الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
التطبيقات الصناعية لنماذج اللغة الكبيرة
2025 | المؤلف: Mubashar Raza وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الذكاء الاصطناعي (Artificial Intelligence)تُعتبر نماذج اللغة الكبيرة (LLMs) أنظمة ذكاء اصطناعي متقدمة مصممة لفهم وتوليد نصوص تشبه النصوص البشرية، وتتميز بمعلمات تدريبها الواسعة التي تمكنها من تمييز الأنماط اللغوية المعقدة. لقد عزز ظهور هياكل المحولات بشكل كبير من أدائها في مهام معالجة اللغة الطبيعية (NLP) المختلفة، مما أدى إلى تطبيقات واسعة النطاق عبر صناعات متعددة. في مجال الرعاية…
-
تحليل استقرار، طريقة توسيع نموذج $\:{\varvec{\phi\:}}^{6}$، وأدوات متنوعة للكشف عن الفوضى لنموذج DSKP
2025 | المؤلف: Mohammad Safi Ullah وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الفيزياء الإحصائية وغير الخطية (Statistical and Nonlinear Physics)تقدم هذه الورقة تطبيق طريقة توسيع نموذج $\varphi^6$ على نموذج ديفي-ستيوارتسون-كادومتسيف-بيتفيشفيلي (DSKP) في (4 + 1) أبعاد، وهو ذو صلة بمجالات متنوعة بما في ذلك الأمواج في المياه الضحلة، والهندسة الساحلية، وميكانيكا السوائل، وفيزياء البلازما. من خلال تحويل المعادلات التفاضلية الجزئية للنموذج إلى معادلات تفاضلية عادية من خلال علاقة متغيرة، يستخدم المؤلفون برامج حاسوبية لتحليل…
-
ستيريوبي: نمذجة التباين الخلوي المقارن والزمني المكاني عبر النسخ الجيني المكاني متعدد العينات
2025 | المؤلف: Shuangsang Fang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم هذا القسم Stereopy، وهو إطار عمل جديد مصمم لتحليل وتصوير بيانات النسخ الجيني المكاني متعددة العينات، معالجًا تعقيدات الديناميات الخلوية عبر ظروف وزمان وسياقات مكانية مختلفة. يتضمن الإطار حاوية عالمية، ووحدة تحكم نطاق، ومحول تكاملي، مما يسهل تخزين وإدارة ومعالجة البيانات متعددة الأنماط. يتم عرض Stereopy من خلال ثلاث تطبيقات رئيسية: تحديد مجتمعات الخلايا…
-
استكشاف وتوسيع الفضاء الكيميائي الطبيعي للديترينات البكتيرية
2025 | المؤلف: Xiuting Wei وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم استخدام تقنيات مختلفة من الرنين المغناطيسي النووي (NMR)، بما في ذلك \( ^1H \)، \( ^{13}C \)، وطرق NMR ثنائية الأبعاد مثل \( ^1H-^{13}C \) HSQC، \( ^1H-^1H \) COSY، \( ^1H-^{13}C \) HMBC، و\( ^1H-^1H \) NOESY، لتحليل العينات المذابة في CDCl\(_3\) أو C\(_6\)D\(_6\). تم معايرة جميع الانزياحات الكيميائية ضد…
-
ناقلات AAV تحفز استجابة تلف الحمض النووي المعتمدة على الإشارات الالتهابية في نماذج CNS المشتقة من خلايا iPSC البشرية ودماغ الفئران
2025 | المؤلف: Helena Costa Verdera وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الوراثة (Genetics)تظهر العلاج الجيني القائم على ناقلات الفيروسات المرتبطة بالأدينوفيروس (AAV) كعلاج واعد للاضطرابات العصبية الوراثية، ومع ذلك كشفت التجارب السريرية الأخيرة عن أحداث سلبية تعتمد على الجرعة لم يتم فهم آلياتها بالكامل. استخدمت هذه الدراسة خلايا جذعية متعددة القدرات المستحثة لنمذجة نقل AAV في أنواع خلايا الجهاز العصبي المركزي (CNS) البشرية، مما كشف أنه بينما…
