الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: RNA-Seq

الآلية التي تنظم السمية الخلوية لخلايا T γδ المنشطة بواسطة مستضد مقاوم للحرارة من المتفطرة السلية بناءً على تحليل RNA-seq

2026 | المؤلف: Yamin Song وآخرون | المجلة: Frontiers in Immunology | المجال: علم المناعة (Immunology)

تبحث الدراسة في دور مستضد Mtb المقاوم للحرارة (Mtb-HAg) في تنشيط خلايا T γδ، التي تعتبر حاسمة للاستجابة المناعية ضد السل (TB) الناجم عن المتفطرة السلية (Mtb). تبرز الدراسة أن خلايا T γδ، عند تنشيطها بواسطة Mtb-HAg من خلال عضو عائلة بوتيروفيلين 3 A1 (BTN3A1)، تظهر زيادة في إنتاج السيتوكينات والسمية الخلوية. باستخدام تحليل RNA-Seq،…
تقييم تباين الورم باستخدام تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq): التطبيقات في سرطان الرئة للتشخيص والعلاج

2026 | المؤلف: Cecilia Bica وآخرون | المجلة: Frontiers in Immunology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدم في تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة (scRNA-seq) وتطبيقاته في فهم بيولوجيا الأورام، وخاصة في سرطان الرئة. يبرز المؤلفون كيف يمكّن scRNA-seq من استكشاف التباين الجيني، والتفاعلات الخلوية، وبيئة الورم (TME) بدقة غير مسبوقة، وهو ما لا يمكن تحقيقه مع تسلسل RNA الكلي. تتيح هذه التقنية تحديد مجموعات…
تحسين إعادة بناء الإمكانات التنموية للخلايا الفردية باستخدام CytoTRACE 2

2025 | المؤلف: Minji Kang وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

في هذا القسم، يوضح المؤلفون المنهجيات المستخدمة لمقارنة CytoTRACE 2 مع مجموعة متنوعة من أساليب التعلم الآلي المراقب لتوقع نوع الخلية واستنتاج الإمكانات التنموية. قاموا بتقييم CytoTRACE 2 جنبًا إلى جنب مع ثلاث طرق متخصصة في توضيح الخلايا المفردة (scPred وSingleCellNet وscmap) وخمسة مصنفات عامة. شمل التقييم التدريب والاختبار عبر أربع طيات، بما في ذلك…
تقييم منهجي لمنصات النسخ الجزيئي الفرعي عالية الإنتاجية عبر الأورام البشرية

2025 | المؤلف: Pengfei Ren وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

أدت التطورات الأخيرة في علم النسخ الجزيئي المكاني إلى تحسين الدقة والإنتاجية، مما يستلزم تقييمًا منهجيًا لهذه التقنيات. تقيم هذه الدراسة بيانات النسخ الجزيئي المكاني التي تم إنشاؤها من مقاطع الأنسجة المتسلسلة من عينات سرطان الغدة الدرقية، وسرطان الكبد، وسرطان المبيض عبر أربعة منصات عالية الإنتاجية: Stereo-seq v1.3، Visium HD FFPE، CosMx 6K، وXenium 5K.…
أطلس متكامل للخلايا الفردية لللويحات الشريانية البشرية

2025 | المؤلف: Korbinian Traeuble وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تصلب الشرايين، وهو سبب رئيسي لأمراض القلب والأوعية الدموية، يتضمن تراكم الدهون والالتهاب المزمن في الشرايين، مما يؤدي إلى تكوين اللويحات واحتمالية تمزقها. على الرغم من التقدم في علم النسخ الجيني على مستوى الخلية الواحدة (scRNA-seq)، لا تزال الآليات المناعية والتحولات الهيكلية للخلايا التي تدفع تقدم اللويحات غير مفهومة بشكل كافٍ. غالبًا ما تفتقر مجموعات…
تحليل RNA-seq يحدد الجينات الرئيسية التي تعزز قوة الحافر لتحمل السباقات بدون حوافر في الخيول من سلالة ستاندردبريد

