الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: كروماتين
-
استجابة حالات الميكروغليا المحددة مكانيًا مع وصول كروماتين مميز في نموذج فأر لمرض الزهايمر
2025 | المؤلف: Alberto Ardura-Fabregat وآخرون | المجلة: Nature Neuroscience | المجال: طب الأعصاب (Neurology)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في التغيرات النسخية والتنوع بين الميكروغليا المرتبطة بالأطراف (PAM) وغير المرتبطة بالأطراف المجاورة في سياق علم الأمراض الأميلويدية. باستخدام تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq)، تمكنوا من تمييز PAM و غير PAM بناءً على علامات سطحية محددة (تعبير CD11c) وأكدوا ملفاتهم النسخية المتميزة. كشفت التحليلات أن تجمعات PAM (C0 و C1)…
-
عدوى البروسيلة تحفز إعادة هيكلة الكروماتين في خلايا المضيف لتنشيط الاستجابات المناعية
2025 | المؤلف: Dejian Xie وآخرون | المجلة: Frontiers in Immunology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تبحث الدراسة في تأثير Brucella spp. على إعادة هيكلة الكروماتين في المضيف أثناء العدوى، مما يعالج فجوة كبيرة في فهم تفاعلات المضيف والجراثيم. باستخدام نموذج في المختبر من البلعميات الماوسية RAW264.7 المصابة بـ Brucella، استخدمت الدراسة تقنيات متعددة الأومكس، بما في ذلك Hi-C وATAC-seq وRNA-seq، لتحليل التغيرات في بنية الكروماتين وتنظيم الجينوم. كشفت النتائج عن…
-
فك شفرة دور تعديلات الهيستون في الذاكرة وخلايا CD8 T المستنفدة
2025 | المؤلف: Hua Huang وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم المناعة (Immunology)تستكشف الدراسة التنظيم النسخي والإيبيجينتيكي لخلايا CD8 T المستنفدة (T_EX) في سياق العدوى المزمنة والسرطان، مع تسليط الضوء على قدرتها الوظيفية المنقوصة مقارنة بخلايا CD8 T الذاكرة (T_MEM). قام الباحثون بتوصيف تعديلات ما بعد الترجمة الرئيسية للهستون (hPTMs)، وتحديدًا العلامات المنشطة (H3K27ac و H3K4me3) والعلامات الكابحة (H3K27me3 و H3K9me3)، عبر خلايا CD8 T الساذجة (T_N)…
-
مصفوفة خارج الخلية لزجة مرنة تعزز إعادة تشكيل الجينات والمرونة الخلوية
2025 | المؤلف: Yifan Wu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الجراحة (Surgery)تدرس الدراسة تأثير الخصائص اللزجة المرنة للمصفوفات خارج الخلوية على بنية النواة والإيبيجينوم، كاشفة عن نتائج مهمة تتعلق بسلوك الخلايا على صلابة الركيزة المختلفة. لوحظ أن الخلايا الليفية المزروعة على الركائز اللزجة المرنة الأكثر ليونة أظهرت نوى أكبر، وانخفاض في انضغاط الكروماتين، وتغيرات في ملفات التعبير الجيني المتعلقة بالوظائف الهيكلية والنوية، مقارنة بتلك الموجودة على…
-
TRAPT: إطار عمل عميق متعدد المراحل للتعلم المدمج لتوقع المنظمات النسخية استنادًا إلى بيانات الإبيجينوم الواسعة النطاق
2025 | المؤلف: Guorui Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)إن تحديد المنظمين النسخيين التنظيميين (TRs) أمر حاسم لفهم التعبير الجيني في سياق ظهور الأمراض وتقدمها. تقدم هذه الدراسة أداة توقع نشاط المنظم النسخي (TRAPT)، وهي إطار تعلم عميق متعدد الوسائط مصمم لاستنتاج نشاط TR من خلال دمج الإمكانيات التنظيمية لعناصر التنظيم الجيني المستهدفة ومواقع الربط على مستوى الجينوم. تظهر النتائج التجريبية من 570 مجموعة…