-
تحديد المؤشرات الحيوية لرفاهية الأغنام باستخدام نموذج التباين الأيضي
2025 | المؤلف: Sarah Babington وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)في هذه الدراسة، بحث المؤلفون في العلامات البيولوجية المحتملة للحالة العقلية والتجربة في الأغنام، مستفيدين من الطب البشري لتقييم رفاهية الحيوانات. باستخدام نموذج اختلاف الطاقة الأيضية، قاموا بتغيير الحالة الأيضية للأغنام الأنثوية من سلالة ميرينو عبر ثلاث فترات تغذية لتقييم التغيرات في تجاربها وقدراتها على التكيف. شمل التصميم التجريبي ثلاث مجموعات: واحدة حافظت على نظام…
-
TRAPT: إطار عمل عميق متعدد المراحل للتعلم المدمج لتوقع المنظمات النسخية استنادًا إلى بيانات الإبيجينوم الواسعة النطاق
2025 | المؤلف: Guorui Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)إن تحديد المنظمين النسخيين التنظيميين (TRs) أمر حاسم لفهم التعبير الجيني في سياق ظهور الأمراض وتقدمها. تقدم هذه الدراسة أداة توقع نشاط المنظم النسخي (TRAPT)، وهي إطار تعلم عميق متعدد الوسائط مصمم لاستنتاج نشاط TR من خلال دمج الإمكانيات التنظيمية لعناصر التنظيم الجيني المستهدفة ومواقع الربط على مستوى الجينوم. تظهر النتائج التجريبية من 570 مجموعة…
-
scPRINT: التدريب المسبق على 50 مليون خلية يسمح بتوقعات قوية لشبكات الجينات
2025 | المؤلف: Jérémie Kalfon وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الفيزياء الحيوية (Biophysics)في هذا القسم، يقدم المؤلفون scPRINT، وهو نموذج أساسي مصمم خصيصًا لاستنتاج الشبكات الجينية (GNI). يتضمن scPRINT تحيزات استقرائية مبتكرة واستراتيجيات تدريب مسبق تعزز ملاءمته لـ GNI، مع معالجة القيود الملحوظة في النماذج الحالية. النموذج قادر على إنتاج شبكات جينية واسعة النطاق خاصة بنوع الخلية ويمكنه أيضًا إجراء توقعات لمهام ذات صلة متنوعة، بما في…
-
خرائط البروتيوميات البصرية العميقة لتحديد السمية البروتينية في مرض الكبد الوراثي
2025 | المؤلف: Florian A. Rosenberger وآخرون | المجلة: Nature | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)يتناول قسم ورقة البحث التحديات التي تطرحها أمراض طي البروتين غير الصحيح، وخاصة نقص α1-أنتي تريبسين (AATD)، ويقدم نهجًا جديدًا باستخدام البروتيوميات المكانية مع التعلم الآلي للتحقيق في هذه الحالات في أنسجة الكبد البشرية. من خلال استخدام البروتيوميات البصرية العميقة (DVP) جنبًا إلى جنب مع تحليل الخلايا الفردية، نجح البحث في رسم خرائط الأحداث الجزيئية…
-
إطار عمل آلي لتقييم مدى دقة استشهاد نماذج اللغة الكبيرة بالمراجع الطبية ذات الصلة
2025 | المؤلف: Kevin Z. L. Wu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)التزمت الدراسة بالمعايير الأخلاقية المعمول بها، والإرشادات، واللوائح المتعلقة بممارسات البحث. وقد ضمنت هذه الامتثال أن جميع المنهجيات المستخدمة كانت سليمة أخلاقياً ومتوافقة مع أفضل الممارسات في هذا المجال. كانت الطرق المحددة المستخدمة في الدراسة، على الرغم من عدم تفصيلها في هذا القسم، مصممة للحفاظ على نزاهة عملية البحث وحماية رفاهية أي مشاركين معنيين. يقدم…
