الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: قواعد البيانات، الوراثية
-
plantiSMASH 2.0: تحسينات على الكشف والتعليق والأولوية لمجموعات الجينات البيوسنتيكية للنباتات
2026 | المؤلف: Elena Del Pup وآخرون | المجلة: Journal of Molecular Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول قسم ورقة البحث التقدمات في plantiSMASH 2.0، وهي أداة مصممة لتحديد مجموعات الجينات الحيوية (BGCs) في النباتات، والتي تعتبر حاسمة لإنتاج المركبات النشطة بيولوجيًا ذات التطبيقات في الطب والزراعة والتغذية. النسخة المحدثة تعزز الإطار الأصلي من خلال دمج قواعد الكشف المعدلة والإضافية لـ 12 نوعًا من BGCs، مما يمكّن من تعدين الجينوم بدقة أكبر.…
-
توقيت متعدد الطبقات لتنظيم القلب اليومي يساهم في الوقاية وعلاج أمراض القلب والأوعية الدموية
2026 | المؤلف: Lanxiao Zhu وآخرون | المجلة: Vascular Health and Risk Management | المجال: الأنظمة الصماء والذاتية (Endocrine and Autonomic Systems)تستكشف هذه الدراسة التنظيم المعقد للتعبير الجيني اليومي القلبي، كاشفة أنه يعمل من خلال إطار متعدد الطبقات وغير متزامن بدلاً من مسار بسيط من النسخ إلى البروتين. باستخدام نهج تكاملي في السليكو، قام الباحثون بتحليل بيانات RNA-seq الزمنية، والبروتيوميات، والفوسفوبروتيوميات، وحددوا 2,552 نسخة إيقاعية و139 بروتين إيقاعي، مع وجود 31 جينًا فقط يظهرون الإيقاع على…
-
تحديث انتشار مرض فون ويلبراند العالمي والتنوع العرقي بناءً على تحليل علم الوراثة السكانية
2026 | المؤلف: Omid Seidizadeh وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: أمراض الدم (Hematology)يُعتبر مرض فون ويلبراند (VWD) الأكثر شيوعًا بين اضطرابات النزيف الوراثية؛ ومع ذلك، فإن انتشاره العالمي وتوزيع الأنماط الظاهرية المختلفة لا يزال غير موصوف بشكل كافٍ. استخدمت هذه الدراسة طرق علم الأوبئة الجينية لتقديم تقديرات أكثر دقة لانتشار VWD على نطاق السكان عبر مجموعات عرقية مختلفة، مستندة إلى بيانات من قاعدة بيانات تجميع الجينوم (gnomAD-v4.1)،…
-
قاعدة بيانات سورغوم: قاعدة معرفية لعلم جينوم السورغوم، والظواهر، ومشاركة أصحاب المصلحة
2026 | المؤلف: Nicholas Gladman وآخرون | المجلة: Genetics | المجال: علم الوراثة (Genetics)تقدم هذه القسم نظرة عامة على SorghumBase، قاعدة المعرفة المصممة لمجتمع أبحاث الدخن، مع التأكيد على أهمية مركزية بيانات المجتمع والموارد بما يتماشى مع مبادئ البحث القابل للاكتشاف، والوصول، والتشغيل البيني، وإعادة الاستخدام (FAIR). تجمع SorghumBase بين البيانات الجينومية، والترانسكريبتومية، والتنوع، والبيانات الظاهرية، بينما تقدم أيضًا معلومات عن الفعاليات المجتمعية، وتصويرات غنية، والوصول إلى البيانات…
-
تحديد الجينات المحورية المرتبطة بالإمباغليفلوزين في تصلب الشرايين وعلاقاتها مع التسلل المناعي: تحليلات علم الأدوية الشبكية والمعلوماتية الحيوية
2026 | المؤلف: Yicheng Rong وآخرون | المجلة: PLoS ONE | المجال: علم المناعة (Immunology)تستكشف هذه الدراسة الآليات الجينية والجزيئية التي من خلالها يؤثر إمباجليفلوزين، وهو مثبط انتقائي لناقل الصوديوم والجلوكوز 2 (SGLT2)، على تأثيراته المضادة للتصلب العصيدي، لا سيما في سياق التصلب العصيدي (AS). تحدد الأبحاث ارتباطات مهمة بين الجينات المحورية المرتبطة بإمباجليفلوزين—وبالتحديد IL1B، EGFR، ERBB2، JAK2، SYK، وLGALS3—ومجموعات مختلفة من خلايا المناعة، بما في ذلك خلايا CD8+…
