الأبحاث ضمن الموضوع : طرق اكتشاف الأدوية الحاسوبية
-
التعلم التبايني المدرك للهيكل مع تمثيلات ربط دقيقة لاكتشاف الأدوية
2026 | المؤلف: Jing Lan وآخرون | المجلة: ICASSP 2026 – 2026 IEEE International Conference on Acoustics, Speech and Signal Processing (ICASSP) | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم هذه الدراسة إطار عمل جديد قائم على التسلسل لتوقع تفاعل الأدوية مع الأهداف (DTI) الذي يدمج الأولويات الهيكلية في تمثيلات البروتين، مما يعزز قابلية التوسع في علم الأدوية الحاسوبي. يظهر النموذج أداءً متفوقًا على مجموعات بيانات Human وBioS-NAP ويظل تنافسيًا على BindingDB. في مهام الفحص الافتراضي، يتفوق بشكل كبير على الطرق السابقة في مجموعة…
-
الطبيعة تلتقي بالآلة: نهضة الذكاء الاصطناعي في اكتشاف الأدوية من المنتجات الطبيعية
2026 | المؤلف: Rajesh Muthuraj وآخرون | المجلة: Natural Products and Bioprospecting | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تسلط هذه المراجعة الضوء على الدور الحاسم للمنتجات الطبيعية (NPs) في اكتشاف الأدوية، مشيرة إلى أهميتها التاريخية في تطوير العلاجات مثل باكليتاكسيل وأرتيميسينين. على الرغم من أهميتها، فإن اكتشاف المنتجات الطبيعية قد تراجع بسبب التحديات مثل التعقيد الهيكلي، وانخفاض العائد الحيوي النشط، وهيمنة الكيمياء الاصطناعية. يجادل المؤلفون بأن الذكاء الاصطناعي (AI) يمكن أن يعالج هذه…
-
توجيه الذكاء الاصطناعي للتصميم التنافسي للفحص الافتراضي وتوقع فعالية المركبات
2026 | المؤلف: Manon Mirgaux وآخرون | المجلة: npj Drug Discovery. | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تتناول الورقة البحثية التأثير التحويلي لتعلم الآلة، وخاصة طرق التداخل القائم على إزالة الضوضاء مثل AlphaFold3 و Boltz-1/2، على توقع بنية البروتين وتفاعلاته في اكتشاف الأدوية. يقدم المؤلفون نهجًا جديدًا يسمى التداخل التنافسي الزوجي، والذي يصنف الجزيئات المرشحة بناءً على تقاربها النسبي مع هدف بروتيني. تم اختبار هذه الطريقة على 17 نظامًا مرجعيًا للبروتين، مما…
-
دمج الذكاء الاصطناعي والتنظيم اليدوي لتعزيز تعليقات الاختبار الحيوي في ChEMBL
2026 | المؤلف: Ines Šmit وآخرون | المجلة: Journal of Cheminformatics | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تتناول ورقة البحث التقدمات في التعليق وتصنيف الاختبارات الحيوية داخل قاعدة بيانات ChEMBL، مع التأكيد على أهمية توحيد بيانات الاختبار لتعزيز فائدتها في الكيمياء المعلوماتية وتطبيقات التعلم الآلي. يوضح المؤلفون جهودهم لتحسين تعليقات الاختبارات الحيوية من خلال مزيج من الترتيب اليدوي والتقنيات المدفوعة بالذكاء الاصطناعي، بما في ذلك تقديم نموذج “وصف اختبار مثالي”. يستخدمون معالجة…
-
الأساليب الحسابية المستندة إلى IUPAC لتحديد معززات وظيفة الجزيئات الحيوية الصغيرة: دراسة حالة لمثبطات الفوسفاتيديل دنا التيروسيل البشري 1 (TDP1)
2026 | المؤلف: Mariya L. Ivanova وآخرون | المجلة: Computers in Biology and Medicine | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم هذه الورقة عدة طرق حسابية لإثبات المفهوم (PoC) تهدف إلى مساعدة الباحثين في الكيمياء الحيوية في تسريع عملهم من خلال استراتيجيات فعالة من حيث التكلفة. التركيز الأساسي هو على تحديد المجموعات الوظيفية أو الشظايا في الجزيئات الحيوية الصغيرة التي تثبط الفوسفاتاز 1 (TDP1) لدى البشر. تستخدم الدراسة تقسيم أسماء IUPAC لإنشاء ميزات وتستكشف قابلية…
