الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: محاكاة ربط الجزيئات
-
دمج علم الأدوية الشبكي، التعلم الآلي، الربط الجزيئي والديناميكا الجزيئية لاستكشاف آلية وصفة تشوفينغ كينغبي في علاج البلهارسيا
2024 | المؤلف: Minglu Liu وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: علم الطفيليات (Parasitology)تبحث الدراسة في مغلي تشوفينغ كينغبي (CQD) وفعاليته في علاج داء البلهارسيا، مع التركيز على تحديد مكوناته النشطة وتوضيح آليات العمل. باستخدام مزيج من علم الأدوية الشبكي، المعلوماتية الحيوية، ربط الجزيئات، ومحاكاة الديناميات الجزيئية، حددت الدراسة المركبات الرئيسية مثل ووجونين، كيمبفيرول، لوتيولين، وكيرسيتين، التي تتفاعل مع بروتينات هامة مثل PTGS2، TNF، TGFB1، BCL2، وTP53. كانت…
-
منصة فحص افتراضية معززة بالذكاء الاصطناعي لاكتشاف الأدوية
2024 | المؤلف: Guangfeng Zhou وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)يقدم القسم نظرة عامة على طريقة جديدة تعتمد على الهيكل لفحص المركبات الافتراضية، RosettaVS، التي تم تطويرها لتعزيز دقة التنبؤ بوضعيات الربط وقوى الارتباط في اكتشاف الأدوية المبكر. تعالج هذه الطريقة قيود الأساليب الحالية من خلال نمذجة مرونة المستقبل بشكل فعال، مما يساهم في أدائها المتفوق على معايير مختلفة. يقدم المؤلفون منصة مفتوحة المصدر تستفيد…
-
تحقيقات حسابية لمثبطات محتملة لبروتين الغلاف E8 لفيروس جدري القرود من خلال الربط الجزيئي ومحاكاة الديناميات الجزيئية
2024 | المؤلف: Rohit Das وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الفيروسات (Virology)تدرس الدراسة العوامل العلاجية المحتملة ضد فيروس جدري القرود (MPXV) من خلال ربط أدوية تجارية مختلفة ومركبات مشتقة من النباتات ببروتين الغلاف E8، الذي يعد أساسياً لارتباط MPXV ومرضه. تم نمذجة هيكل البروتين بناءً على بروتين D8L لفيروس اللقاح. من بين المركبات التي تم تحليلها، أظهر البونيكالاجين قدرة ربط متفوقة تبلغ -9.1 كيلو كالوري/مول مقارنةً…
-
الإيكارين يخفف من الفشل المبكر للمبيض الناتج عن سيسبلاتين من خلال تثبيط الفيروبتوز عبر تنشيط مسار Nrf2/ARE
2024 | المؤلف: Fangfang Li وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم المناعة (Immunology)تدرس هذه الدراسة التأثيرات الواقية لـ Icariin (ICA)، وهو مضاد أكسدة طبيعي، ضد الفشل المبكر للمبيض الناتج عن السيسبلاتين (POF). يُعرف عن السيسبلاتين أنه يسبب ضررًا للمبيض، وتهدف الأبحاث إلى توضيح الآليات التي قد تخفف بها ICA من هذا التأثير. تشير النتائج إلى أن علاج ICA أدى إلى زيادة في وزن الجسم، وزن المبيض، وعدد…
-
QSAR، ADMET، دراسات الربط الجزيئي والديناميكا لمشتقات 1،2،4-ترايازين-3(2H)-ون كمثبطات للأنابيب لعلاج سرطان الثدي
2024 | المؤلف: Mohamed Moussaoui وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)تستكشف هذه الدراسة إمكانيات مشتقات 1,2,4-ترايزين-3(2H)-ون الجديدة كمثبطات للبروتين التوبولين، وهو بروتين حاسم في انقسام خلايا السرطان، بهدف تطوير علاجات أكثر فعالية لسرطان الثدي مع آثار جانبية أقل. باستخدام نهج حسابي متكامل يتضمن نمذجة العلاقة بين الهيكل والنشاط (QSAR)، وتحليل ADMET، والتصميم الجزيئي، ومحاكاة الديناميات الجزيئية، تحدد الدراسة الوصفين الرئيسيين المؤثرين على النشاط المثبط، محققة…
