الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
التنبؤ بتفاعلات العاثيات على مستوى السلالة عبر جنس الإشريكية باستخدام المعلومات الجينومية فقط
2024 | المؤلف: Baptiste Gaborieau وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم البيئة (Ecology)تبحث هذه الدراسة في إمكانية التنبؤ بإصابات البكتريوفاج في سلالات بكتيرية محددة، مع التركيز على جنس *Escherichia*. توضح الدراسة أن نتائج تفاعلات الفاج والبكتيريا يمكن التنبؤ بها بدقة على مستوى السلالة باستخدام البيانات الجينومية، محققة منطقة تحت منحنى خصائص التشغيل المستقبلية (AUROC) بنسبة 86%. تم إنشاء مجموعة بيانات شاملة، تضم تفاعلات بين 403 سلالة متنوعة…
-
تحليل تسلسل الجينوم الكامل لأنواع البروسيلة المعزولة من المجترات في مناطق مختلفة من تركيا
2024 | المؤلف: Songül Ötkün وآخرون | المجلة: BMC Infectious Diseases | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تستكشف هذه الدراسة التنوع الجيني لعزلات بروسلا من مناطق مختلفة في تركيا، مع التركيز على آثارها على الصحة العامة والطب البيطري. تم تحديد 23 عزلة، بما في ذلك 21 من المجترات و2 من البشر، وتم تصنيفها باستخدام طرق الميكروبيولوجيا التقليدية، تلتها تسلسل الجينوم الكامل. أظهر التحليل النشوي القائم على تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة (SNPs) أن…
-
البروتيوميات المكانية للخلايا الفردية والعضيات على شرائح الأنسجة باستخدام بروتيوميات التوسع المدعومة بالمرشحات
2024 | المؤلف: Zhen Dong وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)اتبعت الدراسة جميع اللوائح المعنية بالمشاركين البشريين وتم تنفيذها بما يتماشى مع إعلان هلسنكي. تم الحصول على الموافقة لجمع واستخدام الأنسجة البشرية من لجنة الأخلاقيات المؤسسية في المستشفى الثاني التابع لجامعة تشجيانغ كلية الطب، وكذلك من لجنة الأخلاقيات في جامعة ويستليك. يضمن هذا الإشراف الأخلاقي أن البحث يتوافق مع المعايير المعمول بها لعلاج الموضوعات البشرية.…
-
مستقبلات الروائح المهندسة توضح أساس تمييز الروائح
2024 | المؤلف: Claire A. de March وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الأنظمة الحسية (Sensory Systems)تقدم هذه القسم نظرة عامة عن HAL، وهو أرشيف متعدد التخصصات مفتوح الوصول مصمم لإيداع ونشر الوثائق البحثية العلمية. يعمل كمنصة للأعمال المنشورة وغير المنشورة، مما يسهل الوصول إلى مجموعة واسعة من الأدبيات العلمية. الوثائق المؤرشفة في HAL تأتي من مصادر متنوعة، بما في ذلك مؤسسات التعليم والبحث في فرنسا وعلى الصعيد الدولي، بالإضافة إلى…
-
الببتيدات الذاتية الداخلية تحمي الامتياز المناعي للجهاز العصبي المركزي
2024 | المؤلف: Min Woo Kim وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الطب النفسي البيولوجي (Biological Psychiatry)يتناول هذا القسم من ورقة البحث التفاعل بين الجهاز العصبي المركزي (CNS) والجهاز المناعي، متحدياً الرؤية التقليدية لامتياز المناعة في CNS. يحدد المؤلفون مجموعة من الببتيدات الذاتية التنظيمية المستمدة من CNS والتي يتم تقديمها على جزيئات معقد التوافق النسيجي الرئيسي من الفئة الثانية (MHC-II). هذه الببتيدات ضرورية للحفاظ على التواصل بين CNS والجهاز المناعي المحيطي،…
