الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: موقع الربط

تخليق شامل لمركبات 2α-[2-(Tetrazol-2-yl)ethyl]-1α,25-ديهيدروكسي فيتامين D3 الفلورية الجانبية والأنشطة البيولوجية الأولية

2026 | المؤلف: Fumihiro Kawagoe وآخرون | المجلة: Chemical and Pharmaceutical Bulletin | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)

في هذا البحث، تم تصميم وتخليق اثني عشر نظيراً فلورينياً لسلسلة جانبية من 2α-[2-(تترازول-2-يل)إيثيل]-1α،25-ديهيدروكسي فيتامين D3 (AH-1) لتقييم أنشطتها البيولوجية. استخدم التخليق تفاعل اقتران تروست المحفز بالبلاتين الذي يتضمن برومو-أوليفينات فلورينية من حلقة CD وسلسلة جانبية وموحد A-ring. ومن الجدير بالذكر أن بعض النظائر، وخاصة C26،27-هيكسافلورو-AH-1 (31) و24،24-ثنائي فلورو-AH-1 (34)، أظهرت زيادة ملحوظة في قوة…
بورا تربط تنشيط أورا-A والتعرف على الركيزة لـ PLK1

2026 | المؤلف: Jennifer A. Miles وآخرون | المجلة: EMBO Reports | المجال: علم الأحياء الخلوي (Cell Biology)

في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في آلية تنشيط PLK1 خلال المرحلة المتأخرة من G2، مع التأكيد على دور Aurora-A والبروتين غير المنظم داخليًا Bora. يقدمون نماذج هيكلية لمجمعات Aurora-A/Bora وAurora-A/Bora/PLK1، تم التحقق منها من خلال الطفرات المحددة للموقع، والاختبارات البيوكيميائية، وطيف الرنين المغناطيسي النووي. يظهر أن Bora يتفاعل مع الجزء N من Aurora-A، مشغلاً جيوب…
التخليق، الربط، تقييم SAR وADMET لمشتقات جديدة من البيرولوبيرازول-4،6-ديون

2026 | المؤلف: Yasser H. Zaki وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)

في هذه الدراسة، تم تخليق مشتقات جديدة من 1،6a-ديهيدروبيرولوا[3،4-c]بايرازول-4،6(3aH،5H)-ديون من خلال تفاعل بروميدات هيدرازونيل مع N-أريلمايلاميد، تلاها أكسدة لإنتاج بيرولوا[3،4-c]بايرازول-4،6(1H،5H)-ديونات. أظهرت دراسات الربط الجزيئي ضد البروتين المستهدف (PDB ID: 4N9S) أن المركبات 3c و 4c لها أعلى تقارب ربط بمقدار -7.45 و -7.31 كيلو كالوري/مول، على التوالي. شكلت هذه المركبات تفاعلات مستقرة من نوع π-كاتيون…
رؤى نظرية حول التفاعلية، والخصائص الطوبولوجية، وتفاعل كيناز OSR1 للأدوية المضادة لارتفاع ضغط الدم: دراسة قائمة على DFT والتثبيت

2026 | المؤلف: Niranjana Devi Rajendran وآخرون | المجلة: Discover Chemistry. | المجال: الكيمياء الفيزيائية والنظرية (Physical and Theoretical Chemistry)

تبحث هذه الدراسة في الخصائص الهيكلية والإلكترونية لدوائين مضادين لارتفاع ضغط الدم، هيدروكلوروثيازيد (HCTZ) وهيدروفلوميثيازيد (HFTZ)، باستخدام نظرية الكثافة الوظيفية (DFT) مع الوظيفة الهجينة B3LYP-D3(BJ)/6-311++ G(d,p). تستخدم الدراسة تحليل سطح هيرشفيلد ومخططات بصمة الأصابع لتحديد التفاعلات بين الجزيئات، بينما توضح وظيفة تحديد موضع الإلكترون (ELF) هياكل القشرة الذرية والأزواج الوحيدة، خاصة حول المراكز السالبة الشحنة.…
دراسة مخبرية تستكشف دور الميوسين في آلية ارتباط البروتين بالنكهة

2025 | المؤلف: Cristina Barallat-Pérez وآخرون | المجلة: npj Science of Food | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)

