الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: DNA
-
JASPAR 2026: توسيع ملفات ارتباط عوامل النسخ ودمج نماذج التعلم العميق
2025 | المؤلف: Damla Ovek وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قاعدة بيانات JASPAR، وهي مورد مفتوح الوصول لملفات ارتباط الحمض النووي لعوامل النسخ (TFs)، قد شهدت تحديثات كبيرة في إصدارها الحادي عشر. تم توسيع مجموعة CORE بنسبة 12%، مع إضافة 306 مصفوفات تكرار موضع جديدة أو محدثة (PFMs)، بينما شهدت مجموعة UNVALIDATED زيادة بنسبة 60% مع 433 ملفًا جديدًا. يتضمن هذا التحديث دمج برنامج inMOTIFin…
-
دمج الريبونوكليوتيدات في الحمض النووي الميتوكوندري يقود إلى الالتهاب
2025 | المؤلف: Amir Bahat وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم المناعة (Immunology)قسم “طرق” يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون نهجًا كميًا، مع دمج التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لملاحظة آثارها على النتائج ذات الصلة. شمل جمع البيانات أدوات قياس موحدة لضمان الموثوقية والصلاحية، مع التركيز على…
-
تحول الميالوبيروكسيداز الكروماتين إلى مصائد خارجية للخلايا العدلية
2025 | المؤلف: Garth L. Burn وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم المناعة (Immunology)في هذا القسم، يستكشف المؤلفون دور الميالوبيروكسيداز (MPO) في تشكيل الفخاخ خارج الخلوية للعدلات (NETs)، والتي تعتبر حاسمة للاستجابات المناعية. MPO، وهو بروتين شائع في العدلات، يسهل تفكيك النوكليوزومات، مما يعزز تشكيل NET. تكشف الدراسة أن الحالة الأوليغوميرية لـ MPO تؤثر على تفاعلاته مع الحمض النووي النووي: حيث يقوم ثنائيات MPO بإزاحة الحمض النووي من…
-
تأثير مثبت للأحماض الأمينية على البروتينات والتعليق الغروي
2025 | المؤلف: Ting Mao وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في استقرار التعليقات الكولودية بواسطة الأحماض الأمينية (AAs)، مع التركيز على تأثيرات البرولين على جزيئات الذهب النانوية (AuNPs) والبروتينات المختلفة. تُظهر الدراسة أن البرولين يعزز استقرار التعليقات الكولودية من خلال تعديل مشهد الطاقة المحتملة، كما يتضح من التغيرات في معامل الفيريل الأسموزي الثاني ($B_{22}$). بشكل محدد، يزيد البرولين من حاجز الطاقة ضد التجميع…
-
استكشاف الميكروبيوم المهبلي: من الطرق التقليدية إلى تسلسل الجيل التالي الميتاجينومي – مراجعة منهجية
2025 | المؤلف: Siying Liu وآخرون | المجلة: Frontiers in Microbiology | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تؤكد الورقة البحثية على الدور الحاسم للميكروبيوم المهبلي في صحة المرأة وخصوبتها، مع تسليط الضوء على التقدم في طرق الكشف، وخاصة تسلسل الجيل التالي الميتاجينومي (mNGS). تستكشف هذه الدراسة تطبيق mNGS لتحليل الميكروبات المهبلية، مقارنةً مع تقنيات الكشف الأخرى مع مناقشة نقاط القوة والقيود الخاصة بها. تحدد العوامل التي تؤثر على جودة البيانات، مثل إجراءات…
-
منصة كشف نانوية متعددة المؤشرات مدعومة بإنزيم يوراسيل-دي إن إيه للكشف عن بروسيلة ميلتينسيس من بروسيلة spp
