الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: مواقع الربط
-
التحكم البصري في إيقاع القلب باستخدام مثبطات قناة NaV1.5 القابلة للتبديل بالضوء
2026 | المؤلف: Shiqi Liu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)قناة الصوديوم المعتمدة على الجهد Na V 1.5 تلعب دورًا حاسمًا في الإثارة القلبية من خلال تسهيل مرحلة الاستقطاب السريع من جهد العمل القلبي (AP)، وارتباط خللها باضطرابات نظم القلب الشديدة، مما يبرز أهميتها كهدف علاجي. الكوينيدين، وهو مثبط في حالة الفتح لـ Na V 1.5، فعال في علاج اضطرابات النظم؛ ومع ذلك، فإن انخفاض…
-
توضيح آلية تفاعل سيفبودوكسيم-BSA من خلال مجموعة من الطرق الطيفية المتعددة ومحاكاة ربط الجزيئات
2026 | المؤلف: Reem N. El Gammal وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث هذه الدراسة في التفاعل الجزيئي بين سيفبودوكسيم (CFP) وألبومين مصل البقر (BSA) باستخدام مزيج من التثبيت الحسابي وطرق طيفية متنوعة. أظهرت النتائج الأولية من طيف الامتصاص UV-Vis تشكيل معقد في حالة القاعدة بين CFP وBSA. كشفت دراسات ت quenching الفلورية عن آلية quenching ثابتة، مع ثابت ارتباط ($K_b$) قدره $3.99 \times 10^4 \, \text{L}…
-
هيكل المستقبل اليتيم المرتبط بالميلاتونين، GPR50
2026 | المؤلف: Jin Woo Shin وآخرون | المجلة: Molecules and Cells | المجال: الأنظمة الصماء والذاتية (Endocrine and Autonomic Systems)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في GPR50، وهو مستقبل يت coupled بروتين يتيم (GPCR) مرتبط بمستقبلات الميلاتونين، والذي يُعتبر له دور في عمليات فسيولوجية متنوعة مثل تقدم السرطان وإشارات الأيض. باستخدام المجهر الإلكتروني بالتبريد، حددوا بنية GPR50 الخالية من اللجند بدقة 3.4 Å، كاشفين عن نشاط تكويني معتدل من خلال تفاعله مع Gα12. حدد التحليل…
-
القواعد التنظيمية في المحفزات البشرية التي تم الكشف عنها بواسطة التعلم العميق القائم على MPRA
2026 | المؤلف: Lucía Barbadilla-Martínez وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “الطرق” يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون مزيجًا من الأساليب الكمية والنوعية لجمع البيانات، مما يضمن تحليلًا شاملاً لسؤال البحث. على وجه التحديد، قاموا بتنفيذ طرق إحصائية لتقييم أهمية نتائجهم، مستخدمين اختبارات مثل اختبارات t وANOVA حيثما كان ذلك مناسبًا. شمل جمع البيانات عملية أخذ عينات منهجية، مما يضمن أن…
-
التوصيف الهيكلي والوظيفي لاستيراد ATF2 النووي يكشف عن التعرف الانتقائي على الاستيرابين-α ووجود NLS غير تقليدي يتشكل في الاتجاه المعاكس
2026 | المؤلف: Seyed Mohammad Ghafoori وآخرون | المجلة: Life Science Alliance | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في آليات الاستيراد النووي لعامل النسخ المنشط 2 (ATF2)، وهو عضو في عائلة AP-1 الفائقة المشاركة في عمليات خلوية حاسمة. تركز الدراسة على مسار الاستيراد الكلاسيكي importin-α/β1 (IMPα/β1)، كاشفة أن ATF2 يتفاعل مع عدة متماثلات IMPα، مع أقوى ارتباط لـ IMPα1. تحدد التحليلات البلورية مجموعتين أساسيتين في ATF2—الموقع 1 ($353 \text{EKRRK} 357$) والموقع…
-