-
تطوير قاعدة بيانات شاملة وأداة بحث لبيانات ATAC-seq أحادية الخلية
2026 | المؤلف: Arrian Gibson-Khademi وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم تطوير scATAC.Explorer، وهو قاعدة بيانات شاملة مصممة لمعالجة نقص مستودع محدد لمجموعات بيانات اختبار الخلايا الفردية للوصول إلى الكروماتين القابل للوصول بواسطة الترانسبوزاز باستخدام التسلسل (scATAC-seq). تعتبر تقنية scATAC-seq تقنية محورية تعزز فهمنا لوصول الكروماتين وتنظيم الجينات، مع آثار كبيرة على تطوير الخلايا وبحوث الأمراض. يجمع scATAC.Explorer مجموعة مختارة من 39 مجموعة…
-
JASPAR 2026: توسيع ملفات ارتباط عوامل النسخ ودمج نماذج التعلم العميق
2025 | المؤلف: Damla Ovek وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قاعدة بيانات JASPAR، وهي مورد مفتوح الوصول لملفات ارتباط الحمض النووي لعوامل النسخ (TFs)، قد شهدت تحديثات كبيرة في إصدارها الحادي عشر. تم توسيع مجموعة CORE بنسبة 12%، مع إضافة 306 مصفوفات تكرار موضع جديدة أو محدثة (PFMs)، بينما شهدت مجموعة UNVALIDATED زيادة بنسبة 60% مع 433 ملفًا جديدًا. يتضمن هذا التحديث دمج برنامج inMOTIFin…
-
التنقل في البيانات على بوابة ENCODE
2025 | المؤلف: Meenakshi S. Kagda وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم قسم “النتائج” في ورقة البحث النتائج الرئيسية المستمدة من التجارب والتحليلات التي تم إجراؤها. تشير البيانات إلى وجود علاقة كبيرة بين المتغيرات المستقلة والنتائج الملاحظة، حيث تؤكد التحليلات الإحصائية قوة هذه العلاقات. على وجه التحديد، تظهر النتائج أنه مع زيادة المتغير $X$، يحدث زيادة مقابلة في المتغير $Y$، والتي تم قياسها باستخدام تحليل الانحدار…
-
إصدار GTDB 10: تصنيف كامل ومنهجي لـ 715,230 جينوم بكتيري و17,245 جينوم أثري
2025 | المؤلف: Donovan H. Parks وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قاعدة بيانات تصنيف الجينوم (GTDB) تقدم تصنيفًا متسقًا من الناحية النشوء والتطور ومعدلًا موحدًا للجينومات بدائية النواة، باستخدام بيانات من قاعدة بيانات تجميع NCBI. اعتبارًا من الإصدار 10 (R10-RS226)، تشمل GTDB 715,230 جينومًا بكتيريًا و17,245 جينومًا أثريًا، منظمة في 136,646 مجموعة من الأنواع البكتيرية و6,968 مجموعة من الأنواع الأثرية. تشير النتائج إلى انخفاض معدل اكتشاف…
-
ريتجين، أطلس جيني شامل للأمراض الشبكية الوراثية
2025 | المؤلف: Carlo Rivolta وآخرون | المجلة: The American Journal of Human Genetics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)الأمراض الوراثية للشبكية (IRDs) هي اضطرابات جينية نادرة تتميز بتنوع جيني كبير وأنماط وراثية مختلفة، مما يؤدي إلى ضعف البصر. على الرغم من التقدم في اكتشاف الجينات، فإن التحديات في فهم وظائف الجينات وتفسير المتغيرات الجينية تعقد التشخيص الجزيئي والبحث في IRDs. إحدى القضايا الرئيسية هي نقص كتالوج شامل للجينات المرتبطة بالمرض، وهو أمر ضروري…