الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تعبير الجين
-
علم النسخ الزمني المكاني يكشف عن تنظيم الجينات الرئيسية لعائد الحبوب وجودتها في القمح
2025 | المؤلف: Xiaohui Li وآخرون | المجلة: Genome biology | المجال: علوم النبات (Plant Science)تقدم هذه الورقة البحثية دراسة عن النسخ الجزيئي المكاني تركز على المراحل المبكرة من تطوير حبة القمح، تحديدًا من 4 إلى 12 يومًا بعد التلقيح. يصنف المؤلفون الحبة إلى عشرة أنواع خلايا متميزة ويحددون 192 جينًا علامة مرتبطة بهذه الأنواع. من خلال تحليل شبكة التعبير الجيني الموزون (WGCNA)، يكشفون أن الجينات ذات مستويات التعبير العالية…
-
تفاعلات عوامل النسخ الموجهة بواسطة الحمض النووي توسع الشيفرة التنظيمية للجينات البشرية
2025 | المؤلف: Zhiyuan Xie وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في ال، يبرز البحث أن مجموعة صغيرة فقط من عوامل النسخ البشرية (TFs) تمتلك مجالات تنشيط نسخي قوية، حيث أن 16 فقط من عوامل النسخ المختبرة تظهر هذه الخاصية. ومن الجدير بالذكر أن العديد من هذه العوامل، مثل TCF4 و ATOH1، تتفاعل مع عوامل نسخ أخرى، مما يشير إلى أن عوامل النسخ التي تفتقر إلى…
-
تصفية الخلايا ذات المحتوى الميتوكوندري العالي تستنفد تجمعات الخلايا الخبيثة المتغيرة الأيضية القابلة للحياة في دراسات الخلايا المفردة للسرطان
2025 | المؤلف: Josephine Yates وآخرون | المجلة: Genome biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث ورقة البحث في تداعيات ممارسات التصفية في تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq) للخلايا الخبيثة، مع التركيز بشكل خاص على نسبة عدد RNA الميتوكوندريا (pctMT). قد تستبعد عتبات التصفية التقليدية، التي تم تحديدها من دراسات على الأنسجة الصحية، عن غير قصد الخلايا الخبيثة التي تظهر نسبة أعلى من pctMT الأساسية بسبب خصائصها البيولوجية الفطرية. من…
-
النمذجة الأيضية تكشف عن تراجع التفاعلات الأيضية المرتبطة بالشيخوخة بين المضيف والميكروبيوم في الفئران
2025 | المؤلف: Lena Best وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في التفاعل بين الشيخوخة والميكروبيوم المعوي، باستخدام الميتاجينوميات، والترانسكريبتوميات، والميتابولوميات من الفئران المسنّة جنبًا إلى جنب مع النمذجة الأيضية. تعيد الدراسة بناء نماذج أيضية متكاملة للميكروبات المضيفة والمعوية، كاشفة عن اعتماد معقد لعملية الأيض المضيف على كل من التفاعلات الميكروبية المعروفة والجديدة. من الجدير بالذكر أن الميكروبيوم المتقدم في السن يظهر انخفاضًا كبيرًا…
-
ذاكرة وراثية مستمرة للقاح mRNA لـ SARS-CoV-2 في البلعميات المشتقة من وحيدات النوى
2025 | المؤلف: Alexander Simonis وآخرون | المجلة: Molecular Systems Biology | المجال: علم المناعة (Immunology)تبحث هذه الدراسة في دور لقاحات mRNA في إنشاء ذاكرة مناعية من خلال تعديلات فوق جينية في خلايا المناعة الفطرية، وتحديداً البلعميات المشتقة من أحادية النواة البشرية. وجد الباحثون أن تطعيم mRNA ضد SARS-CoV-2 يزيد بشكل كبير من أسيتيل الهيستون H3 ليسين 27 (H3K27ac) في مناطق المحفز، مما يشير إلى تشكيل ذاكرة فوق جينية. ومن…
-
يؤثر التحرير الجيني عند نقاط CpG المرتبطة بالعمر على المشهد الجيني الواسع للشيخوخة الجينية
