماض العضوية، والديبيبتيدات، إلى جانب ستة ببتيدات جديدة تعزز نكهات الكوكومي والأومامي. هذه الببتيدات، الناتجة عن تحلل بروتينات التخزين في…
-
فك رموز المجالات المكانية من الميكروبيوم المكاني متعدد الأبعاد باستخدام SpatialGlue
2024 | المؤلف: Yahui Long وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، قام المؤلفون بتقييم SpatialGlue مقابل عدة طرق منافسة باستخدام بيانات متعددة الأومكس المكانية التي تم الحصول عليها تجريبيًا والمحاكاة مع تسميات الحقيقة المعروفة. استخدمت التقييمات مقاييس إشرافية مثل التجانس، المعلومات المتبادلة، المعلومات المتبادلة المعدلة (AMI)، المعلومات المتبادلة العادية (NMI)، ومؤشر راند المعدل (ARI). تضمنت مجموعات البيانات المحاكاة وضعيتين قدمتا رؤى فريدة ومتكاملة…
-
الميكروARNات: مؤشرات حيوية دائرية للكشف المبكر عن السرطانات غير الملحوظة عبر تقدم أجهزة الاستشعار الحيوية والتعلم الآلي
2024 | المؤلف: Gavin Metcalf | المجلة: Oncogene | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)تستعرض هذه المراجعة إمكانيات الميكروRNAs (miRNAs) كعلامات حيوية للكشف المبكر عن السرطانات غير الملحوظة، مع التأكيد على دورها في تعزيز الطب الدقيق وتحسين نتائج المرضى. واجهت الأبحاث الأولية تحديات كبيرة في تحديد توقيعات miRNA المحددة بسبب تباين أنواع السرطان وصعوبة إنشاء لوحات علامات حيوية قوية. ومع ذلك، فإن التقدم الأخير في تقنيات التحليل عالية الإنتاجية…