الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الأحياء الحاسوبي
-
جينوم سمكة الهاج فيش يوضح أحداث تكرار الجينوم الكامل للفقرات وعواقبها التطورية
2024 | المؤلف: Daqi Yu وآخرون | المجلة: Nature Ecology & Evolution | المجال: علم الوراثة (Genetics)تبحث الورقة البحثية في الآثار التطورية لظواهر تكرار الجينوم الكامل (WGD) في الفقاريات، مع التركيز على جينوم سمكة الهاج فيش الساحلية، *Eptatretus burgeri*. تهدف الدراسة إلى توضيح توقيت ونتائج جولتين من WGD، المعروفة باسم 1R و2R، خاصة فيما يتعلق بتباين الفقاريات ذات الفكوك (gnathostomes) والفقاريات عديمة الفك (cyclostomes) مثل الهاج فيش واللامبري. من خلال التحليلات…
-
الطبيعة المناعية لجزيئات الدهون mRNA
2024 | المؤلف: Preeti Sharma وآخرون | المجلة: Advanced Drug Delivery Reviews | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على الأهمية والتحديات المرتبطة بجزيئات الدهون النانوية (LNPs) المعتمدة على mRNA في البحث الطبي، وخاصةً من خلال دورها في تطوير لقاحات COVID-19. مع إعطاء 16 مليار جرعة، أظهرت منصة mRNA-LNP إمكانات علاجية كبيرة؛ ومع ذلك، فقد ارتبطت أيضًا بآثار جانبية خفيفة إلى شديدة في مجموعة من المتلقين. وهذا يبرز ضرورة…
-
منظور جديد حول مطيافية الأشعة تحت الحمراء كطريقة مسبقة للفحص لتحليل النظائر الجزيئية والثابتة على العظام البشرية القديمة
2024 | المؤلف: Cinzia Scaggion وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الآثار (Archeology)تستكشف الأبحاث تطبيق مطيافية الأشعة تحت الحمراء كطريقة فحص مسبق لتقييم جودة الأنسجة الهيكلية، وخاصة العظام الصلبة وجذور الأسنان، في المجموعات الأثرية. تهدف هذه الطريقة الأقل تدخلاً إلى تسهيل تحديد الحمض النووي القديم القابل للحياة (aDNA) دون الحاجة إلى إجراءات مختبرية مكلفة وشاملة. تسلط الدراسة الضوء على القيمة المعلوماتية الفريدة للهياكل العظمية الكثيفة، الغنية بالحمض…
-
تحديد تباين الأنماط الجزيئية التوافقية لسرطان القولون باستخدام النسخ الجزيئي المكاني
2024 | المؤلف: Alberto Valdeolivas وآخرون | المجلة: npj Precision Oncology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش الورقة البحثية قيود الأنماط الجزيئية التوافقية (CMS) لسرطان القولون والمستقيم (CRC) بسبب التباين داخل الورم، مما يعيق فائدتها السريرية. لمعالجة هذه المشكلة، استخدم المؤلفون تقنيات النسخ الجزيئي المكاني (ST) جنبًا إلى جنب مع تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة (scRNA-seq) لتحليل التركيب الخلوي والجزيئي المكاني لـ CRC. سمح هذا النهج برسم خرائط مفصلة للتباين…
-
إحضار التركيز المناعي إلى بؤرة التركيز
2024 | المؤلف: Sriharshita Musunuri وآخرون | المجلة: npj Vaccines | المجال: علم الفيروسات (Virology)تناقش هذه القسم التركيز المناعي، وهي استراتيجية تهدف إلى تصميم المناعية التي تعيد توجيه الاستجابات المناعية الخلطية نحو الأبيوتوب المرغوب فيه مع تقليل الاستجابات للأبيوتوبات غير المستهدفة. هذه الطريقة ذات صلة خاصة بتطوير اللقاحات “العالمية” ضد الفيروسات المتغيرة بشكل كبير، بما في ذلك الإنفلونزا، HIV-1، وSARS-CoV-2. يحدد المؤلفون خمس استراتيجيات رئيسية للتركيز المناعي: تعزيز عبر…
