الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: ترانسكريبتوم
-
استهداف الخلايا الكبدية المتقدمة لعلاج مرض الكبد الدهني المرتبط بخلل الأيض والخلل الوظيفي المتعدد الأعضاء
2025 | المؤلف: Kuo Du وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأوبئة (Epidemiology)قسم “طرق” يوضح الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يتناول اختيار المشاركين، وتصميم التجارب، والتقنيات الإحصائية المستخدمة لتحليل البيانات. استخدم الباحثون إطار تجربة عشوائية محكومة لضمان موثوقية نتائجهم، مع تنفيذ معايير محددة للإدراج والاستبعاد لاختيار المشاركين. شملت جمع البيانات تقييمات وقياسات موحدة، تم تسجيلها بشكل منهجي للحفاظ على الاتساق. تم إجراء التحليل باستخدام برامج إحصائية…
-
النمذجة الأيضية تكشف عن تراجع التفاعلات الأيضية المرتبطة بالشيخوخة بين المضيف والميكروبيوم في الفئران
2025 | المؤلف: Lena Best وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في التفاعل بين الشيخوخة والميكروبيوم المعوي، باستخدام الميتاجينوميات، والترانسكريبتوميات، والميتابولوميات من الفئران المسنّة جنبًا إلى جنب مع النمذجة الأيضية. تعيد الدراسة بناء نماذج أيضية متكاملة للميكروبات المضيفة والمعوية، كاشفة عن اعتماد معقد لعملية الأيض المضيف على كل من التفاعلات الميكروبية المعروفة والجديدة. من الجدير بالذكر أن الميكروبيوم المتقدم في السن يظهر انخفاضًا كبيرًا…
-
تعزيز شامل لنضوج خلايا القلب المستحثة من الخلايا الجذعية عن طريق دمج الوسط الأيضي مع النمط النانوي والتحفيز الكهربائي
2025 | المؤلف: Wener Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه الفقرة قيود خلايا القلب المستمدة من الخلايا الجذعية متعددة القدرات المستحثة (iPSC-CMs) في فحص الأدوية بسبب عدم نضوجها. يقدم المؤلفون نهجًا جديدًا يعزز نضوج iPSC-CMs من خلال استخدام وسط غني بالدهون، وتركيزات عالية من الكالسيوم، وأسطح ثقافة بنمط نانوي، وتحفيز كهربائي. تشير اختباراتهم المنهجية إلى أن التحفيز الكهربائي يدفع بشكل كبير تطوير الميتوكوندريا…
-
تحليل متعدد الأوميك يكشف عن التخليق الحيوي والتراكم المحدد للأنسجة للقلويدات ثنائية التيربين في Aconitum japonicum
2025 | المؤلف: Megha Rai وآخرون | المجلة: Journal of Natural Medicines | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تتركز الأبحاث حول *Aconitum japonicum*، وهي نبات معمر سام من اليابان، على توضيح المسارات الحيوية لتخليق القلويات الديتيربينية، وهي مركبات نشطة بيولوجيًا ذات إمكانات صيدلانية كبيرة. من خلال استخدام تحليلات الميتابولوم والترانسكريبتوم عالية الإنتاجية عبر أربعة أنسجة متميزة—الورقة، الجذر الأم، الجذر الابن، والجذر الصغير—تدمج الدراسة هذه البيانات للكشف عن أنماط التعبير الجيني وملفات الميتابوليت المرتبطة…
-
التحليل المشترك للترانسكريبتوم والميتابولوم كشف آلية تحمل الملح لنبات Populus talassica × Populus euphratica
2025 | المؤلف: Ying Liu وآخرون | المجلة: BMC Plant Biology | المجال: علوم النبات (Plant Science)تدرس هذه الدراسة آليات تحمل الملح في *Populus talassica × Populus euphratica* من خلال التحليلات الشكلية والفيزيولوجية والترنسكريبتومية والميتابولومية تحت علاجات NaCl المتنوعة (200 م م و 400 م م). تشير النتائج إلى أن ظروف الملح المنخفضة (200 م م NaCl) تعزز معايير النمو مثل طول الجذر والمساحة السطحية وتراكم الكتلة الحيوية، مما يشير إلى…