-
دمج التعلم الآلي والنمذجة القائمة على الفيزياء لتصميم تنبؤي للنانومركبات المحملة بالجمسيتابين
2026 | المؤلف: Abbas Rahdar وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم هذه الدراسة إطار عمل جديد لتعلم الآلة يهدف إلى التنبؤ بكفاءة التحميل (LE) وكفاءة التغطية (EE) في النانو مركبات المحملة بالجمسيتابين، مع معالجة قيود الطرق التجريبية التقليدية. باستخدام مجموعة بيانات تتكون من 59 تركيبة تجريبية مدعومة بـ 200 نقطة بيانات تركيبية مستندة إلى الفيزياء، قامت الدراسة بتدريب خوارزميات تعلم آلة متنوعة. ومن الجدير بالذكر…
-
نماذج حسابية قائمة على الذكاء الاصطناعي/تعلم الآلة لتوقع السمية
2026 | المؤلف: Sushmita Barua وآخرون | المجلة: Environmental Science and Pollution Research | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تتناول المراجعة الأهمية المتزايدة للنماذج الحسابية، وخاصة الذكاء الاصطناعي وتعلم الآلة (AI/ML)، في توقع السمية وتقييم سلامة المواد الكيميائية، مدفوعة بالحاجة إلى تقليل اختبار الحيوانات. وتؤكد على دور منهجيات متنوعة، بما في ذلك الوصف الجزيئي، ونماذج العلاقة بين الهيكل والنشاط الكمي (QSAR)، والذكاء الاصطناعي القابل للتفسير، في تعزيز تحديد وتحليل السمية الكيميائية عبر نقاط بيولوجية…
-
تقييم أدوات الربط الجزيئي: فهم اكتشاف وتصميم الأدوية
2025 | المؤلف: Harendar Kumar Nivatya وآخرون | المجلة: Future Journal of Pharmaceutical Sciences | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم هذه القسم نظرة عامة على أهمية الذكاء الاصطناعي والأساليب الحسابية في اكتشاف الأدوية، مع التركيز على دور الربط الجزيئي في تحسين عملية تصميم الأدوية. يبرز أهمية إدارة الموارد مثل الوقت والتكلفة والأثر البيئي في التكنولوجيا الحيوية الصيدلانية. توضح الدراسة جوانب مختلفة من الربط الجزيئي، بما في ذلك التصنيفات والنماذج والتقنيات وتوليد الوضعيات ووظائف التقييم،…
-
التعلم الآلي يتنبأ بملفات إطلاق الأدوية ومعلمات الحركة بناءً على تركيبات الأقراص
2025 | المؤلف: Chrystalla Protopapa وآخرون | المجلة: The AAPS Journal | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تدرس الدراسة تطبيق تقنيات التعلم الآلي (ML) لتعزيز عملية تحسين التركيب في تصنيع الأشكال الصلبة عن طريق الضغط المباشر (DC). من خلال إنتاج 377 تركيبة وقياس ملفات إطلاق الدواء الخاصة بها تحت ظروف الذوبان الديناميكية على مدى 480 دقيقة، كان هدف الباحثين هو توقع هذه الملفات باستخدام طرق ML متنوعة. من بين التقنيات الست التي…
-
توقع تفاعل الأدوية مع الأهداف المعتمد على التعلم العميق
2025 | المؤلف: Yanpeng Zhao وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)في هذا القسم، يوضح المؤلفون المنهجيات المستخدمة لمقارنة نماذج مختلفة في توقع تفاعل الأدوية مع الأهداف (DTI) باستخدام مجموعات بيانات من DrugBank وDavis وKIBA. تم إعادة تدريب كل نموذج وضبطه بناءً على المعلمات من مستودعات GitHub الخاصة بهم، مع متوسط النتائج على خمسة تجارب متكررة لضمان موثوقية إحصائية. تشمل النماذج البارزة DeepConv-DTI، الذي يستخدم الشبكات…