عائلة جديدة من الناقلات النحاسية المعتمدة على TonB المرتبطة بوظيفة الأكسيداز التنفسي
2026 | المؤلف: M. Hachmi وآخرون | المجلة: Journal of Biological Chemistry | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)يوفر هذا القسم نظرة عامة على HAL، وهو أرشيف مفتوح متعدد التخصصات مصمم لإيداع ونشر الوثائق البحثية العلمية. يعمل كمنصة للأعمال المنشورة وغير المنشورة، مما يسهل الوصول إلى مجموعة واسعة من الأدبيات العلمية. الوثائق المؤرشفة في HAL تأتي من مصادر متنوعة، بما في ذلك المؤسسات التعليمية والبحثية في فرنسا وعلى المستوى الدولي، بالإضافة إلى المراكز…
-
المحددات الجزيئية لارتباط Smc5/6 مع تقاطعات الحمض النووي
2026 | المؤلف: Jeremy Chang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)مجمع Smc5/6 ضروري لصيانة الجينوم، حيث يتفاعل مع أشكال مختلفة من الحمض النووي، بما في ذلك الحمض النووي مزدوج الشريطة (ds) والحمض النووي أحادي الشريطة (ss). تستخدم هذه الدراسة تقنيات الجزيئات الفردية للتحقيق في ديناميات ارتباط Smc5/6 بركيزة dsDNA تحتوي على فجوة ssDNA محددة. تكشف النتائج أن Smc5/6 يرتبط بشكل تفضيلي مع الوصلات 3′ مقارنة…
-
التثبيط الذاتي بين المونومرات لـ HEXIM1 يتحكم في خصوصية ارتباط RNA 7SK وتفعيل P-TEFb
2026 | المؤلف: Yuan Yang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الفيروسات (Virology)تلعب بروتينات Hexim دورًا حاسمًا في تنظيم النسخ حقيقيات النوى من خلال احتجاز وتفعيل كيناز P-TEFb (Cdk9-CyclinT1/2) عبر مركب الريبونوكليوبروتين 7SK (RNP). يعتبر P-TEFb ضروريًا لإطلاق RNA polymerase II من التوقف القريب من المحفز، وهو أمر حيوي لكل من النسخ حقيقيات النوى وHIV-1. تتناول الدراسة الآلية الجزيئية غير المحلولة التي تتغلب من خلالها ارتباط 7SK…
-
التفاعلات المحددة بين مشتقات الفيتامين D3 المفلورة ومستقبل الفيتامين D: ميكانيكا جزيئية وحسابات مدارية جزيئية من البداية
2026 | المؤلف: Masayuki Yuguchi وآخرون | المجلة: Journal of Molecular Modeling | المجال: علم الأمراض والطب الشرعي (Pathology and Forensic Medicine)في هذه الدراسة، قام المؤلفون بالتحقيق في التفاعلات بين مشتقات فيتامين D3 (VD3) المفلورة المختلفة ومستقبل فيتامين D (VDR) لفهم affinities الربط المعززة التي لوحظت في بعض المشتقات. باستخدام ميكانيكا الجزيئات (MM) وحسابات الجزيئات الفرعية الأولية (FMO)، ركزت الأبحاث على الديستيرومرات لمشتقات VD3 بناءً على مراكزها الاستيريو C3 و C13. كشفت النتائج أن طاقات الربط…
-
تحسين تصميم روابط البروتين باستخدام RFdiffusion المستهدف بالتزاوج β
2026 | المؤلف: Isaac Sappington وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الأشعة والطب النووي والتصوير الطبي (Radiology, Nuclear Medicine and Imaging)تقدم البحث نهجًا جديدًا لتصميم هياكل البروتين التي ترتبط بفعالية بمواقع البروتين المستهدفة المحبة للماء، مع التركيز بشكل خاص على حواف خيوط البيتا. من خلال تكييف RFdiffusion، نجح المؤلفون في توليد تصميمات تشكل صفائح بيتا ممتدة متطابقة هندسيًا، حيث تكمل المجموعات القطبية على البروتينات المستهدفة مجموعات الروابط الهيدروجينية على الروابط المصممة. تم تطبيق هذه الطريقة…