-
باختصار: جينوم الفستق وتطور النواة
2025 | المؤلف: Jaclyn A. Adaskaveg وآخرون | المجلة: New Phytologist | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)تقدم البحث دراسة شاملة حول جوز الفستق (Pistacia vera ‘Kerman’)، مع تسليط الضوء على إمكانيته كمصدر غذائي مستدام بسبب مقاومته للمناخ وفوائده الغذائية. قام المؤلفون بإنشاء جينوم مرجعي على مستوى الكروموسوم وأجروا تحليلًا مكانيًا وزمنيًا لتطور الجوز، مع دمج بيانات فسيولوجية شاملة تم جمعها على مدى ثلاثة مواسم زراعية مع بيانات نسخ جينية من 14…
-
رسم خرائط موضعي للخلايا المرتبطة بالسمات المعقدة لدى الإنسان
2025 | المؤلف: Liyang Song وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم طريقة جديدة تُسمى رسم الخرائط الجينية المكانية للخلايا للسمات المعقدة (gsMap)، والتي تدمج بيانات النسخ الجيني المكاني مع إحصائيات دراسة الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) لرسم خرائط مكانية للخلايا ذات الصلة بالسمات المعقدة البشرية، بما في ذلك الأمراض المختلفة. قام المؤلفون بتقييم gsMap باستخدام مجموعات بيانات النسخ الجيني المكاني الجنينية من 25…
-
تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة وعلم النسخ المكاني يكشفان عن التباين والتواصل بين الخلايا للألياف المرتبطة بالسرطان في سرطان المعدة
2025 | المؤلف: Xijie Zhang وآخرون | المجلة: Journal of Translational Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تستكشف هذه الدراسة تباين الألياف المرتبطة بالسرطان (CAFs) داخل البيئة الدقيقة للورم (TME) في سرطان المعدة، مع التركيز على أدوارها في تقدم الورم والتواصل بين الخلايا مع الخلايا الظهارية الخبيثة (ECs). باستخدام بيانات تسلسل الخلايا الفردية من 24 عينة سرطان معدة، حدد الباحثون تسع فئات خلوية متميزة وستة تحت مجموعات من الألياف: الألياف الالتهابية (iCAFs)،…
-
خط أنابيب حسابي للميكانيكا الحيوية المكانية
2025 | المؤلف: Adrien Hallou وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: الفيزياء الحيوية (Biophysics)تقدم البحث إطارًا حسابيًا جديدًا مصممًا للتحليل الإحصائي المشترك للإشارات النسخية والميكانيكية ضمن مجال النسخيات المكانية. يعالج هذا الإطار التفاعل المعقد بين الآليات الكيميائية الحيوية والميكانيكية التي تحكم تحديد مصير الخلايا وتشكيل الأنسجة. من خلال تطبيق هذه المنهجية على بيانات النسخيات المكانية من جنين الفأر النامي، نجح المؤلفون في استنتاج القوى الميكانيكية التي تؤثر على…
-
الإفراط في تكامل الشبكة البصرية في اضطراب الاكتئاب الشديد وارتباطه بملفات التعبير الجيني
2025 | المؤلف: Mingrui Zhu وآخرون | المجلة: Translational Psychiatry | المجال: علم الأعصاب الإدراكي (Cognitive Neuroscience)تبحث هذه الدراسة في الشذوذات في الاتصال الوظيفي في اضطراب الاكتئاب الشديد (MDD) وعلاقتها بملفات التعبير الجيني. شملت الدراسة 262 مريضًا مصابًا بـ MDD و297 شخصًا سليمًا، باستخدام تصوير الرنين المغناطيسي الوظيفي في حالة الراحة (R-fMRI) لتحليل النشاط الدماغي الداخلي. تشمل النتائج الرئيسية زيادة معامل المشاركة (PC) داخل الشبكة البصرية الثنائية (VIS) في مرضى MDD،…