2025 | المؤلف: Doreen Schwochow وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: فرسي (Equine)

تبحث الدراسة في الأساس الجيني لقوة الحافر في الخيول من نوع ستاندردبريد القادرة على السباق بدون حوافر، وهي ممارسة شائعة في صناعة سباقات الحبال السويدية. يعتمد المدربون غالبًا على الخبرة بدلاً من القياسات الموضوعية لتحديد ملاءمة الحصان للسباق بدون حوافر، مما قد يؤدي إلى مخاوف تتعلق بالرفاهية بسبب تآكل الحافر المفرط. لتقديم تقييم موضوعي، استخدمت…
كشف تحليل تسلسل RNA للخلايا الفردية عن إعادة تشكيل مثبطة للمناعة للماكروفاجات المرتبطة بالورم بوساطة محور MIF-CD74 في سرطان المعدة

2025 | المؤلف: Weiwei Liu وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم المناعة (Immunology)

تقدم هذه الدراسة تحليلًا مفصلًا لخلايا البلعمة المرتبطة بالورم (TAMs) في سرطان المعدة (GC) من خلال تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة (scRNAseq) لـ 75,743 خلية من 11 نسيجًا سرطانيًا. حدد الباحثون أربع مجموعات فرعية متميزة من TAM – TAM-APOE وTAM-IDO1 وTAM-SKAP1 وTAM-POLB – كل منها يتميز بتوقيعات وظيفية فريدة. ومن الجدير بالذكر أن مجموعة…
تقييم نماذج خلايا الأساس لتوقع RNA-seq بعد الاضطراب

2025 | المؤلف: Gerold Csendes وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

في هذا القسم، يؤكد المؤلفون على الحاجة الملحة للتنبؤات الدقيقة للاستجابات الخلوية للت perturbations لتعزيز فهمنا لسلوك الخلايا في حالات مختلفة. يشيرون إلى ندرة بيانات الاضطراب مقارنة ببيانات الخلايا الأساسية، مما أدى إلى تطوير نماذج خلوية أساسية تستخدم بيانات التعبير الجيني على مستوى الخلية الواحدة على نطاق واسع. هذه النماذج، بما في ذلك scGPT و…
تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة يكشف عن اختلافات جنسية في التركيب تحت الخلوي ونشاط شبكة تنظيم الجينات المرتبطة باللويحات السباتية البشرية

2025 | المؤلف: Katyayani Sukhavasi وآخرون | المجلة: Nature Cardiovascular Research | المجال: علم المناعة (Immunology)

يتناول هذا القسم من ورقة البحث النتائج المستخلصة من دراسة تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة لـ 7,690 خلية من لويحات الشريان السباتي البشري، كاشفًا عن اختلافات ملحوظة بين الجنسين في التركيب تحت الخلوي ونشاط شبكة تنظيم الجينات (GRN) المرتبطة بتضيق الشريان السباتي. بينما لم تختلف الأنواع الرئيسية من الخلايا، بما في ذلك خلايا العضلات…
تصفية الخلايا ذات المحتوى الميتوكوندري العالي تستنفد تجمعات الخلايا الخبيثة المتغيرة الأيضية القابلة للحياة في دراسات الخلايا المفردة للسرطان

2025 | المؤلف: Josephine Yates وآخرون | المجلة: Genome biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تبحث ورقة البحث في تداعيات ممارسات التصفية في تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq) للخلايا الخبيثة، مع التركيز بشكل خاص على نسبة عدد RNA الميتوكوندريا (pctMT). قد تستبعد عتبات التصفية التقليدية، التي تم تحديدها من دراسات على الأنسجة الصحية، عن غير قصد الخلايا الخبيثة التي تظهر نسبة أعلى من pctMT الأساسية بسبب خصائصها البيولوجية الفطرية. من…