الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تسلسل (علم الأحياء)
-
الهندسة المتسارعة للإنزيمات بواسطة التعبير الخالي من الخلايا الموجه بتعلم الآلة
2025 | المؤلف: Grant M. Landwehr وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم ورقة البحث منصة جديدة موجهة بواسطة التعلم الآلي (ML) تهدف إلى التغلب على قيود هندسة الإنزيم التقليدية، خاصة في توليد مجموعات بيانات واسعة من علاقات التسلسل-الوظيفة للتصميم التنبؤي. تدمج هذه المنصة تجميع الحمض النووي الخالي من الخلايا، والتعبير الجيني الخالي من الخلايا، والاختبارات الوظيفية لرسم خرائط فعالة لمشاهد اللياقة عبر مساحة تسلسل البروتين، مما…
-
متغيرات تسلسل النوكليوتيدات، تعبير الجينات وبروفايل المصل للعلامات المناعية ومضادات الأكسدة المرتبطة بمقاومة/قابلية الإصابة بالبروسيلا في ماعز الشامي
2025 | المؤلف: Ahmed A. El‐Sayed وآخرون | المجلة: Irish Veterinary Journal | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس هذه الدراسة التغيرات الجينية والجزيئية في ماعز الشامي المعرض للإصابة ببكتيريا البروسيلا، وهو مرض حيواني مهم يؤثر على إنتاج الحيوانات. تم جمع عينات دم من خمسين ماعز شامي ناضج، تتكون من 30 فردًا مصابًا و20 فردًا غير مصاب. ركزت الأبحاث على تسلسل جينات معينة مرتبطة بالمناعة، بما في ذلك SLC11A1 وTLR1 وTLR9 وSP110 وADORA3…
-
الكشف عن الاضطرابات الأيونوسفيرية باستخدام شبكة GNSS نادرة في تسلسل زلزال كهرمان مرعش Mw 7.8 و Mw 7.5 المحاكي في الوقت القريب الحقيقي
2025 | المؤلف: Fiona Luhrmann وآخرون | المجلة: GPS Solutions | المجال: الجيوفيزياء (Geophysics)في هذا البحث، يقدم المؤلفون نهجًا جديدًا للكشف عن الشذوذ الأيوني الناتج عن الأحداث الزلزالية باستخدام بيانات محتوى الإلكترون الكلي (TEC) في الوقت الحقيقي من نظام GUARDIAN. من خلال استخدام محرك كشف الشذوذ القائم على الذاكرة طويلة وقصيرة الأجل (LSTM)، تمكنوا بنجاح من تحديد الاضطرابات الأيونوسفيرية الناتجة عن الزلازل (TIDs) في مقتطفات بيانات مدتها 10…
-
تصميم بروتينات متعددة الحالات ووظيفية باستخدام انتشار فضاء تسلسل RoseTTAFold
2024 | المؤلف: Sidney Lisanza وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث مولد البروتين (PG)، وهو نموذج جديد لانتشار مساحة التسلسل مبني على RoseTTAFold، يهدف إلى تعزيز توليد هياكل البروتين من الصفر مع معالجة قيود النماذج الحالية في توليد الخصائص الوظيفية والسمات المحددة بالتسلسل. يعمل PG من خلال البدء من تمثيل تسلسلي مشوش ويستخدم إزالة الضوضاء التكرارية لإنتاج أزواج من تسلسلات وهياكل البروتين، مسترشداً بسمات…
-
دراسة التحقق من انخفاض الضغط المجتمعي SCEC/USGS باستخدام تسلسل زلازل ريدجكريست 2019
2024 | المؤلف: A. Baltay وآخرون | المجلة: Seismica | المجال: الجيوفيزياء (Geophysics)تقدم هذه القسم دراسة تحقق من انخفاض الضغط المجتمعي تركز على تسلسل زلزال ريدجكريست، كاليفورنيا في عام 2019. تهدف الدراسة إلى تسهيل التقديرات المستقلة لانخفاض الضغط – وهو معلمة حاسمة في علم الزلازل تقيس التغير في متوسط الضغط القصي على صدع أثناء الانكسار – باستخدام مجموعة بيانات مشتركة. تتكون مجموعة البيانات من حوالي 13,000 زلزال…
-
ASF-YOLO: نموذج YOLO جديد مع دمج تسلسل المقياس الانتباهي لتجزئة حالات الخلايا
2024 | المؤلف: Ming Kang وآخرون | المجلة: Image and Vision Computing | المجال: الذكاء الاصطناعي (Artificial Intelligence)في هذا القسم، يقدم المؤلفون تطوير نموذج ASF-YOLO، وهو إطار متقدم لتجزئة الكائنات مصمم لتحليل صور الخلايا. يدمج هذا النموذج دمج الميزات المكانية والقياسية لتعزيز الكشف والتجزئة للأشياء الصغيرة والكثيفة في صور الخلايا. تشمل الابتكارات الرئيسية تقديم وحدات SSFF (دمج الميزات المكانية والقياسية) وTFE (تعزيز الميزات الزمنية)، والتي تحسن بشكل كبير أداء التجزئة متعددة المقاييس.…
-
توقع توزيع التشكيلات البروتينية عالي الإنتاجية باستخدام AlphaFold2 مع أخذ عينات فرعية
2024 | المؤلف: Gabriel Monteiro da Silva وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “الطرق” يوضح الأساليب التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يوضح معايير اختيار المشاركين، وتصميم التجارب، والتقنيات الإحصائية المستخدمة في تحليل البيانات. استخدم الباحثون مجموعة من الأساليب الكمية والنوعية لضمان فهم شامل للظواهر قيد البحث. شملت جمع البيانات أدوات وبروتوكولات موحدة للحفاظ على الاتساق والموثوقية. شمل التحليل نماذج إحصائية متقدمة، مثل تحليل الانحدار وANOVA، لتقييم دلالة…
-
تحسين توقعات بنية البروتينات الأحادية والمعقدة باستخدام DeepMSA2 مع بيانات الميتاجينوم الضخمة
2024 | المؤلف: Wei Zheng وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تم تقديم خط أنابيب DeepMSA2 كنهج جديد لبناء محاذاة متعددة التسلسلات الموحدة (MSAs) للبروتينات أحادية ومتعددة السلاسل، باستخدام بحث محاذاة تكراري عبر قواعد البيانات الجينومية والميتا جينومية. تشير الاختبارات الشاملة إلى أن MSAs التي تم إنشاؤها بواسطة DeepMSA2 تعزز بشكل كبير دقة توقعات الهيكل الثلاثي والرباعي للبروتين مقارنة بالطرق الحالية المتطورة. ومن الجدير بالذكر أنه…