الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: طي البروتين
-
توقعات AlphaFold للأشكال المتغيرة مدفوعة بتذكر الهيكل
2024 | المؤلف: Devlina Chakravarty وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في القدرات التنبؤية لـ AlphaFold (AF)، وخاصة في سياق بروتينات تغيير الطي، التي يمكن أن تتبنى أشكال هيكلية متعددة. تكشف الدراسة أن AF هو متنبئ ضعيف لتغيير الطي، حيث حقق معدل نجاح يبلغ 35% فقط للبروتينات التي من المحتمل أن تكون مدرجة في مجموعات التدريب الخاصة به. ومن الجدير بالذكر أن نجاحات النموذج…
-
التصميم الحسابي لنظائر البروتينات الغشائية القابلة للذوبان والوظيفية
2024 | المؤلف: Casper A. Goverde وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث نهجًا حسابيًا جديدًا يستخدم التعلم العميق، وبالتحديد AF2 seq-MPNN، لتصميم طيات البروتين المعقدة بكفاءة، بما في ذلك التسلسلات غير الطبيعية. يتميز هذا الإطار بمرونته وقابليته للتعميم، مما يلغي الحاجة إلى إعادة تدريب محددة للطيات أو قيود تصميم معقدة. نجح المؤلفون في هندسة عدة طيات بروتين صعبة، محققين معدلات نجاح تجريبية عالية للتصاميم القابلة…