الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: محاكاة الديناميكا الجزيئية
-
P2DFlow: نموذج توليدي لمجموعة بروتينات مع مطابقة تدفق SE(3) P2DFlow: A Protein Ensemble Generative Model with SE(3) Flow Matching
2026 | المؤلف: Yaowei Jin وآخرون | المجلة: Journal of Chemical Theory and Computation | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، نقدم P2DFlow، نموذجًا توليديًا يستفيد من مطابقة تدفق SE(3) للتنبؤ بمجموعات البروتينات الشكلية، مع التأكيد على أن الوظائف البيولوجية تحكمها مجموعة من هياكل البروتينات بدلاً من شكل مستقر واحد. من خلال دمج أولوية متخصصة مستندة إلى توقعات ESMFold والاضطرابات، جنبًا إلى جنب مع آلية طاقة تقريبية، يلتقط P2DFlow بشكل فعال التقلبات الديناميكية…
-
التصميم القائم على CADD والتقييم البيولوجي للهجائن الجديدة القائمة على الترايازول والثيازوليدينديون كعوامل مضادة للسكري CADD based designing and biological evaluation of novel triazole based thiazolidinedione coumarin hybrids as antidiabetic agent
2026 | المؤلف: Anchal Sharma وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)في هذه الدراسة، تم تخليق سلسلة من 5-(benzylidene) thiazolidine-2,4-dione وhybrids coumarin (I-1 إلى I-16) لتحديد المتطلبات الهيكلية لمثبطات α-glucosidase الفعالة. أظهرت دراسات الربط الجزيئي أن المركب I-1 أظهر أفضل تقارب ربط للأهداف مثل DPP-4 وα-glucosidase، مع استبعاد α-amylase. تم توجيه تخليق المركب I-1 من خلال رؤى من الربط الجزيئي والمحاكاة، والتي أبرزت الميزات الهيكلية الحرجة.…
-
التصميم العقلاني والتخليق والدراسات في المختبر وفي السيليكو للهجائن من البيرازول والفثالازين كمثبطات جديدة للـ α-غلوكوزيداز Rational design, synthesis, in vitro, and in-silico studies of pyrazole‑phthalazine hybrids as new α‑glucosidase inhibitors
2026 | المؤلف: M. N. A. Md. Roshan وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)تقدم هذه الورقة البحثية تصميم وتخليق وتقييم أربعة عشر هجينًا جديدًا من البيرازول-فثالازين كمثبطات لإنزيم α-غلوكوزيداز، الذي يعد حاسمًا لعملية الأيض الكربوهيدراتي وإدارة مرض السكري من النوع 2. تهدف الدراسة إلى تحديد مثبطات أكثر فعالية من الدواء الحالي أكاربوز، الذي له آثار جانبية كبيرة. أظهرت المركبات المُخَلَّقة قيم IC50 تتراوح من $13.66 \pm 0.009$ إلى…
-
ديناميات مجمع إنزيم البيروفات ديهيدروجيناز الثدييات التي تم الكشف عنها من خلال التحليل الهيكلي في الموقع Dynamics of the mammalian pyruvate dehydrogenase complex revealed by in-situ structural analysis
2026 | المؤلف: Chen Wang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الكيمياء الحيوية (Biochemistry)مجمع إنزيم البيروفات ديهيدروجيناز المتعدد (PDHc) ضروري لربط التحلل السكري بدورة حمض الستريك، مما يلعب أدوارًا مهمة في الأيض وإنتاج الطاقة وإشارات الخلايا. على الرغم من التوصيف الفردي لمكوناته، إلا أن الهيكل الكامل لـ PDHc ظل بعيد المنال، مما أعاق الفهم الشامل لتكوينه وآلياته الحفزية. تستخدم هذه الدراسة التصوير الإلكتروني بالتبريد لتوضيح العمارة في الموقع…
-
تحديد مثبطات البروتياز الرئيسية لفيروس SARS-CoV-2 الواعدة من خلال الربط الجزيئي، ومحاكاة الديناميات، وتحليل ADMET Identification of promising SARS-CoV-2 main protease inhibitor through molecular docking, dynamics simulation, and ADMET analysis
2026 | المؤلف: Ganesh Sharma وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تركز الأبحاث على تطوير عوامل علاجية تستهدف البروتياز الرئيسي (Mpro) لفيروس SARS-CoV-2، وهو إنزيم حاسم لتكاثر الفيروس. باستخدام طرق حسابية متقدمة، بما في ذلك ربط الجزيئات ومحاكاة الديناميات الجزيئية، قامت الدراسة بفحص المركبات المضادة للفيروسات من قواعد بيانات ChemDiv و PubChem. من بين المركبات التي تم تقييمها، برز المركب 4896 -4038 كأكثر المرشحين وعدًا، حيث…