الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: مجالات البروتين
-
إعادة تشكيل ألوستيري وطاقة لمجال PDZ بواسطة امتدادات مجالات البروتين
2026 | المؤلف: Cristina Hidalgo-Carcedo وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، يبحث المؤلفون في دور المجالات الهيكلية في البروتينات، مع التركيز على كيفية تأثير الإضافات لهذه المجالات على تنظيمها وقابليتها للتطور. من خلال تحليل أكثر من 190,000 نوع بروتين، يقيسون التغيرات في الطاقة الحرة المرتبطة بالطفرات في مجال PDZ ويفحصون حوالي 7,000 ارتباطات طاقية بين هذه الطفرات وإضافتين محددتين للمجال. تكشف النتائج أن…
-
الطي الناتج عن الارتباط يحكم تجميع سلسلة الضوء البديلة وتجميع مستقبل الخلايا البائية السابقة
2026 | المؤلف: Jasmin König وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المناعة (Immunology)يبدو أن هذا القسم يقدم تحليل Western blot، والذي يهدف على الأرجح إلى تقييم مستويات التعبير عن بروتينات معينة في عينة بيولوجية. تشير الملاحظات إلى الكشف عن بروتينات بأوزان جزيئية تبلغ 70 كيلودالتون، 25 كيلودالتون، و15 كيلودالتون، باستخدام أجسام مضادة ضد Hsc70 وV5 وFLAG. تشير وجود عدة Bands عند 15 كيلودالتون إلى تعديلات محتملة بعد…
-
يتم إعاقة القطع العابر لـ CRISPR-Cas9 بواسطة حلقة R محاطة، وموصل مطول، ونطاق HNH غير النشط
2026 | المؤلف: Roser Montagud‐Martínez وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، يبحث المؤلفون في الآليات التي تعالج بها Cas9 الحمض النووي أحادي السلسلة poly(T) بطريقة موجهة بواسطة RNA. يحددون عدة عوامل حاسمة تؤثر على هذه النشاطات التقطيعية. من الجدير بالذكر أن وجود حلقات R غير المحاطة على الجانب 5′ من RNA يعزز من التقطيع التبادلي عند استهداف الحمض النووي مزدوج السلسلة القصير. على…
-
لقاح نانوي يعرض RBD يعزز المناعة ضد SARS-CoV-2
2025 | المؤلف: Rang Feng وآخرون | المجلة: Journal of Nanobiotechnology | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تقدم ورقة البحث نهجًا جديدًا لتطوير اللقاحات ضد SARS-CoV-2، مع التركيز على مجال ربط المستقبلات (RBD) للفيروس، الذي أظهر مناعة منخفضة. لتعزيز الاستجابة المناعية، استخدمت الدراسة الحويصلات الغشائية الخارجية (OMVs) المشتقة من البكتيريا سالبة الجرام، مستفيدة من نظام التفاعل البيولوجي SpyTag/SpyCatcher لإنشاء لقاح نانو ‘قابس وعرض’، OMV-RBD. أظهر هذا اللقاح ملفات أمان مواتية وعزز بشكل…
-
تحوير الطفرات في مواقع التشبع لـ 500 مجال بروتين بشري
2025 | المؤلف: Antoni Beltran وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الوراثة (Genetics)في هذا القسم، يصف المؤلفون بناء مكتبة شاملة من متغيرات الأحماض الأمينية لمجالات البروتين البشري باستخدام تقنية التخليق الضخم المتوازي المستندة إلى الشرائح الدقيقة (mMPS). المكتبة، التي تُسمى Human Domainome 1، تتكون من 1,230,584 متغير عبر 1,248 مجال بروتين متنوع هيكليًا، مع تحويل كل موضع حمض أميني إلى جميع الأحماض الأمينية الأخرى الـ19. تشير نتائج…
-
FUT10 و FUT11 هما بروتينات O-فوكوزيل ترانسفيراز التي تعدل مجالات بروتين EMI
2025 | المؤلف: Huilin Hao وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: علم المناعة (Immunology)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في O-fucosylation لواجهة الألياف الدقيقة للإيلاستين (EMI) لمجموعة Multimerin-1 (MMRN1) ويحددون الفوكوزيل ترانسفيراز المسؤولة عن هذا التعديل. من خلال التحويلات المؤقتة والتحليلات الجليكوبروتينية في خلايا HEK293T، يؤكدون أن O-fucosylation يحدث في موقعين، T216 و T265، مع ظهور T216 بنسب أعلى. ومن الجدير بالذكر أن لا POFUT1 ولا POFUT2، وهما الفوكوزيل…
-
DPFunc: التنبؤ بدقة بوظيفة البروتين عبر التعلم العميق مع معلومات الهيكل الموجهة بالمجال
2025 | المؤلف: Wenkang Wang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم هذا القسم نظرة عامة على نهج جديد قائم على التعلم العميق، DPFunc، مصمم لتوقع وظائف البروتينات مع معالجة قضايا القابلية للتفسير الموجودة في الطرق الحسابية الحالية. تكمن أهمية التنبؤ بدقة بوظائف البروتينات في إمكانيته لتعزيز فهمنا للآليات البيولوجية والمساعدة في علاج الأمراض المعقدة. يستفيد DPFunc من معلومات الهيكل الموجهة من المجال لتحديد المناطق الحرجة…
-
نموذج خشن لبروتينات غير مرتبة ومتعددة المجالات
2024 | المؤلف: Fan Cao وآخرون | المجلة: Protein Science | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يناقش المؤلفون التحديات المرتبطة بتوصيف التجمعات الشكلية للبروتينات متعددة المجالات بسبب تعقيدها وديناميكياتها. يقدمون نموذجًا خشنًا يعزز من كفاءة ودقة محاكاة هذه البروتينات في المحلول. تسلط الدراسة الضوء على أهمية موضع مواقع التفاعل داخل المجالات المطوية، كاشفة أن وضع هذه المواقع في مواقع ذرات Cα يؤدي إلى تفاعلات مفرطة بين المجالات. بالمقابل،…
-
درجة الحرارة الفسيولوجية تحرك التعرف على ligand TRPM4 وفتح القنوات
2024 | المؤلف: Jinhong Hu وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الأنظمة الحسية (Sensory Systems)يتناول هذا القسم من ورقة البحث التأثير الكبير لدرجة الحرارة على هيكل ووظيفة الجزيئات الكبيرة، مع التركيز بشكل خاص على قناة الأيونات الحساسة لدرجة الحرارة TRPM4. يبرز المؤلفون أن العديد من الدراسات الفيزيائية الحيوية تُجرى عند درجات حرارة غير فسيولوجية، مما قد يؤدي إلى استنتاجات مضللة بشأن الآليات الجزيئية والتفاعلات الدوائية. من خلال المجهر الإلكتروني…
-
أدوار متنوعة لمجالات ربط المعادن وآلية نقل ATPases من النوع P الناقلة للنحاس
2024 | المؤلف: Zongxin Guo وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)تعتبر مضخات النحاس من النوع P (P1B-1) ATPases ضرورية للحفاظ على توازن النحاس الخلوي، ومع ذلك فإن الآليات الكامنة وراء حالات E1-E1P-E2P-E2 لا تزال غير مفهومة بشكل كافٍ، خاصة فيما يتعلق بوظيفة مجالات ربط المعادن الداخلية (MBDs). تدمج هذه الدراسة بين أربعة هياكل من المجهر الإلكتروني بالتبريد (cryo-EM) ومحاكاة الديناميات الجزيئية لتوضيح أدوار MBDs في…