الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: ترانسكريبتوم
-
الأصول الميتوكوندرية للضغط للنوم
2025 | المؤلف: Raffaele Sarnataro وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأعصاب الإدراكي (Cognitive Neuroscience)قسم “الطرق” في ورقة البحث يحدد تصميم التجربة والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، مع دمج التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات المجمعة من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لمراقبة آثارها على النتائج ذات الصلة. شمل جمع البيانات استخدام أدوات وبروتوكولات موحدة لضمان الموثوقية…
-
تطوير نموذج توقع تنبؤي قائم على نمط الجزيئات المرتبطة بالضرر لسرطان القولون والمستقيم باستخدام تحليل RNA-seq الكمي
2025 | المؤلف: Yang Wu وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تقدم هذه الدراسة نموذج خطر تنبؤي لمرضى سرطان القولون والمستقيم (CRC) استنادًا إلى أنماط الجزيئات المرتبطة بالضرر (DAMPs). باستخدام بيانات من أطلس جينوم السرطان (TCGA) وcBioportal، قام الباحثون بحساب درجة DAMP باستخدام طريقة “ssGSEA”. وقد حددوا الجينات المعبر عنها بشكل مختلف (DEGs) من خلال حزمة “limma” واستخدموا تحليل الانحدار لاسو كوكس عبر حزمة “glmnet” لضغط…
-
رؤى جديدة حول السكتة الدماغية الإقفارية الحادة من منظور الأوميكس المكاني
2025 | المؤلف: Xinpeng Deng وآخرون | المجلة: Theranostics | المجال: طب الأعصاب (Neurology)السكتة الدماغية الإقفارية الحادة (AIS) هي حالة وعائية دماغية شائعة مرتبطة بمعدلات عالية من الحدوث والعجز، مما يفرض عبئًا كبيرًا على أنظمة الرعاية الصحية في جميع أنحاء العالم. تقدم هذه المراجعة تحليلًا شاملاً للأدوار البيولوجية وآليات التفاعل بين أنواع الخلايا المختلفة المشاركة في AIS، بما في ذلك الخلايا الدبقية الصغيرة، الخلايا النجمية، الخلايا الدبقية قليلة…
-
توقيعات التعبير الجيني للفخ الخارجي للعدلات تحدد المحاور الإشارية القابلة للتنبؤ والاستهداف لتثبيط انتشار ورم البنكرياس
2025 | المؤلف: Paul C. McDonald وآخرون | المجلة: Communications Biology | المجال: علم المناعة (Immunology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث دور العدلات المرتبطة بالورم (TANs) والفخاخ خارج الخلوية للعدلات (NETs) في تقدم سرطان القناة البنكرياسية الغدي (PDAC)، وهو سرطان معروف بإمكانيته العالية للانتشار ونبوءته السيئة. تستخدم الدراسة تجميع التوافق وتحليل إثراء المسارات على مجموعة من 369 عينة من مرضى PDAC، حيث تحدد توقيعات تعبير جيني متميزة تتعلق بالهيكل الخلوي…
-
فك شفرة الميكروبيئة المناعية للورم: رؤى من النسخ الجيني أحادي الخلية والمكاني حول الخلايا الليفية لسرطان عنق الرحم
2025 | المؤلف: Zhiheng Lin وآخرون | المجلة: Journal of Experimental & Clinical Cancer Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)**نظرة عامة** يستمر سرطان عنق الرحم (CC) في كونه تحديًا صحيًا عالميًا كبيرًا، متأثرًا بتنوع الأورام ودور الخلايا الليفية المرتبطة بالسرطان (CAFs) في تقدم المرض ومقاومة العلاج. تستخدم هذه الدراسة منهجيات متقدمة، بما في ذلك تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة (scRNA-seq)، والترانسكريبتوميات المكانية، وتحليل التفكيك، لاستكشاف البيئة المناعية للورم (TIME) في CC. من خلال…
