الأبحاث في مجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)
-
الهندسة المتسارعة للإنزيمات بواسطة التعبير الخالي من الخلايا الموجه بتعلم الآلة
Accelerated enzyme engineering by machine-learning guided cell-free expression2025 | المؤلف: Grant M. Landwehr وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم ورقة البحث منصة جديدة موجهة بواسطة التعلم الآلي (ML) تهدف إلى التغلب على قيود هندسة الإنزيم التقليدية، خاصة في توليد مجموعات بيانات واسعة من علاقات التسلسل-الوظيفة للتصميم التنبؤي. تدمج هذه المنصة تجميع الحمض النووي الخالي من الخلايا، والتعبير الجيني الخالي من الخلايا، والاختبارات الوظيفية لرسم خرائط فعالة لمشاهد اللياقة عبر مساحة تسلسل البروتين، مما…
-
أكرمانسيا موكينيفيلا ومستقلبها حمض البروبيونيك يحافظان على تقسيم الميتوكوندريا العصبية وتوازن الالتهام الذاتي خلال عملية مرض الزهايمر المرضية عبر GPR41 و GPR43
Akkermansia muciniphila and its metabolite propionic acid maintains neuronal mitochondrial division and autophagy homeostasis during Alzheimer’s disease pathologic process via GPR41 and GPR432025 | المؤلف: Zifan Wang وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث ورقة البحث في العلاقة بين الأحماض الدهنية قصيرة السلسلة (SCFAs)، وبشكل خاص حمض البروبيونيك، ومرض الزهايمر (AD)، مع تسليط الضوء على دور خلل الميتوكوندريا في مسببات المرض. تحدد الدراسة اختلافات كبيرة في مستويات SCFA في الدم والبراز وتكوين الميكروبيوتا بين الأفراد الأصحاء ومرضى AD، مشيرة إلى انخفاض في كل من وفرة Akkermansia muciniphila ومستويات…
-
استرجاع الكيانات السريرية المعززة لاستخراج المعلومات السريرية
Clinical entity augmented retrieval for clinical information extraction2025 | المؤلف: Iván López وآخرون | المجلة: npj Digital Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم هذا القسم نظرة عامة على خط أنابيب جديد يسمى استرجاع معزز بالجيل (RAG) يُعرف باسم استرجاع الكيانات السريرية المعزز (CLEAR)، مصمم لتعزيز استخراج المعلومات من الملاحظات السريرية من خلال استخدام الكيانات السريرية بدلاً من الاعتماد فقط على التضمينات. تقارن الدراسة CLEAR بأساليب RAG التقليدية المعتمدة على التضمينات والأساليب الكاملة للملاحظات في استخراج 18 متغيرًا…
-
تصوير الكريو العنصري يكشف عن تراكم الصوديوم الفجوي المعتمد على SOS1
Elemental cryo-imaging reveals SOS1-dependent vacuolar sodium accumulation2025 | المؤلف: Priya Ramakrishna وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يوضح المؤلفون المواد النباتية المستخدمة في تجاربهم، مع التركيز على نوع الإيكوتيب كولومبيا-0 (Col-0) من نبات الأرابيدوبسيس ثاليانا، الذي تم تحديده كنوع بري (WT)، والطفرات الحساسة للملح 1 (sos1) المستمدة من خلفية Col-0 gl-1. تم تحديد الأليل sos1-1 من خلال عملية فحص باستخدام الإيثيل ميثان سلفونات. تم إدخال تركيبات متنوعة في الطفرة…
-
الاستخدام الانتقائي للبوليسكاريدات الطبية بواسطة أنواع بكتيرويدس وبارابكتيرويدس في أمعاء الإنسان
Selective utilization of medicinal polysaccharides by human gut Bacteroides and Parabacteroides species2025 | المؤلف: Zepeng Qu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تستكشف الدراسة استخدام 20 بوليسكاريد طبي بواسطة 28 نوعًا من بكتيريا الأمعاء البشرية، تحديدًا بكتيرويدس وبارابكتيرويدس، والتي تعتبر حيوية لصحة الإنسان. تكشف النتائج عن تباين كبير في استجابات النمو بين الأنواع البكتيرية المختلفة والبوليسكاريدات. ومن الجدير بالذكر أن بوليسكاريدات الجينسنغ دعمت نمو عدة أنواع، بينما عززت بوليسكاريدات دندروبيوم بشكل خاص نمو بكتيرويدس يونيكوميس. يُعزى هذا…
-
عامل النسخ في الأرز bHLH25 يمنح مقاومة لعدة أمراض من خلال استشعار H2O2
Rice transcription factor bHLH25 confers resistance to multiple diseases by sensing H2O22025 | المؤلف: Haicheng Liao وآخرون | المجلة: Cell Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في دور بيروكسيد الهيدروجين (H₂O₂) كجزيء إشارة في المناعة الفطرية للكائنات حقيقية النواة، مع التركيز على عامل النسخ في الأرز bHLH25. تكشف الدراسة أن bHLH25 يستشعر مباشرة H₂O₂، الذي يتم إنتاجه استجابةً لهجمات مسببات الأمراض. على وجه التحديد، يقوم H₂O₂ بأكسدة bHLH25 عند الميثيونين 256، مما يؤدي إلى كبت تعبير miR397b وتفعيل تخليق…
-
حماية تقدم مرض الزهايمر بواسطة كوكتيل بروبيوتيك من أصل بشري
Protection of Alzheimer’s disease progression by a human-origin probiotics cocktail2025 | المؤلف: Santosh Kumar Prajapati وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة دور الشذوذات في الميكروبيوم، أو اختلال التوازن الميكروبي، في تقدم مرض الزهايمر (AD) وتقييم الإمكانات العلاجية لمزيج بروبيوتيك في نموذج الفئران APP/PS1 المخصص. تم إعطاء المزيج، الذي يتكون من 5 سلالات من Lactobacillus و5 سلالات من Enterococcus المعزولة من ميكروبيوم أمعاء الرضع، بجرعة قدرها (1 times 10^{11}) CFU يوميًا لمدة 16 أسبوعًا. أظهرت…
-
الديناميات البيئية لعائلة الإشريكية في ميكروبيوم الأمعاء البشرية عبر السكان العالميين
Ecological dynamics of Enterobacteriaceae in the human gut microbiome across global populations2025 | المؤلف: Qi Yin وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في الديناميات البيئية لبكتيريا الأمعاء من عائلة Enterobacteriaceae، والتي تُعتبر مساهمًا مهمًا في العدوى الانتهازية على مستوى العالم. باستخدام مجموعة بيانات شاملة تضم 12,238 ميتاجينوم بشري من 45 دولة، تستخدم الدراسة تقنيات التعلم الآلي لتحديد بصمة ميكروبيوم الأمعاء المتسقة المرتبطة باستعمار Enterobacteriaceae عبر حالات صحية ومناطق جغرافية مختلفة. تصنف التحليلات 172 نوعًا ميكروبيًا…
-
تتطلب عملية اندماج الميتوكوندريا وجود الأكتين المرتبط بالميتوكوندريا والشبكة الإندوبلازمية
Mitochondria- and ER-associated actin are required for mitochondrial fusion2025 | المؤلف: Priya Gatti وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “الطرق” يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون نهجًا كميًا، حيث تم استخدام التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لملاحظة آثارها على النتائج ذات الاهتمام. شمل جمع البيانات استخدام أدوات موحدة لضمان الموثوقية والصلاحية، مع التركيز…