تدرس الدراسة التفاعل بين نكهات الطعام والبروتينات اللعابية، وخاصة الميوسين، الذي يلعب دورًا حيويًا في حماية الأسطح المخاطية وتعديل إطلاق الرائحة. باستخدام كروماتوغرافيا الغاز-مطيافية الكتلة (GC-MS) في نموذج في المختبر، قام الباحثون بتقييم آلية ارتباط البروتينات بالنكهات من خلال حساب عدد مواقع الارتباط ($n$) وثوابت الارتباط ($K$) لمختلف عزل البروتينات الغذائية التجارية (PIs) والمركبات الكربونية…
تثبيط إنزيمات الببتيديل أرجينين ديميناز (PAD1-4) من خلال استهداف موقع ارتباط ألوستيري يعتمد على Ca2+

2025 | المؤلف: Leslie Dakin وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المناعة (Immunology)

إن إنزيمات دياميناز الأرجينين الببتيدية (PAD1-4) هي إنزيمات تعتمد على الكالسيوم تسهل تحويل بقايا الأرجينين إلى سيترولين من خلال عملية تعرف باسم السيترولين، والتي ترتبط بمختلف الأمراض، بما في ذلك التهاب المفاصل الروماتويدي والاضطرابات التنكسية العصبية. بينما تم تطوير مثبطات انتقائية لـ PAD4، لا تزال المثبطات الأوسع لعائلة PAD بأكملها نادرة، ومحدودة أساسًا على نظائر…
تفاعلات عوامل النسخ الموجهة بواسطة الحمض النووي توسع الشيفرة التنظيمية للجينات البشرية

2025 | المؤلف: Zhiyuan Xie وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

في ال، يبرز البحث أن مجموعة صغيرة فقط من عوامل النسخ البشرية (TFs) تمتلك مجالات تنشيط نسخي قوية، حيث أن 16 فقط من عوامل النسخ المختبرة تظهر هذه الخاصية. ومن الجدير بالذكر أن العديد من هذه العوامل، مثل TCF4 و ATOH1، تتفاعل مع عوامل نسخ أخرى، مما يشير إلى أن عوامل النسخ التي تفتقر إلى…
الأساس الهيكلي لتنشيط النسخ من خلال التوظيف التعاوني لـ MntR

2025 | المؤلف: Haoyuan Shi وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)

قسم “الطرق” في ورقة البحث يحدد تصميم التجارب والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات المجمعة من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب مختبرية محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لمراقبة تأثيراتها على النتائج ذات الأهمية. شمل جمع البيانات استخدام أدوات موحدة لضمان الموثوقية والصلاحية.…
استكشاف في السيليكو لمشتقات الزانثون الطبيعية كمثبطات محتملة لتكاثر فيروس كورونا المسبب لمتلازمة التنفس الحاد الشديد 2 (SARS-CoV-2) ودخول الخلايا

2025 | المؤلف: Vincent A. Obakachi وآخرون | المجلة: Journal of Computer-Aided Molecular Design | المجال: علم السموم (Toxicology)

لقد أبرزت جائحة COVID-19 ضرورة وجود علاجات مضادة للفيروسات فعالة، خاصة ضد المتغيرات المقاومة للقاحات الناشئة. تستكشف هذه الدراسة مشتقات الزانثون الطبيعية كعوامل مثبطة محتملة لمستقبل ACE2، الذي يسهل دخول SARS-CoV-2 إلى خلايا الإنسان. حدد تحليل حسابي لـ 91 مركب زانثون من *Swertia chirayita* مرشحين، XAN71 و XAN72، اللذان أظهرا تقارب ارتباط متفوق يبلغ -70.97…
تحديد موقع ارتباط لمثبطات الجزيئات الصغيرة المستهدفة للبروتين TRPM4 البشري

2025 | المؤلف: Babatunde Ekundayo وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الأنظمة الحسية (Sensory Systems)

تبحث الدراسة في آليات ارتباط بروتين TRPM4، وهو قناة كاتيون أحادي القيمة تنشط بواسطة الكالسيوم، ويُعتقد أنها مرتبطة بمختلف الاضطرابات الجينية والقلبية الوعائية. تستخدم الدراسة المجهر الإلكتروني بالتبريد (cryo-EM) لتوضيح ثلاث هياكل لبروتين TRPM4 البشري الكامل: غير المرتبط، المرتبط بالمثبط القوي NBA (مشتق من حمض الأنثرانيل)، والمرتبط بمشتق آخر، IBA. تكشف النتائج أن كل من…