2025 | المؤلف: Xinggui Yang وآخرون | المجلة: BMC Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تقدم البحث بروتوكول كشف جديد “وعاء واحد”، يسمى mMCUDA، لتحديد *Brucella melitensis* باستخدام تضخيم متعدد التقاطع المتعدد (MCDA) مع مساعدة dUTP من اليوراسيل-DNA-غليكوزيلز (UDGase) واختبار تدفق جانبي لجزيئات الذهب (AuNPs-LFA) كجهاز استشعار حيوي. يستخدم الاختبار مجموعتين من بادئات MCDA تستهدف جينات *bcsp31* و*BMEII0466*، مصممة خصيصًا للكشف عن كل من جنس *Brucella* ونوع *B. melitensis*. تم…
-
تقييم القوة التمثيلية لنماذج اللغة المعتمدة على الحمض النووي المدربة مسبقًا في علم الجينوم التنظيمي
2025 | المؤلف: Ziqi Tang وآخرون | المجلة: Genome biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم ظهور نماذج اللغة الجينومية (gLMs) طريقة جديدة وغير خاضعة للإشراف لتعلم الأنماط التنظيمية الجينية في الجينوم غير المشفر، متجاوزًا الحاجة إلى تسميات النشاط الوظيفي من البيانات التجريبية. على الرغم من الدراسات السابقة التي تشير إلى أن نماذج gLM المدربة مسبقًا يمكن أن تعزز الأداء التنبؤي في علم الجينوم التنظيمي، فإن هذا البحث يقيم قدرتها…
-
الإرينوتيكان يخفف مقاومة العلاج الكيميائي للأنثراسيكلينات من خلال تثبيط تعديل BLM بواسطة AARS1 وإصلاح الاقتران المتماثل
2025 | المؤلف: Xinyuan Li وآخرون | المجلة: Signal Transduction and Targeted Therapy | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تشكل مقاومة العلاج الكيميائي تحديًا كبيرًا في علاج السرطان، حيث تلعب إعادة البرمجة الأيضية والوراثية أدوارًا حاسمة، على الرغم من أن آلياتها لا تزال غير واضحة إلى حد كبير. تحدد هذه الدراسة أن اللاكتات المستحثة باللاكتيل هي عامل رئيسي في تعزيز مقاومة العلاج الكيميائي للأنتراسيكلينات من خلال تعديل إصلاح إعادة التركيب المتماثل (HR). من خلال…
-
تثبيط إنزيمات إزالة الأسيتيل من الهيستون 3 يخفف من التهاب الجلد الصدفي الناتج عن إميكيمود من خلال استهداف إشارة cGAS-STING في الكيراتينوسيت
2025 | المؤلف: Chong Zeng وآخرون | المجلة: Journal of Translational Medicine | المجال: علم المناعة (Immunology)تبحث هذه الدراسة في دور هيستون ديستيلز 3 (HDAC3) في مسببات مرض الصدفية، وهو مرض جلدي التهابي مزمن يتميز بفرط تكاثر الكيراتينوسيت وتنشيط المناعة. باستخدام تحليل المعلومات الحيوية من قاعدة بيانات التعبير الجيني (GEO)، تكشف الدراسة أن تعبير HDAC3 مرتفع بشكل ملحوظ في آفات الصدفية من المرضى وكذلك في نماذج المرض في المختبر وفي الجسم…
-
الالتهاب العصبي المرتبط بـ DNA الفيروسي المستمر في دماغ الأشخاص الذين تم قمعهم فيروسياً المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية
2025 | المؤلف: Sarah J. Byrnes وآخرون | المجلة: Frontiers in Immunology | المجال: علم الفيروسات (Virology)تستكشف هذه الدراسة حالة تنشيط الخلايا في أدمغة الأشخاص المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية (PWH) الذين تم كبت الفيروس لديهم (VS) من خلال العلاج المضاد للفيروسات القهري (ART). على الرغم من كبت الفيروس بشكل فعال، فإن حوالي 20% من الأشخاص المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية يطورون اضطرابات عصبية معرفية مرتبطة بالفيروس. باستخدام تصوير المناعية المتعددة،…