الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: RNA-Seq

تسلسل RNA طويل القراءة عالي الدقة يعزز التشخيصات السريرية في الاضطرابات النادرة

2026 | المؤلف: Carolina Jaramillo Oquendo وآخرون | المجلة: European Journal of Human Genetics | المجال: علم الوراثة (Genetics)

تدرس الدراسة فعالية تسلسل RNA طويل القراءة من PacBio (LRS) في الكشف عن أحداث التقطيع المرضية في الاضطرابات النادرة، خاصة بالمقارنة مع تسلسل RNA قصير القراءة (RNAseq). غالبًا ما تظل المتغيرات التي تعطل التقطيع، والتي تُعتبر مساهمات هامة في المرض، غير مكتشفة بسبب القيود في طرق التسلسل الحالية. شملت الأبحاث 25 مشاركًا من المملكة المتحدة…
يكشف تسلسل فيروس نقص المناعة البشرية عن اختلافات في التعبير الجيني بين خلايا فيروس نقص المناعة البشرية المفرطة النشاط والمكبوحة

2026 | المؤلف: J. Frouard وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

قسم “طرق” يوضح الأساليب التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون مجموعة من التقنيات الكمية والنوعية لجمع البيانات، مما يضمن تحليلًا شاملاً لأسئلة البحث. شملت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، ونمذجة إحصائية، ومحاكاة، تم تصميمها لاختبار الفرضيات التي تم صياغتها في المراحل الأولية من البحث. شمل جمع البيانات عملية عينة منهجية، حيث تم اختيار المشاركين بناءً…
الآلية التي تنظم السمية الخلوية لخلايا T γδ المنشطة بواسطة مستضد مقاوم للحرارة من المتفطرة السلية بناءً على تحليل RNA-seq

2026 | المؤلف: Yamin Song وآخرون | المجلة: Frontiers in Immunology | المجال: علم المناعة (Immunology)

تبحث الدراسة في دور مستضد Mtb المقاوم للحرارة (Mtb-HAg) في تنشيط خلايا T γδ، التي تعتبر حاسمة للاستجابة المناعية ضد السل (TB) الناجم عن المتفطرة السلية (Mtb). تبرز الدراسة أن خلايا T γδ، عند تنشيطها بواسطة Mtb-HAg من خلال عضو عائلة بوتيروفيلين 3 A1 (BTN3A1)، تظهر زيادة في إنتاج السيتوكينات والسمية الخلوية. باستخدام تحليل RNA-Seq،…
تقييم تباين الورم باستخدام تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq): التطبيقات في سرطان الرئة للتشخيص والعلاج

2026 | المؤلف: Cecilia Bica وآخرون | المجلة: Frontiers in Immunology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدم في تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة (scRNA-seq) وتطبيقاته في فهم بيولوجيا الأورام، وخاصة في سرطان الرئة. يبرز المؤلفون كيف يمكّن scRNA-seq من استكشاف التباين الجيني، والتفاعلات الخلوية، وبيئة الورم (TME) بدقة غير مسبوقة، وهو ما لا يمكن تحقيقه مع تسلسل RNA الكلي. تتيح هذه التقنية تحديد مجموعات…
تحسين إعادة بناء الإمكانات التنموية للخلايا الفردية باستخدام CytoTRACE 2

2025 | المؤلف: Minji Kang وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

في هذا القسم، يوضح المؤلفون المنهجيات المستخدمة لمقارنة CytoTRACE 2 مع مجموعة متنوعة من أساليب التعلم الآلي المراقب لتوقع نوع الخلية واستنتاج الإمكانات التنموية. قاموا بتقييم CytoTRACE 2 جنبًا إلى جنب مع ثلاث طرق متخصصة في توضيح الخلايا المفردة (scPred وSingleCellNet وscmap) وخمسة مصنفات عامة. شمل التقييم التدريب والاختبار عبر أربع طيات، بما في ذلك…
تقييم منهجي لمنصات النسخ الجزيئي الفرعي عالية الإنتاجية عبر الأورام البشرية