-
تخليق ودراسات حاسوبية لبعض الهيدروكربونات القائمة على بنزو[f]كوينولين كعوامل مضادة للورم
2024 | المؤلف: Eman A. E. El‐Helw وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)في هذه الدراسة، تم تخليق سلسلة من الهيدروكربونات المعتمدة على البنزوكوينولين من خلال تفاعل 3-كلوروبنزو[f]كوينولين-2-كاربالديهيد مع مجموعة متنوعة من النيوكليوفيلات النيتروجينية، بما في ذلك N-فينيل-3-ميثيلبيرازولون و4-أمينوأسيتوفينون. تم تقييم المركبات الناتجة، وخاصة مشتق البيرازولون (المركب 2) والسيانوإيثانوهيدرازون (المركب 5)، لنشاطها المضاد للتكاثر ضد خطوط خلايا السرطان HCT116 و MCF7. أظهرت دراسات الربط الجزيئي أن هذه المركبات…
-
إعادة تعريف المواد الحيوية السنية: تحسين مركب الراتنج السني المدفوع بتقنية الربط الجزيئي والديناميكا
2024 | المؤلف: Ravinder Saini وآخرون | المجلة: BMC Oral Health | المجال: تقويم الأسنان (Orthodontics)تبحث الدراسة في الالتصاق والأداء البيوميكانيكي لمركبات الراتنجات السنية المعتمدة على الراتنج، والتي تعتبر حاسمة في طب الأسنان الترميمي بسبب خصائصها الجمالية واللاصقة. على الرغم من مزاياها، لا تزال التحديات قائمة، مما يستدعي استخدام الربط الجزيئي ومحاكاة الديناميات لتحسين هذه المواد. تركز الدراسة على التفاعلات بين المونومرات، والحشوات، وعوامل الربط، مع تسليط الضوء بشكل خاص…
-
سينينسيتين يحمي من التهاب اللثة من خلال الارتباط بـ Bach1 مما يعزز تحلل يوبكويتين ويحسن الإجهاد التأكسدي
2024 | المؤلف: Zhiyao Yuan وآخرون | المجلة: International Journal of Oral Science | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تستكشف هذه الدراسة الإمكانات العلاجية لـ Sinensetin (Sin)، وهو فلافونويد متعدد الميثوكسي، في علاج التهاب اللثة، وهو مرض التهابي مزمن يتفاقم بسبب البايوفيلم تحت اللثة. تسلط الأبحاث الضوء على أن Sin يقلل بشكل فعال من الإجهاد التأكسدي والالتهاب في خلايا الرباط اللثوي (PDLCs) تحت ظروف التهابية. أظهرت التجارب الحية باستخدام نموذج الفئران المصابة بالتهاب اللثة…
-
توليد مركبات متعددة الأهداف من جديد باستخدام الكيمياء التوليدية العميقة
2024 | المؤلف: Brenton P. Munson وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تناقش هذه الفقرة تطوير POLYGON، وهو نهج جديد في علم الأدوية المتعددة الذي يستفيد من التعلم المعزز التوليدي لتصميم مركبات قادرة على تثبيط أهداف بروتينية متعددة. يعمل POLYGON عن طريق تضمين الفضاء الكيميائي وأخذ عينات منه بشكل تكراري لتوليد هياكل جزيئية جديدة، والتي يتم تقييمها بناءً على تأثيراتها التثبيطية المتوقعة على هدفين بروتينين، وخصائص شبيهة…
-
1,2,3-ترايازول وهجائن قاعدة شيف الكيرالية كعوامل محتملة لمكافحة السرطان: دراسات DFT، ربط جزيئي ودراسات ADME
2024 | المؤلف: Yonas Belay وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)تقدم هذه الدراسة تخليق هجن جديدة من 1،2،3-ترايازول وقواعد شيف الكيرالية (المركبات 2-6) من خلال تفاعلات تكثيف قاعدة شيف التي تشمل مكون 1،2،3-ترايازول المُعد مسبقًا وأمينات كيرالية أولية متنوعة. تم تأكيد الهياكل الكيميائية لهذه المركبات باستخدام تقنيات NMR و FTIR، وتحليل العناصر CHN. تم تقييم النشاط المضاد للسرطان للمركبات 1-6 ضد خطوط خلايا سرطان البروستاتا…