الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: طي البروتين

المجالات المطوية تفرض تباينًا هيكليًا وديناميات مخففة في المكثفات البيولوجية

2026 | المؤلف: Liguo Wang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تستكشف هذه الدراسة الهيكل الداخلي للتركيزات البيومولكولية التي تتكون من بروتينات متعددة المجالات (MDPs) مقارنة بتلك التي تتكون فقط من المناطق غير المنضبطة بشكل جوهري (IDRs) أو المجالات ذات التعقيد المنخفض (LCDs). باستخدام محاكاة الديناميكا الجزيئية، يكشف المؤلفون أنه بينما تظهر التركيزات التي تحتوي على IDR فقط أشكالًا موسعة بشكل موحد على مدى عشرات الميكروثواني،…
إعادة تشكيل هيكلية آلة تكوين البروتينات الميتوكوندرية تحت ضغط بروتيوستاتي

2026 | المؤلف: Kenneth Ehses وآخرون | المجلة: Science Advances | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

اختبار CellTiter-Glo® 2.0 هو طريقة متجانسة لقياس عدد الخلايا الحية في الثقافة من خلال قياس مستويات ATP، التي تعكس النشاط الأيضي. يحسن هذا الاختبار من النسخ السابقة من خلال توفير كاشف أكثر استقرارًا يحافظ على أكثر من 85% من إخراج الضوء عند تخزينه في 4°C لمدة شهرين أو في درجة حرارة الغرفة لمدة سبعة أيام.…
إعادة تشكيل ألوستيري وطاقة لمجال PDZ بواسطة امتدادات مجالات البروتين

2026 | المؤلف: Cristina Hidalgo-Carcedo وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

في هذه الدراسة، يبحث المؤلفون في دور المجالات الهيكلية في البروتينات، مع التركيز على كيفية تأثير الإضافات لهذه المجالات على تنظيمها وقابليتها للتطور. من خلال تحليل أكثر من 190,000 نوع بروتين، يقيسون التغيرات في الطاقة الحرة المرتبطة بالطفرات في مجال PDZ ويفحصون حوالي 7,000 ارتباطات طاقية بين هذه الطفرات وإضافتين محددتين للمجال. تكشف النتائج أن…
بروتينات الصدمة الحرارية (Hsp70 و Hsp90) في التنكس العصبي: الأدوار المسببة للأمراض والإمكانات العلاجية

2026 | المؤلف: Noureddine Ben Khalaf | المجلة: Frontiers in Aging Neuroscience | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تتناول هذه المراجعة الدور الحاسم للشابيرات الجزيئية Hsp70 و Hsp90 في الحفاظ على توازن البروتين، وهو أمر حيوي لبقاء الخلايا العصبية ووظيفتها. مع تقدم العمر، تنخفض فعالية هذه الشابيرات، مما يزيد من القابلية للإصابة بالأمراض التنكسية العصبية مثل مرض الزهايمر وباركنسون، والتصلب الجانبي الضموري، ومرض هنتنغتون. يقدم المؤلفون فحصًا مفصلًا للخصائص الهيكلية، والأشكال المتعددة، والآليات…
الطي الناتج عن الارتباط يحكم تجميع سلسلة الضوء البديلة وتجميع مستقبل الخلايا البائية السابقة

2026 | المؤلف: Jasmin König وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المناعة (Immunology)

يبدو أن هذا القسم يقدم تحليل Western blot، والذي يهدف على الأرجح إلى تقييم مستويات التعبير عن بروتينات معينة في عينة بيولوجية. تشير الملاحظات إلى الكشف عن بروتينات بأوزان جزيئية تبلغ 70 كيلودالتون، 25 كيلودالتون، و15 كيلودالتون، باستخدام أجسام مضادة ضد Hsc70 وV5 وFLAG. تشير وجود عدة Bands عند 15 كيلودالتون إلى تعديلات محتملة بعد…
هياكل Cryo-EM لـ ClpXP البشري تكشف عن آليات التجميع والتفعيل البروتيني

2026 | المؤلف: Wenqian Chen وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

يلعب مجمع ClpXP البشري (hClpXP) دورًا حاسمًا في التحكم في جودة البروتينات الميتوكوندرية من خلال تكسير البروتينات غير المطوية وغير الضرورية. تستخدم هذه الدراسة مجهر الإلكترون بالتبريد عالي الدقة (cryo-EM) لتوضيح مسار التجميع الكامل لـ hClpXP، كاشفة أن hClpP يوجد كهيبتامر حلقي مفرد في العزلة. تم تحديد مجمع التجميع الأولي حيث يتفاعل hClpX سداسي مع…
تأثيرات الازدحام الجزيئي على استقرار البروتين في بروتينات بكتيرية

2026 | المؤلف: Kate McKeever وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تناقش هذه الفقرة مفهوم الازدحام الجزيئي، والذي يشير إلى المساحة المحدودة المتاحة لحركة الجزيئات في المحاليل بسبب وجود جزيئات كبيرة أخرى. يؤثر هذا الظاهرة بشكل كبير على عمليات بيولوجية متنوعة، بما في ذلك استقرار البروتين، والطيات، والانتشار، وحركيات الإنزيم، والتفاعلات الجزيئية، والانفصال الطوري. تسلط الدراسة الضوء على النقاش المستمر بشأن المساهمات النسبية للعوامل الانتروبية (الحجم…
تأثير محتوى GC على ولادة الجينات الجديدة

2026 | المؤلف: Paul Roginski وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في الخصائص الهيكلية والديناميات التطورية للبروتينات الصغيرة المستمدة من المناطق غير المشفرة في الجينومات حقيقية النواة، مع التركيز على تأثير تركيب النوكليوتيدات، وبشكل خاص محتوى GC، على هذه الخصائص. من خلال تحليل ملايين البروتينات الصغيرة المشفرة في إطارات القراءة المفتوحة غير المشفرة (ORFs) عبر 3,379 جينوم حقيقي النواة بمحتويات GC…
دور التحلل المرتبط بالشبكة الإندوبلازمية وابتلاع الشبكة الإندوبلازمية في الصحة والمرض

2026 | المؤلف: Young Joo Jeon وآخرون | المجلة: Signal Transduction and Targeted Therapy | المجال: علم الأحياء الخلوي (Cell Biology)

الشبكة الإندوبلازمية (ER) هي عضية حيوية مسؤولة عن تخليق، طي، ونقل البروتينات الإفرازية والبروتينات عبر الغشاء، والتي تعتبر ضرورية للحفاظ على توازن الخلايا وصحة الكائن الحي بشكل عام. تعمل أنظمة التحكم في جودة البروتين (PQC) الرئيسية، بما في ذلك استجابة البروتين غير المطوي (UPR)، والتحلل المرتبط بالشبكة الإندوبلازمية (ERAD)، وER-phagy، بالتعاون لإدارة سلامة البروتين ومنع…
التحقيق فيما إذا كانت نماذج التعلم العميق للتجميع المشترك تتعلم فيزياء تفاعلات البروتين-الليغاند

2025 | المؤلف: Matthew R. Masters وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدمات الأخيرة في توقع هيكل البروتينات والليغاندات المعتمدة على التعلم العميق، مع تسليط الضوء بشكل خاص على نماذج الطي المشترك مثل AlphaFold 3 (AF3) وRoseTTAFold All-Atom (RFAA). لقد أظهرت هذه النماذج تحسينات كبيرة في توقع هياكل البروتينات التي تتفاعل مع مختلف الجزيئات الحيوية، محققة دقة عالية من خلال الاستفادة…