الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: علم الجينوم
-
تغييرات جينية وتعبيرية للخلايا الفردية في دماغ الإنسان المتقدم في العمر
2025 | المؤلف: Ailsa M. Jeffries وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث تأثير الشيخوخة على الدماغ البشري، مع التركيز بشكل خاص على القشرة الجبهية (PFC). باستخدام تقنيات متقدمة مثل تسلسل RNA أحادي النواة (snRNA-seq)، وتسلسل الجينوم الكامل للخلايا الفردية (scWGS)، والترانسكريبتوميات المكانية، تحدد الدراسة تغييرات كبيرة في التعبير الجيني والوراثي على مدار حياة الإنسان، من الطفولة إلى المعمرين. تشمل النتائج الرئيسية…
-
تكشف الميتوجينوميات المقارنة عن المحركات التطورية للديدان الخيطية من نوع Strongyloidea التي تعيش في الجهاز الهضمي
2025 | المؤلف: Junyan Li وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تبحث الدراسة في الجينوم الميتوكوندري للسوبر عائلة سترونجيلايد، وهي مجموعة هامة من الطفيليات المعوية التي تؤثر على المجترات والماشية. هذه الدراسة هي الأولى من نوعها التي تعيد بناء النشوء والتطور للسترونجيلايد وتفحص ديناميات الاختيار الخاصة بالموائل عبر موائل معوية مختلفة، وهي الكرش، الأمعاء الدقيقة، والأمعاء الغليظة. تكشف النتائج عن تجمعات نشوء قوية بين الأنواع، تتميز…
-
نظام Systema: إطار لتقييم توقع استجابة الاضطراب الجيني بما يتجاوز التباين المنهجي
2025 | المؤلف: Ramón Viñas وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في مجال الجينوميات الوظيفية، يمثل التنبؤ بالاستجابات النسخية للت perturbations الجينية تحديات كبيرة. يبرز هذا البحث أن الطرق الحالية غالبًا ما تفشل في التعميم خارج التغيرات النظامية – على وجه التحديد، الاختلافات النسخية بين الخلايا المتأثرة والخلايا الضابطة التي تنشأ من تحيزات الاختيار أو العوامل المربكة. يقوم المؤلفون بتحديد هذا التباين عبر عشرة مجموعات بيانات،…
-
تسلسل طويل القراءة مع تحديد الجينوم يوسع التنوع الميكروبي المعروف عبر المواطن الأرضية
2025 | المؤلف: Mantas Sereika وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على التقدمات الكبيرة التي جعلها تسلسل الحمض النووي طويل القراءة وعالي الإنتاجية ممكنة في استعادة الجينومات الميكروبية من عينات بيئية معقدة. من خلال تسلسل نانوبور العميق وطويل القراءة لـ 154 عينة من التربة والرواسب من مشروع Microflora Danica، نجح المؤلفون في تحديد جينومات من 15,314 نوعًا ميكروبيًا لم يتم وصفه سابقًا. استخدمت…
-
تقييم القوة التمثيلية لنماذج اللغة المعتمدة على الحمض النووي المدربة مسبقًا في علم الجينوم التنظيمي
2025 | المؤلف: Ziqi Tang وآخرون | المجلة: Genome biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم ظهور نماذج اللغة الجينومية (gLMs) طريقة جديدة وغير خاضعة للإشراف لتعلم الأنماط التنظيمية الجينية في الجينوم غير المشفر، متجاوزًا الحاجة إلى تسميات النشاط الوظيفي من البيانات التجريبية. على الرغم من الدراسات السابقة التي تشير إلى أن نماذج gLM المدربة مسبقًا يمكن أن تعزز الأداء التنبؤي في علم الجينوم التنظيمي، فإن هذا البحث يقيم قدرتها…
-
اتحاد الجينوم النفسي: الاكتشافات والاتجاهات