-
أفضل الممارسات لتقدير وتقرير توزيعات التأخير الوبائي للأمراض المعدية
2024 | المؤلف: Kelly Charniga وآخرون | المجلة: PLoS Computational Biology | المجال: النمذجة والمحاكاة (Modeling and Simulation)تعتبر التأخيرات الوبائية حاسمة لإبلاغ سياسة الصحة العامة والممارسات السريرية، حيث تعمل كمدخلات أساسية للنماذج الرياضية والإحصائية التي توجه استراتيجيات السيطرة. تشير النتائج الأخيرة إلى أن قضايا مثل التعتيم، والتقليص الأيمن، والانحياز الديناميكي غالبًا ما تم التعامل معها بشكل غير كافٍ في تقدير هذه التأخيرات، مما يؤدي إلى انحيازات كبيرة يمكن أن تؤثر على مجموعة…
-
BFVD – مستودع كبير لهياكل البروتينات الفيروسية المتوقعة
2024 | المؤلف: Rachel Seongeun Kim وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم البيئة (Ecology)قاعدة بيانات هيكل البروتين AlphaFold (AFDB) هي مستودع شامل لهياكل البروتين المتوقعة، لكنها تفتقر إلى تغطية التسلسلات الفيروسية، مما يحد من البحث في علم الفيروسات. لسد هذه الفجوة، طور الباحثون قاعدة بيانات الفيروسات الكبيرة الرائعة (BFVD)، التي تحتوي على 351,242 هيكل بروتين تم التنبؤ به باستخدام ColabFold على ممثلي التسلسلات الفيروسية من مجموعات UniRef30. من…
-
اكتشاف الأجسام النانوية: مراجعة شاملة لتطبيقاتها وإمكاناتها على مدى السنوات الخمس الماضية
2024 | المؤلف: Elena Alexander وآخرون | المجلة: Journal of Nanobiotechnology | المجال: الأشعة والطب النووي والتصوير الطبي (Radiology, Nuclear Medicine and Imaging)تظهر النانوبodies (Nbs)، وهي قطع من الأجسام المضادة مشتقة من الأجسام المضادة ذات السلسلة الثقيلة فقط IgG في الجمال والأسماك الغضروفية، خصائص فريدة مثل الحجم الصغير، وارتفاع الألفة لربط المستضد، والثبات تحت ظروف قاسية، وسهولة الإنتاج. لقد وضعت هذه الخصائص Nbs كأدوات قيمة في التشخيص والعلاج. كانت الموافقة على الكابلاسيزوماب في عام 2018 علامة بارزة…
-
تحليل شامل للجينوم واكتشاف المتغيرات على نطاق واسع باستخدام DRAGEN
2024 | المؤلف: Sairam Behera وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم قسم “النتائج” النتائج الرئيسية للدراسة، مع تسليط الضوء على نتائج التجارب أو التحليلات التي تم إجراؤها. تشير البيانات إلى وجود ارتباط كبير بين المتغيرات قيد التحقيق، حيث تكشف التحليلات الإحصائية عن قيم p أقل من العتبة التقليدية 0.05، مما يشير إلى دليل قوي ضد فرضية العدم. بالإضافة إلى ذلك، تظهر النتائج أن التدخل المطبق…
-
رؤى قائمة على الثقافة وعلم الجينوم الميتاجينومي حول الحفاظ على الميكروبيوم التربة وتطبيقه للزراعة المستدامة
2024 | المؤلف: Elisa Clagnan وآخرون | المجلة: Frontiers in Microbiology | المجال: علوم النبات (Plant Science)تؤكد الورقة البحثية على الدور الحاسم لصحة التربة في الإنتاج الغذائي العالمي، خاصة مع استمرار زيادة السكان. وتبرز أهمية الميكروبيومات – التي تتكون من ميكروبات متنوعة وأنشطتها – في تحسين جودة التربة من خلال التحلل الحيوي للملوثات، ودورة المغذيات، وتنظيم الإجهاد للنباتات. تناقش الورقة نهجين لاستخدام الميكروبيومات: المجتمعات الميكروبية الاصطناعية، التي تم تصميمها لوظائف محددة،…