الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: بنية البروتين
-
هياكل Cryo-EM لـ ClpXP البشري تكشف عن آليات التجميع والتفعيل البروتيني
Cryo-EM structures of human ClpXP reveal mechanisms of assembly and proteolytic activation2026 | المؤلف: Wenqian Chen وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يلعب مجمع ClpXP البشري (hClpXP) دورًا حاسمًا في التحكم في جودة البروتينات الميتوكوندرية من خلال تكسير البروتينات غير المطوية وغير الضرورية. تستخدم هذه الدراسة مجهر الإلكترون بالتبريد عالي الدقة (cryo-EM) لتوضيح مسار التجميع الكامل لـ hClpXP، كاشفة أن hClpP يوجد كهيبتامر حلقي مفرد في العزلة. تم تحديد مجمع التجميع الأولي حيث يتفاعل hClpX سداسي مع…
-
قياس الطيف الكتلي المرتبط بالبروتوليز المحدود يلتقط التغيرات الهيكلية للبروتينات على مستوى البروتيوم وتكثف الجزيئات الحيوية في الخلايا الحية
Limited proteolysis-coupled mass spectrometry captures proteome-wide protein structural alterations and biomolecular condensation in living cells2026 | المؤلف: Franziska Elsässer وآخرون | المجلة: Molecular Systems Biology | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)في هذا القسم، يناقش المؤلفون تطوير التحليل الطيفي الكتلي المرتبط بالبروتوليز المحدود داخل الخلايا (LiP-MS) لدراسة هياكل البروتينات مباشرة داخل خلايا الإنسان الحية، متغلبين على قيود LiP-MS التقليدي الذي يتطلب تحلل الخلايا. تلتقط التقنية التغيرات الهيكلية الديناميكية في البروتينات بسبب التعديلات بعد الترجمة، والتفاعلات الجزيئية، والعوامل البيئية. من خلال تحسين إدخال بروتيناز K إلى الخلايا…
-
تنبؤ هيكل البروتين في مجال واحد ومتعدد المجالات باستخدام D-I-TASSER المعتمد على التعلم العميق
Deep-learning-based single-domain and multidomain protein structure prediction with D-I-TASSER2025 | المؤلف: Wei Zheng وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم القسم نظرة عامة على نهج هجين جديد لتوقع بنية البروتين يسمى تحسين تجميع الخيوط التكراري القائم على التعلم العميق (D-I-TASSER). يجمع هذه الطريقة بين إمكانيات التعلم العميق متعددة المصادر مع محاكاة تجميع شظايا الخيوط التكرارية لتوليد نماذج على مستوى الذرة، وخاصة للبروتينات متعددة المجالات الكبيرة. يستخدم D-I-TASSER بروتوكول تقسيم وتجميع المجالات، مما يعزز بشكل…