-
اللاكتات ينشط المناعة المدربة من خلال تغذية دورة حمض الثلاثي الكربوكسيليك وتنظيم اللاكتيل في الهيستونات
2025 | المؤلف: Huanhuan Cai وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المناعة (Immunology)تناقش هذه القسم من ورقة البحث مفهوم المناعة المدربة، والذي يشير إلى الذاكرة طويلة الأمد لخلايا المناعة الفطرية، وتحقق في كيفية تأثير توفر المغذيات البيئية، وبشكل خاص مصادر الكربون، على هذه الظاهرة. تكشف الدراسة أن المونوسيتات المدربة تفضل استخدام اللاكتات بدلاً من الجلوكوز كمادة أساسية لدورة حمض الكربوكسيليك الثلاثي (TCA)، وهو أمر حاسم لإنتاج السيتوكينات…
-
يكشف تحليل الوصول إلى الخلايا الفردية والكروماتين عن برامج تنظيمية لخلايا Th2 المسببة للأمراض في الربو التحسسي
2025 | المؤلف: Matarr Khan وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المناعة (Immunology)قسم “الطرق” يوضح الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يتفصل في معايير اختيار المشاركين، وتصميم التجارب، والتقنيات المحددة المستخدمة لجمع البيانات وتحليلها. استخدم الباحثون مجموعة من الطرق الكمية والنوعية لضمان فهم شامل للظواهر قيد التحقيق. تم إجراء التحليلات الإحصائية باستخدام برامج مناسبة، مع تحديد مستويات الدلالة عند p < 0.05. شملت المنهجيات تجارب محكومة، واستطلاعات،…
-
يكشف تحليل نسخ المحفزات عن موت الخلايا بالحديد المدفوع بواسطة RNA المحفز وفرص علاجية جديدة في سرطان البروستاتا
2025 | المؤلف: Sheng Ma وآخرون | المجلة: Signal Transduction and Targeted Therapy | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)تستكشف هذه الدراسة دور RNAs المعززة (eRNAs) في سرطان البروستاتا، مع التركيز على وظائفها التنظيمية في التعبير الجيني. باستخدام تحليلات الوصول إلى الكروماتين المتكاملة وتحليلات النسخ من خلال ATAC-seq وRNA-seq على عشرين زوجًا من أنسجة سرطان البروستاتا وأنسجة حميدة متطابقة، حدد الباحثون eRNAs المعبر عنها بشكل مختلف المرتبطة بالجينات المشاركة في تطوير البروستاتا والمسارات السرطانية.…
-
تعديلات الهيستون على مستوى الخلية الواحدة لتتبع سلالة الأجنة
2025 | المؤلف: Min Liu وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، تبحث الدراسة في آثار ثلاثة أنواع محددة من RNA المتداخل الصغير (siRNAs) تستهدف جينات معينة، باستخدام تركيز إجمالي قدره 20 ميكرومتر لكل مجموعة علاج. تم استخدام siRNA غير المستهدف (NC) أيضًا بنفس التركيز ليكون بمثابة مقارنة أساسية. التسلسل المحدد لـ siRNA غير المستهدف هو UGGGACUUGCAGGCCUGAUAUTT، بينما الجين المستهدف في هذا السياق هو…
-
التعاون بين مسار الهيبو وتنشيط مسار MAPK يدفع المقاومة المكتسبة لتثبيط TEAD
2025 | المؤلف: Sayantanee Paul وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الخلوي (Cell Biology)تبحث الدراسة في دور عوامل النسخ TEAD (TEAD1-4) كفاعلين رئيسيين في مسار إشارة هيبو في السرطان، مع التركيز بشكل خاص على الآليات وراء المقاومة لتثبيط TEAD بواسطة المثبط الشامل TEAD GNE-7883. تكشف الدراسة أن المقاومة مدفوعة بزيادة التعبير عن عوامل النسخ AP-1، وبالتحديد FOSL1، والتي، جنبًا إلى جنب مع استعادة نشاط YAP (بروتين مرتبط بـ…