2025 | المؤلف: Sven Liesenfelder وآخرون | المجلة: Nature Aging | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تستكشف الدراسة تنظيم التغيرات في ميثلة الحمض النووي المرتبطة بالشيخوخة، والتي تعتبر أساسية للساعات الجينية. من خلال استخدام تحرير موجه بواسطة CRISPR في مواقع CpG المرتبطة بالعمر، لاحظ الباحثون تأثيرات جانبية كبيرة على مستوى الجينوم، مما يشير إلى أن التعديلات في المواقع المستهدفة يمكن أن تؤثر على المناطق المجاورة. ومن الجدير بالذكر أن تسلسل 4C…
-
Deep-ProBind: التنبؤ بالبروتينات المرتبطة باستخدام نموذج التعلم العميق القائم على المحولات
2025 | المؤلف: Salman Khan وآخرون | المجلة: BMC Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه القسم أهمية البروتينات المرتبطة في الأنظمة البيولوجية، مع التركيز على تفاعلاتها الانتقائية مع جزيئات مثل الحمض النووي، RNA، والببتيدات، والتي تعتبر حاسمة لمختلف الوظائف الخلوية. غالبًا ما تكون الطرق التقليدية لتحديد الببتيدات المرتبطة بالبروتينات غير فعالة وتفتقر إلى الدقة بسبب تركيزها على ميزات التسلسل القريبة دون النظر في البيانات الهيكلية. لمعالجة هذه التحديات،…
-
تحليل متعدد الأوميك يكشف عن التخليق الحيوي والتراكم المحدد للأنسجة للقلويدات ثنائية التيربين في Aconitum japonicum
2025 | المؤلف: Megha Rai وآخرون | المجلة: Journal of Natural Medicines | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تتركز الأبحاث حول *Aconitum japonicum*، وهي نبات معمر سام من اليابان، على توضيح المسارات الحيوية لتخليق القلويات الديتيربينية، وهي مركبات نشطة بيولوجيًا ذات إمكانات صيدلانية كبيرة. من خلال استخدام تحليلات الميتابولوم والترانسكريبتوم عالية الإنتاجية عبر أربعة أنسجة متميزة—الورقة، الجذر الأم، الجذر الابن، والجذر الصغير—تدمج الدراسة هذه البيانات للكشف عن أنماط التعبير الجيني وملفات الميتابوليت المرتبطة…
-
تراكم اللاكتات يحفز H4K12la لتنشيط تعبير RAD23A المدفوع بواسطة السوبر-معزز ويعزز مقاومة النيراباريب في سرطان المبيض
2025 | المؤلف: Bingfeng Lu وآخرون | المجلة: Molecular Cancer | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث هذه الدراسة في الآليات الكامنة وراء مقاومة النيراباريب في سرطان المبيض، وهو مرض خبيث يتميز بمعدلات عالية من التكرار والوفيات. قامت الدراسة بإنشاء خطوط خلايا سرطان المبيض المقاومة للنيراباريب واستخدمت تسلسل تكوين RNA في الموقع لتحديد المعززات المفعلة بشكل غير طبيعي والجينات المستهدفة المرتبطة بها. كانت إحدى النتائج المهمة هي زيادة التعبير عن الجين…
-
تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة وعلم النسخ المكاني يكشفان عن التباين والتواصل بين الخلايا للألياف المرتبطة بالسرطان في سرطان المعدة
2025 | المؤلف: Xijie Zhang وآخرون | المجلة: Journal of Translational Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تستكشف هذه الدراسة تباين الألياف المرتبطة بالسرطان (CAFs) داخل البيئة الدقيقة للورم (TME) في سرطان المعدة، مع التركيز على أدوارها في تقدم الورم والتواصل بين الخلايا مع الخلايا الظهارية الخبيثة (ECs). باستخدام بيانات تسلسل الخلايا الفردية من 24 عينة سرطان معدة، حدد الباحثون تسع فئات خلوية متميزة وستة تحت مجموعات من الألياف: الألياف الالتهابية (iCAFs)،…