-
PROTACs المعتمدة على DCAF1 ذات النشاط ضد الأهداف المعتمدة سريريًا والتي تتغلب على مقاومة المحلل الداخلي والمكتسب
2024 | المؤلف: Martin Schröder وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم استخدام خلايا HEK293T (أنثوية) وسلالتين محددتين من خلايا HEK293، مجموعة HEK293/BRD9-HiBiT KI (PROMEGA #CS3023119) ومجموعة HEK293/BRD7-HiBiT KI (PROMEGA #CS3023124) لأغراض تجريبية. تم زراعة هذه الخلايا في وسط دلبوكو المعدل (DMEM، Gibco cat#11995-065) مع إضافة 10% من مصل البقر الجنيني (FBS، Avantor cat#97068-085). بالإضافة إلى ذلك، تم زراعة خلايا TMD8 67 (ذكورية)…
-
البيوجينيسيس وتوصيل الحويصلات خارج الخلوية: استغلال قوة الحويصلات خارج الخلوية للتشخيص والعلاج
2024 | المؤلف: Jivin Yu وآخرون | المجلة: Frontiers in Molecular Biosciences | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)الحويصلات خارج الخلوية (EVs) هي جزيئات محاطة بغشاء يتم إفرازها بواسطة أنواع مختلفة من الخلايا، وتحتوي على مجموعة واسعة من الجزيئات الحيوية مثل البروتينات والأحماض النووية والدهون والمواد الأيضية. تلعب دورًا مهمًا في التواصل بين الخلايا وقد حظيت باهتمام كبير لإمكاناتها كعلامات حيوية وعوامل علاجية في مختلف الأمراض. فهم نشوء الحويصلات خارج الخلوية أمر ضروري…
-
تحسين توقعات بنية البروتينات الأحادية والمعقدة باستخدام DeepMSA2 مع بيانات الميتاجينوم الضخمة
2024 | المؤلف: Wei Zheng وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تم تقديم خط أنابيب DeepMSA2 كنهج جديد لبناء محاذاة متعددة التسلسلات الموحدة (MSAs) للبروتينات أحادية ومتعددة السلاسل، باستخدام بحث محاذاة تكراري عبر قواعد البيانات الجينومية والميتا جينومية. تشير الاختبارات الشاملة إلى أن MSAs التي تم إنشاؤها بواسطة DeepMSA2 تعزز بشكل كبير دقة توقعات الهيكل الثلاثي والرباعي للبروتين مقارنة بالطرق الحالية المتطورة. ومن الجدير بالذكر أنه…
-
تجميع الميتاجينوم عالي الجودة من قراءات طويلة دقيقة باستخدام metaMDBG
2024 | المؤلف: Gaëtan Benoit وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “الطرق” يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. يتفصل في معايير اختيار المشاركين، التدخلات المحددة التي تم إدارتها، ومدة الدراسة. تشمل المنهجية مقاييس كمية، مثل الاختبارات الإحصائية المستخدمة لتحليل البيانات، مما يضمن قوة النتائج. بالإضافة إلى ذلك، يصف القسم الأدوات والآلات المستخدمة لجمع البيانات، بما في ذلك أي استبيانات أو تقييمات. يؤكد المؤلفون…
-
تحليل LC–MS، نهج تثبيط كيناز C-ABL في المختبر وفي السليكو لتحديد عوامل مضادة للسرطان المحتملة من أوراق Dalbergia sissoo
2024 | المؤلف: Hem N. Naik وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تبحث الدراسة في الخصائص الطبية لـ *Dalbergia sissoo*، وهو عضو في عائلة الفاباسيا، مع التركيز بشكل خاص على إمكاناته السامة للخلايا ضد السرطان. تسلط الدراسة الضوء على خصائص النبات الخافضة للحرارة، والمضادة للالتهابات، والحامية للقلب، إلى جانب استخدامه التقليدي في علاج السرطان. على الرغم من فوائده المعترف بها، فإن الرؤى التفصيلية حول أنشطته البيولوجية وتركيبه…