الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تصميم البروتين
-
تصميم بروتينات متعددة الحالات ووظيفية باستخدام انتشار فضاء تسلسل RoseTTAFold
Multistate and functional protein design using RoseTTAFold sequence space diffusion2024 | المؤلف: Sidney Lisanza وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث مولد البروتين (PG)، وهو نموذج جديد لانتشار مساحة التسلسل مبني على RoseTTAFold، يهدف إلى تعزيز توليد هياكل البروتين من الصفر مع معالجة قيود النماذج الحالية في توليد الخصائص الوظيفية والسمات المحددة بالتسلسل. يعمل PG من خلال البدء من تمثيل تسلسلي مشوش ويستخدم إزالة الضوضاء التكرارية لإنتاج أزواج من تسلسلات وهياكل البروتين، مسترشداً بسمات…
-
التصميم الحسابي لنظائر البروتينات الغشائية القابلة للذوبان والوظيفية
Computational design of soluble and functional membrane protein analogues2024 | المؤلف: Casper A. Goverde وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث نهجًا حسابيًا جديدًا يستخدم التعلم العميق، وبالتحديد AF2 seq-MPNN، لتصميم طيات البروتين المعقدة بكفاءة، بما في ذلك التسلسلات غير الطبيعية. يتميز هذا الإطار بمرونته وقابليته للتعميم، مما يلغي الحاجة إلى إعادة تدريب محددة للطيات أو قيود تصميم معقدة. نجح المؤلفون في هندسة عدة طيات بروتين صعبة، محققين معدلات نجاح تجريبية عالية للتصاميم القابلة…