2025 | المؤلف: Arpana Agrawal وآخرون | المجلة: The Lancet Psychiatry | المجال: علم الوراثة (Genetics)لقد تقدم اتحاد الجينوم النفسي (PGC) بشكل كبير في فهم التغيرات الجينية المرتبطة بالاضطرابات النفسية والحالات النمائية العصبية على مدار السنوات الخمس الماضية. تبرز هذه المراجعة النتائج الرئيسية في خمسة مجالات حيوية: تحديد المتغيرات الشائعة من خلال دراسات الارتباط على مستوى الجينوم، ودور التغيرات الجينية النادرة بالتزامن مع المخاطر متعددة الجينات، وتطبيق الرؤى الجينية خارج…
-
الجينوميات الميتوكوندرية الشاملة لفاسيولا جيجانتكا من السودان: رؤى حول التنوع الجيني، الديناميات التطورية، وتكيف المضيف
2025 | المؤلف: Bashir Salim وآخرون | المجلة: Frontiers in Veterinary Science | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تدرس هذه الدراسة الجينومات الميتوكوندرية الكاملة لـ *Fasciola gigantica* من الأبقار والأغنام والماعز في السودان، بهدف توضيح التنوع الجيني، الديناميات التطورية، وتكيفات العائل. باستخدام تقنية إيلومينا ميسيك عالية الإنتاجية، قام الباحثون بتسلسل الجينومات بمتوسط 14,483 زوج قاعدي، متجاوزة قليلاً طول الجينوم المرجعي البالغ 14,478 زوج قاعدي. كشفت التحليلات عن تباينات جينية ملحوظة، بما في ذلك…
-
التمايز البيئي والسكان على مستوى الجينوم القوي يدعم التكيف والضعف الجيني العالي في الطحالب الأسترالية السائدة (Ecklonia radiata)
2025 | المؤلف: Antoine J. P. Minne وآخرون | المجلة: Ecology and Evolution | المجال: علم المحيطات (Oceanography)الانخفاض المستمر والمتوقع في غابات الطحالب بسبب تغير المناخ يتطلب فحص القدرة التكيفية لجموع الطحالب لتوجيه جهود الحفظ. تركز هذه الدراسة على الطحلب الأسترالي السائد، *Ecklonia radiata*، الذي تم تحديد جينومه عبر 10 مواقع على طول شريط بطول 2000 كم على الساحل الشرقي لأستراليا، والذي يتميز بتدرج حراري يبلغ 9.5 درجة مئوية. باستخدام تسلسل ddRAD،…
-
ما وراء الجينوميات السريرية: معالجة الفجوات الحرجة في مراقبة مقاومة مضادات الميكروبات في الصحة الواحدة
2025 | المؤلف: Diana Vallejo-Espín وآخرون | المجلة: Frontiers in Microbiology | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تسلط هذه الفقرة الضوء على التهديد العالمي المتزايد لمقاومة مضادات الميكروبات (AMR) ونقص طرق المراقبة الحالية، التي تركز بشكل أساسي على العزلات السريرية بينما تتجاهل الخزانات البيئية والحيوانية. على الرغم من أن تسلسل الجيل التالي (NGS)، وخاصة تسلسل الجينوم الكامل (WGS)، قد غير مراقبة AMR، لا تزال هناك فجوات كبيرة في فهم ديناميات AMR عبر…
-
الجينوم وجينوم بنك الجينات لنبات التبغ الألوتيترايبلويك تقدم رؤى حول تطور الجينوم وتنظيم الصفات المعقدة
2025 | المؤلف: Yanjun Zan وآخرون | المجلة: Nature Genetics | المجال: التقنية الحيوية (Biotechnology)تناقش هذه القسم التحديات المرتبطة بالتكرار غير المكتمل للجينومات، خاصة في سياق *Nicotiana tabacum* (التبغ) وأنواعها السلفية. يبرز عدة آليات تم الإشارة إليها في هذه العملية، بما في ذلك تبادل الكروموسومات المتجانسة، وإعادة تنشيط العناصر القابلة للتحويل (TEs)، وإعادة نمذجة الميثيل الحمضي النووي. ومع ذلك، تقدم الأدبيات نتائج متضاربة بشأن هذه الآليات، مما يشير إلى…