-
اكتشاف الأهداف العلاجية المعتمد على المعلوماتية الحيوية في سرطان الرئة الغدي الناتج عن الكادميوم: دور الأوكسي ريسفيراترول
2025 | المؤلف: Murat Isıyel وآخرون | المجلة: Biological Trace Element Research | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)تؤسس هذه الدراسة إطارًا حيويًا وتجريبيًا للتحقيق في الآليات الجزيئية الكامنة وراء سرطان الرئة الغدي الناتج عن الكادميوم (Cd) وتقييم الإمكانات العلاجية للبوليفينول الطبيعي الأوكسي ريسفيراترول (O-RES). من خلال دمج خمسة مجموعات بيانات تعبير جيني مرتبطة بـ LUAD من قاعدة بيانات GEO، حدد الباحثون 116 جينًا معبرًا عنه بشكل مختلف (DEGs)، بما في ذلك 30…
-
تخليق حيوي متعدد الوظائف مدعوم بـ P450s المتباينة للثلاثي تريفتيريفوردي والستيرويدات الخفية في Aconitum يشير إلى تطور متقارب
2025 | المؤلف: Fei Luo وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)يتناول القسم المعنون “نظرة عامة” دور إنزيمات السيتوكروم P450 متعددة الوظائف (P450s) في التخليق الحيوي للمركبات النشطة بيولوجيًا. يتم تسليط الضوء على هذه الإنزيمات لقدرتها على تحفيز مجموعة متنوعة من التفاعلات، مما يمكّن من تخليق جزيئات معقدة ذات أنشطة بيولوجية متنوعة. تؤكد الأبحاث على أهمية P450s في إنتاج الأدوية وغيرها من المواد النشطة بيولوجيًا، مما…
-
تكشف تحليلات العشوائية المندلية على مستوى الجينوم للخلايا الفردية عن آليات محددة للخلايا في مرض القلب والأوعية الدموية التصلبي
2025 | المؤلف: Anushree Ray وآخرون | المجلة: The American Journal of Human Genetics | المجال: علم المناعة (Immunology)تقدم هذه الدراسة إطارًا تحليليًا قويًا على مستوى الخلية الواحدة يستخدم تقنيات التعديل الجيني العشوائي على مستوى النسخ الجيني وتقنيات التداخل. من خلال التركيز على تأثيرات التعبير المحددة لنوع الخلية التي غالبًا ما يتم تجاهلها في التحليل الجماعي، تعزز هذه الطريقة دقة تحديد الجينات المسببة بشكل خاص في سياق مرض القلب والأوعية الدموية الناتج عن…
-
تحديد ملفات النسخ المحفوظة والمقيدة بالأنسجة للماكروفاجات المرتبطة بالدهون
2025 | المؤلف: Yingzheng Xu وآخرون | المجلة: Communications Biology | المجال: علم المناعة (Immunology)تناقش هذه القسم الدور الحاسم للبلاعم في وظيفة المناعة وتوازن الأنسجة، مع تسليط الضوء على تحديد البرامج الجينية المشتركة والخاصة بالأنسجة التي تحكم سلوك البلاعم عبر أعضاء مختلفة. على الرغم من التقدم في فهم برمجة البلاعم خلال التوازن، لا يزال هناك فجوة في المعرفة بشأن الاستجابات المتداخلة والفريدة من نوعها لمجموعات البلاعم، خاصة في السياقات…
-
التكيف النسخي المحدد للأنسجة في ثلاثة سلالات من الدجاج خلال العدوى المشتركة مع الطفيليات
2025 | المؤلف: Oyekunle John Oladosu وآخرون | المجلة: Gut Pathogens | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس الدراسة التكيفات النسخية في الدجاج بعد العدوى المشتركة مع الديدان الخيطية المعوية و *Histomonas meleagridis*، مع التركيز على ثلاثة سلالات: Lohmann Brown (LB)، Lohmann Dual (LD)، و Ross-308 (R). بعد أسبوعين من العدوى، كشفت تسلسل RNA لأنسجة الصائم، والقولون، والكبد عن استجابات نسخية تعتمد بشكل كبير على السلالة ونوع الأنسجة. ومن الجدير بالذكر أن…