2025 | المؤلف: Pengfei Ren وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

أدت التطورات الأخيرة في علم النسخ الجزيئي المكاني إلى تحسين الدقة والإنتاجية، مما يستلزم تقييمًا منهجيًا لهذه التقنيات. تقيم هذه الدراسة بيانات النسخ الجزيئي المكاني التي تم إنشاؤها من مقاطع الأنسجة المتسلسلة من عينات سرطان الغدة الدرقية، وسرطان الكبد، وسرطان المبيض عبر أربعة منصات عالية الإنتاجية: Stereo-seq v1.3، Visium HD FFPE، CosMx 6K، وXenium 5K.…
أطلس متكامل للخلايا الفردية لللويحات الشريانية البشرية

2025 | المؤلف: Korbinian Traeuble وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تصلب الشرايين، وهو سبب رئيسي لأمراض القلب والأوعية الدموية، يتضمن تراكم الدهون والالتهاب المزمن في الشرايين، مما يؤدي إلى تكوين اللويحات واحتمالية تمزقها. على الرغم من التقدم في علم النسخ الجيني على مستوى الخلية الواحدة (scRNA-seq)، لا تزال الآليات المناعية والتحولات الهيكلية للخلايا التي تدفع تقدم اللويحات غير مفهومة بشكل كافٍ. غالبًا ما تفتقر مجموعات…
تحليل RNA-seq يحدد الجينات الرئيسية التي تعزز قوة الحافر لتحمل السباقات بدون حوافر في الخيول من سلالة ستاندردبريد

2025 | المؤلف: Doreen Schwochow وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: فرسي (Equine)

تبحث الدراسة في الأساس الجيني لقوة الحافر في الخيول من نوع ستاندردبريد القادرة على السباق بدون حوافر، وهي ممارسة شائعة في صناعة سباقات الحبال السويدية. يعتمد المدربون غالبًا على الخبرة بدلاً من القياسات الموضوعية لتحديد ملاءمة الحصان للسباق بدون حوافر، مما قد يؤدي إلى مخاوف تتعلق بالرفاهية بسبب تآكل الحافر المفرط. لتقديم تقييم موضوعي، استخدمت…
كشف تحليل تسلسل RNA للخلايا الفردية عن إعادة تشكيل مثبطة للمناعة للماكروفاجات المرتبطة بالورم بوساطة محور MIF-CD74 في سرطان المعدة

2025 | المؤلف: Weiwei Liu وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم المناعة (Immunology)

تقدم هذه الدراسة تحليلًا مفصلًا لخلايا البلعمة المرتبطة بالورم (TAMs) في سرطان المعدة (GC) من خلال تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة (scRNAseq) لـ 75,743 خلية من 11 نسيجًا سرطانيًا. حدد الباحثون أربع مجموعات فرعية متميزة من TAM – TAM-APOE وTAM-IDO1 وTAM-SKAP1 وTAM-POLB – كل منها يتميز بتوقيعات وظيفية فريدة. ومن الجدير بالذكر أن مجموعة…
تطوير نموذج توقع تنبؤي قائم على نمط الجزيئات المرتبطة بالضرر لسرطان القولون والمستقيم باستخدام تحليل RNA-seq الكمي

2025 | المؤلف: Yang Wu وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)

تقدم هذه الدراسة نموذج خطر تنبؤي لمرضى سرطان القولون والمستقيم (CRC) استنادًا إلى أنماط الجزيئات المرتبطة بالضرر (DAMPs). باستخدام بيانات من أطلس جينوم السرطان (TCGA) وcBioportal، قام الباحثون بحساب درجة DAMP باستخدام طريقة “ssGSEA”. وقد حددوا الجينات المعبر عنها بشكل مختلف (DEGs) من خلال حزمة “limma” واستخدموا تحليل الانحدار لاسو كوكس عبر حزمة “glmnet” لضغط…